Haplogrupo D (ADN-Y)

En genética humana, el haplogrupo D (CTS3946) es un haplogrupo del cromosoma Y humano típico del Extremo Oriente, especialmente frecuente en el Tíbet, en el archipiélago del Japón^[1] y en las islas de Andamán (al sudeste de la India),^[2] y esporádicamente en África, Asia Occidental y Filipinas.

Un estudio reciente (Haber et al.2019) consideró varias posibilidades para el origen del haplogrupo D (CTS3946), incluyendo un origen asiático occidental y uno africano, finalmente el estudio se inclinó a favor de un origen africano y quizás provenga de África Oriental o África del Norte; con una antigüedad de unos 64,700 - 83,000 años.^[3] Pero su descendencia más extendida (haplogrupo D-M174) tiene un origen asiático y una antigüedad de 50,000^[4] o 60,000 años^[5] En sus orígenes es próximo al haplogrupo E (descienden de DE) y las mutaciones que lo definen son CTS3946, CTS4030/Z1605 y otras.

Distribución y subgrupos

Resumir

Contexto

Al igual que el haplogrupo C, se cree que D representa también la "gran migración costera" a lo largo del sur de Asia y es originaria de las poblaciones más antiguas en varias zonas del continente.

D (CTS3946)

D0 (A5580.2): encontrado en Nigeria y Cercano Oriente.

D1 (M174)

D1b (L1378): en Cebú (Filipinas)

D1a

D1a1 (Z27276): principalmente en el Tíbet, extendido en Asia Oriental

D1a2

	D1a2b (Y34637): en nativos de las islas Andamán

	D1a2a (M55): típico del Japón, destacan los ainu

Según ISOGGG,^[6] los subgrupos del haplogrupo D se ordenan del siguiente modo:

D0 o D2

D0 o D2 (A5580.2) fue identificado previamente como DE* en poblaciones africanas, lo que sería una señal del origen africano del haplogrupo D y de que la migración fuera de África de los humanos modernos estaría representada por los haplogrupos D1 y CF, mientras que D0 y E habrían permanecido en África. La divergencia entre D-M174 y D0 habría sido entre hace 50 a 59 mil años atrás.^[7]

D0 o D2 se ha encontrado en Nigeria,^[3] Arabia Saudita y Siria^[8]

D1

D1 (M174/Page30, Z1591) es típico del Asia Oriental, fue conocido simplemente como D desde 2002 y renombrado como D1 recientemente (2019).^[6] Posee una antigüedad de unos 65 mil años.^[9]

D1* en tribus del NE de la India se encontró de 8 a 65%.^[10] Se encuentra en el pueblo Altái^[11] como D-M174(xM15) o D(xM15,P47,M55).^[1]
D1a (CTS11577)
- D1a1 (F6251/Z27276, Y15407) se presenta principalmente en el Tíbet (China).
  - D1a1a (M15) antes D1, tiene una frecuencia muy importante en el Tíbet y está también en Bután y Nepal. Se encuentra presente en general en todo el extremo oriente, desde el Sudeste de Asia al Asia Central; en China entre los qiang con 30%, en Sichuan, Yunnan, en los yi, han y miao-yao, encontrándose en minoría en los hablantes de lenguas tibeto-birmanas.
    - D1a1a1 (F849, F901)
      - D1a1a1a (N1) importante en el Tíbet, poco en el resto de China, Japón, Nepal, Rusia y Kazajistán. También en Taiwán y Uzbekistán.
      - D1a1a1b (F1070) en China.
  - D1a1b (P99) antes D3, se encuentra principalmente en el Tíbet. En China destacan los naxi^[12] y los pumi con 70%. También en Asia central: En Tayikistán y en muy baja frecuencia en pueblos túrquicos y mongoles.
    - D1a1b1 (P47) antes D3a, en los pumi, naxi, importante en tibetanos con un 41% y moderadamente en Asia Central.^[13] En altáis se encontró 5%.^[14]
- D1a2 (Z3660) Los nativos de las islas Andaman comparten entre sí una ascendencia común desde hace unos 7000 años. El linaje más cercano al andamanés es el haplogrupo D japonés, con el cual presenta una relación muy antigua, de hace unos 53,000 años.^[15]
  - D1a2a (M55, M64.1/Page44.1) antes D2, es muy común en todo el archipiélago japonés, incluyendo las Islas Ryūkyū y es especialmente frecuente en los ainu con 87%, por lo que se cree que está relacionado con las primeras poblaciones del Japón (hace 35.000 años) y con la cultura pre-Jomon,^[13] creadora de la cerámica más antigua del mundo (unos 12.000 años). En Okinawa 56%, Honshū 37%, Kyūshū 28%^[16] También se encuentra en China y Tailandia.
    - D1a2a* en Japón con un 4%.^[1]
    - D1a2a1 (M116.1, Z1622) en Japón con un 31% y en micronesia 5%.^[1]
  - D1a2b (Y34637) tiene alta frecuencia en los negritos de las islas Andamán como los jarawa y los onge con frecuencias del 100%,^[17] quienes probablemente llegaron a estas islas durante la Edad de hielo, cuando Andamán era una península de Birmania.
D1b (L1366, L1378, M226.2) se encuentra en la isla de Mactán (Filipinas)^[18]

Haplogrupos del cromosoma Y humano

Enlaces externos

Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019 ISOGG

Referencias

[1]
Hammer MF, Karafet TM, Park H et al. (2006). "Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes". J. Hum. Genet. 51 (1): 47–58. doi:10.1007/s10038-005-0322-0. PMID 16328082.
[2]
Kumarasamy Thangaraj, Lalji Singh, Alla G. Reddy, V.Raghavendra Rao, Subhash C. Sehgal, Peter A. Underhill, Melanie Pierson, Ian G. Frame, Erika Hagelberg（2003）；Genetic Affinities of the Andaman Islanders, a Vanishing Human Population ；Current Biology Volume 13, Issue 2, 21 January 2003, Pages 86–93 doi:10.1016/S0960-9822(02)01336-2
[3]
Tyler-Smith, Chris; Xue, Yali; Thomas, Mark G.; Yang, Huanming; Arciero, Elena; Asan; Connell, Bruce A.; Jones, Abigail L. et al. (13 de junio de 2019). «A Rare Deep-Rooting D0 African Y-Chromosomal Haplogroup and Its Implications for the Expansion of Modern Humans out of Africa». Genetics (en inglés): genetics.302368.2019. ISSN 0016-6731. PMID 31196864. doi:10.1534/genetics.119.302368.
[4]
«Y-DNA Haplogroup D-M174 and its Subclades - 2017».
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[6]
Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2019-2020 ISOGG (International Society of Genetic Genealogy)
[7]
Marc Haber, Abigail L. Jones, Bruce A. Connell et al. (2019) A Rare Deep-Rooting D0 African Y-chromosomal Haplogroup and its Implications for the Expansion of Modern Humans Out of Africa. Genetics: Early Online, published on June 13, 2019 as 10.1534/genetics.119.302368
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Shi et al. (2008), «Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations», BMC Biology 6 (45), doi:10.1186/1741-7007-6-45.
[13]
Shi, Hong; Zhong, Hua; Peng, Yi; Dong, Yong-Li; Qi, Xue-Bin; Zhang, Feng; Liu, Lu-Fang; Tan, Si-Jie et al. (29 de octubre de 2008). «Y chromosome evidence of earliest modern human settlement in East Asia and multiple origins of Tibetan and Japanese populations». BMC Biology 6: 45. ISSN 1741-7007. PMC 2605740. PMID 18959782. doi:10.1186/1741-7007-6-45. Consultado el 2 de diciembre de 2019.
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[15]
Mondal M, Bergström A, Xue Y, Calafell F, Laayouni H, Casals F, Majumder PP, Tyler-Smith C, Bertranpetit J. Y-chromosomal sequences of diverse Indian populations and the ancestry of the Andamanese. Hum Genet. 2017 May;136(5):499-510. doi: 10.1007/s00439-017-1800-0. Epub 2017 Apr 25. PMID: 28444560.
[16]
Suraksha Agrawal et al. 2005YAP, signature of an African–Middle Eastern migration into northern India Current Science, 88, 12, 25 de junio de 2005
[17]
Thangaraj K, Singh L, Reddy AG, Rao VR, Sehgal SC, Underhill PA, Pierson M, Frame IG, Hagelberg E. Genetic affinities of the Andaman Islanders, a vanishing human population. Curr Biol. 2003 Jan 21;13(2):86-93. doi: 10.1016/s0960-9822(02)01336-2. PMID: 12546781.
[18]
Y-DNA Haplogroup D and its Subclades - 2014

Datos: Q339685
Multimedia: Haplogroup D of Y-DNA / Q339685

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