Bäuerle studierte Architektur an der Fachhochschule Konstanz. 1989 gründete er ein Architekturbüro in Konstanz. Von 2000 bis 2010 arbeitete er in Partnerschaft mit Frohwin Lüttin zusammen.[1] Bäuerle lehrte als Lehrbeauftragter an der Fachhochschule Konstanz (1992–1997) und seit 2003 als Professor für Bauen und Gestalten an der Hochschule Kaiserslautern. Werner Bäuerle wurde 1991 in den Bund Deutscher Architekten berufen und ist seit 2000 Mitglied des Deutschen Werkbunds.
Bäuerle realisierte zahlreiche Wohnanlagen, unter anderem in Singen[2], Ulm, Immendingen, Wolfratshausen, Bottighofen[3] und in Litzelstetten.
- Umbau Domherrenhof Konstanz
- Wohnhaus, Ammersee[4]
- Erweiterung Atelier, Prutting
- Umbau FH Konstanz
- Kindergarten, Albbruck
- Erweiterung Rathaus, Neuhausen
- Emma-Brendel-Weg, Erlangen
- 1997: Doppelhaus Peter, München-Solln[5]
- 1998: Masterplan Siedlung Permoserstraße, Ingolstadt
- 1998: Siedlung Permoserstraße – Richard-Strauss-Straße 65, Ingolstadt[6]
- 1999: Siedlung Permoserstraße – Richard-Strauss-Straße 67, 69, 71, 73, 75, 77, 79, 81, Ingolstadt[7]
- 2000: Masterplan Ostenvorstadt, Eichstätt
- 2001: Doppelhaus, Feldafing (Bauherr: Euroboden)
- Grimm, Richarz (Hg.): Gestalten mit der Welle. Karl Krämer Verlag, Stuttgart + Zürich, 1998
- Annette Becker, Wilfried Wang (Hg.): Architekten Jahrbuch 1998. Prestel verlag, München 1998
- Christoph Gunßer (Hg.): Holzhäuser. Deutsche Verlags-Anstalt, Stuttgart 1999
- Ursula Baus, Klaus Siegele (Hg.): Stahltreppen. Konstruktion, Gestalt, Beispiele. db, Stuttgart 2000
- Bayerische Architektenkammer (Hg.): Architektur Jahrbuch Bayern 2003. Callwey Georg D.W., München 2003
- Katharina Heider (Hg.): Doppelhäuser und Reihenhäuser. Deutsche Verlags-Anstalt, München 2006
- Bundesministerium für Verkehr-, Bau- und Stadtentwicklung (Hg.): Architektur der Demokratie. Bauten des Bundes 1990–2010. Hatje Cantz Verlag, Hamburg 2009 mit einem Beitrag von Wolfgang Pehnt
- Christoph Gunßer, Theo Peter (Hg.): Miteinander bauen. Architektur für gute Nachbarschaften – Baugruppen Baugenossenschaften. Deutsche Verlags-Anstalt, Stuttgart 2010
- Eberhard Schunck, Oster, Barthel, Kiessl (Hg.): Dach Atlas. Birkhäuser Verlag, 2012.
- Thomas Herzog, Julius Natterer, Schweitzer, Volz, Winter (Hg.): Holzbau Atlas. Birkhäuser Verlag, 2013
