Haplogrupo D (ADN-Y)

En genética humana, el haplogrupo D (CTS3946) es un haplogrupo del cromosoma Y humano típico del Extremo Oriente, especialmente frecuente en el Tíbet, en el archipiélago del Japón^[1] y en las islas de Andamán (al sudeste de la India),^[2] y esporádicamente en África, Asia Occidental y Filipinas.

Mapa de distribución del haplogrupo D (M174).

Un estudio reciente (Haber et al.2019) consideró varias posibilidades para el origen del haplogrupo D (CTS3946), incluyendo un origen asiático occidental y uno africano, finalmente el estudio se inclinó a favor de un origen africano y quizás provenga de África Oriental o África del Norte; con una antigüedad de unos 64,700 - 83,000 años.^[3] Pero su descendencia más extendida (haplogrupo D-M174) tiene un origen asiático y una antigüedad de 50,000^[4] o 60,000 años^[5] En sus orígenes es próximo al haplogrupo E (descienden de DE) y las mutaciones que lo definen son CTS3946, CTS4030/Z1605 y otras.

Distribución y subgrupos

Al igual que el haplogrupo C, se cree que D representa también la "gran migración costera" a lo largo del sur de Asia y es originaria de las poblaciones más antiguas en varias zonas del continente.

D (CTS3946)	D0 (A5580.2): encontrado en Nigeria y Cercano Oriente.   D1 (M174)   D1b (L1378): en Cebú (Filipinas)   D1a   D1a1 (Z27276): principalmente en el Tíbet, extendido en Asia Oriental   D1a2   D1a2b (Y34637): en nativos de las islas Andamán     D1a2a (M55): típico del Japón, destacan los ainu

Según ISOGGG,^[6] los subgrupos del haplogrupo D se ordenan del siguiente modo:

Mapa de acuerdo con las migraciones prehistóricas del haplogrupo D, con una expansión fuera de África hace aproximadamente 60-50 mil años.^[7]

D0 o D2

D0 o D2 (A5580.2) fue identificado previamente como DE* en poblaciones africanas, lo que sería una señal del origen africano del haplogrupo D y de que la migración fuera de África de los humanos modernos estaría representada por los haplogrupos D1 y CF, mientras que D0 y E habrían permanecido en África. La divergencia entre D-M174 y D0 habría sido entre hace 50 a 59 mil años atrás.^[7]

D0 o D2 se ha encontrado en Nigeria,^[3] Arabia Saudita y Siria^[8]

D1

D1 (M174/Page30, Z1591) es típico del Asia Oriental, fue conocido simplemente como D desde 2002 y renombrado como D1 recientemente (2019).^[6] Posee una antigüedad de unos 65 mil años.^[9]

• D1* en tribus del NE de la India se encontró de 8 a 65%.^[10] Se encuentra en el pueblo Altái^[11] como D-M174(xM15) o D(xM15,P47,M55).^[1]
• D1a (CTS11577)
  • D1a1 (F6251/Z27276, Y15407) se presenta principalmente en el Tíbet (China).
    • D1a1a (M15) antes D1, tiene una frecuencia muy importante en el Tíbet y está también en Bután y Nepal. Se encuentra presente en general en todo el extremo oriente, desde el Sudeste de Asia al Asia Central; en China entre los qiang con 30%, en Sichuan, Yunnan, en los yi, han y miao-yao, encontrándose en minoría en los hablantes de lenguas tibeto-birmanas.
      • D1a1a1 (F849, F901)
        • D1a1a1a (N1) importante en el Tíbet, poco en el resto de China, Japón, Nepal, Rusia y Kazajistán. También en Taiwán y Uzbekistán.
        • D1a1a1b (F1070) en China.
    • D1a1b (P99) antes D3, se encuentra principalmente en el Tíbet. En China destacan los naxi^[12] y los pumi con 70%. También en Asia central: En Tayikistán y en muy baja frecuencia en pueblos túrquicos y mongoles.
      • D1a1b1 (P47) antes D3a, en los pumi, naxi, importante en tibetanos con un 41% y moderadamente en Asia Central.^[13] En altáis se encontró 5%.^[14]
  • D1a2 (Z3660) Los nativos de las islas Andaman comparten entre sí una ascendencia común desde hace unos 7000 años. El linaje más cercano al andamanés es el haplogrupo D japonés, con el cual presenta una relación muy antigua, de hace unos 53,000 años.^[15]
    • D1a2a (M55, M64.1/Page44.1) antes D2, es muy común en todo el archipiélago japonés, incluyendo las Islas Ryūkyū y es especialmente frecuente en los ainu con 87%, por lo que se cree que está relacionado con las primeras poblaciones del Japón (hace 35.000 años) y con la cultura pre-Jomon,^[13] creadora de la cerámica más antigua del mundo (unos 12.000 años). En Okinawa 56%, Honshū 37%, Kyūshū 28%^[16] También se encuentra en China y Tailandia.
      • D1a2a* en Japón con un 4%.^[1]
      • D1a2a1 (M116.1, Z1622) en Japón con un 31% y en micronesia 5%.^[1]
    • D1a2b (Y34637) tiene alta frecuencia en los negritos de las islas Andamán como los jarawa y los onge con frecuencias del 100%,^[17] quienes probablemente llegaron a estas islas durante la Edad de hielo, cuando Andamán era una península de Birmania.
• D1b (L1366, L1378, M226.2) se encuentra en la isla de Mactán (Filipinas)^[18]

Haplogrupos del cromosoma Y humano

Adán cromosómico

A

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

C1

C2

G

H

IJK

IJ

K

I

J

LT

K2

L

T

MS

P

NO

M

S

Q

R

N

O

R1

R2

R1a

R1b

Enlaces externos

• Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019 ISOGG

Referencias

1. Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
2. Kumarasamy Thangaraj, Lalji Singh, Alla G. Reddy, V.Raghavendra Rao, Subhash C. Sehgal, Peter A. Underhill, Melanie Pierson, Ian G. Frame, Erika Hagelberg（2003）；Genetic Affinities of the Andaman Islanders, a Vanishing Human Population ；Current Biology Volume 13, Issue 2, 21 January 2003, Pages 86–93 doi:10.1016/S0960-9822(02)01336-2
3. Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L. et al. (13 de junio de 2019). «A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa». Genetics (en inglés): genetics.302368.2019. ISSN 0016-6731. PMID 31196864. doi:10.1534/genetics.119.302368. Se sugiere usar |número-autores= (ayuda)
4. «Y-DNA Haplogroup D-M174 and its Subclades - 2017».
5. Shi H, Zhong H, Peng Y, Dong YL, Qi XB, Zhang F, Liu LF, Tan SJ, Ma RZ, Xiao CJ, Wells RS, Jin L, Su B (October 2008). «Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations». BMC Biology 6: 45. PMC 2605740. PMID 18959782. doi:10.1186/1741-7007-6-45.
6. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019-2020 ISOGG (International Society of Genetic Genealogy)
7. Marc Haber, Abigail L. Jones, Bruce A. Connell et al. (2019) A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa. Genetics: Early Online, published on June 13, 2019 as 10.1534/genetics.119.302368
8. Estes, Roberta (21 de junio de 2019). «Exciting New Y DNA Haplogroup D Discoveries!». DNAeXplained - Genetic Genealogy (en inglés estadounidense). Consultado el 8 de julio de 2019.
9. D Y-full tree Árbol YTree v9.01.00 (18 Febrero 2021) YFull™
10. Chandrasekar et al. (2007), YAP insertion signature in South Asia, Ann Hum Biol. 2007 Sep-Oct;34(5):582-6.
11. V. N. Kharkov, V. A. Stepanov, O. F. Medvedeva et al., "Gene Pool Differences between Northern and Southern Altaians Inferred from the Data on Y-Chromosomal Haplogroups," Russian Journal of Genetics, 2007, Vol. 43, No. 5, pp. 551–562.
12. Shi et al. (2008), «Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations», BMC Biology 6 (45), doi:10.1186/1741-7007-6-45.
13. Shi, Hong; Zhong, Hua; Peng, Yi; Dong, Yong-Li; Qi, Xue-Bin; Zhang, Feng; Liu, Lu-Fang; Tan, Si-Jie et al. (29 de octubre de 2008). «Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations». BMC Biology 6: 45. ISSN 1741-7007. PMC 2605740. PMID 18959782. doi:10.1186/1741-7007-6-45. Consultado el 2 de diciembre de 2019. Se sugiere usar |número-autores= (ayuda)
14. Dulik MC, Zhadanov SI, Osipova LP, Askapuli A, Gau L, Gokcumen O, Rubinstein S, Schurr TG. Mitochondrial DNA and Y chromosome variation provides evidence for a recent common ancestry between Native Americans and Indigenous Altaians. Am J Hum Genet. 2012 Feb 10;90(2):229-46. doi: 10.1016/j.ajhg.2011.12.014. Epub 2012 Jan 25. Erratum in: Am J Hum Genet. 2012 Mar 9;90(3):573. PMID: 22281367; PMCID: PMC3276666.
15. Mondal M, Bergström A, Xue Y, Calafell F, Laayouni H, Casals F, Majumder PP, Tyler-Smith C, Bertranpetit J. Y-chromosomal sequences of diverse Indian populations and the ancestry of the Andamanese. Hum Genet. 2017 May;136(5):499-510. doi: 10.1007/s00439-017-1800-0. Epub 2017 Apr 25. PMID: 28444560.
16. Suraksha Agrawal et al. 2005YAP, signature of an African–Middle Eastern migration into northern India Current Science, 88, 12, 25 de junio de 2005
17. Thangaraj K, Singh L, Reddy AG, Rao VR, Sehgal SC, Underhill PA, Pierson M, Frame IG, Hagelberg E. Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population. Curr Biol. 2003 Jan 21;13(2):86-93. doi: 10.1016/s0960-9822(02)01336-2. PMID: 12546781.
18. Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014

• Datos: Q339685
• Multimedia: Haplogroup D of Y-DNA / Q339685