Folli wurde als Sohn des Girolamo Folli geboren. Er war Mitglied der Compagnia di Santa Caterina in Fontebranda der ContradaOca (Gans) und deren Priore von November 1599 bis Februar 1600. Von 1589 bis 1594 hielt er sich wahrscheinlich in Rom auf, um in der Biblioteca Vaticana, im Palazzo Lateranense und in Santa Maria Maggiore für Alessandro Ottaviano de’Medici (später Papst Leo XI. genannt) zu arbeiten. Danach kehrte er nach Siena zurück, wo er im Umfeld des gleichaltrigen Ventura Salimbeni und dessen älteren Halbbruder Francesco Vanni sowie mit Rutilio Manetti wirkte. Erste Werke wurden ab 1598 dokumentiert, als er für die Compagnia del Santissimo Sacramento di Piancastagnaio einen Gonfanon erstellte und in Siena im Sala del Consiglio im Palazzo Pubblico arbeitete.
Von 1602 an arbeitete er am Santuario di Santa Caterina. Seine zweite Romreise fand im April 1605 statt, fand aber aufgrund des plötzlichen Todes seines Gönners Leo XI. ein abruptes Ende. Nach Siena zurückgekehrt erstellte er im gleichen Jahr im Convento delle Sperandie (Monastero delle Trafisse) vier Werke. Die 1603 begonnenen Arbeiten in San Sebastiano in Camollia beendete er 1608 mit dem Fresko San Sebastiano davanti all’imperatore Diocleziano (dt. = Hl. Sebastian vor Kaiser Diocletian). Zu seinen wichtigsten Werken gehört die Gloria (auch Trionfo di Santa Lucia) genannten Lünetten in der Chiesa di Santa Lucia (auch Chiesa dei Santi Niccolò e Lucia, Via Pian dei Mantellini) in Siena[3], die er von 1612 bis 1617 mit seinen Schülern Simondio Salimbeni und Astolfo Petrazzi ausführte. 1614 vollendete er das Werk Madonna in gloria incoronata dal Cristo bambino circondata da Angeli e Santi (dt. = Madonna in der Glorie gekrönt von dem Jesusknaben und in Gesellschaft von Engeln und Heiligen) von Francesco Vanni († 1610) in der Chiesa del Santuccio in Siena, die zunächst von Ventura Salimbeni († 1613) weitergeführt wurden.
Castiglione d’Orcia, Ortsteil Campiglia d’Orcia, Chiesa di San Biagio: Madonna col Bambino che consegna le chiavi a San Pietro (im ersten Jahrzehnt des 17. Jahrhunderts entstanden[5])
Lucignano, Museo Comunale di Lucignano, Saal 1: Annunciazione[6]
Radicondoli, Chiesa di Santa Caterina delle Ruote: Martirio di Santa Caterina d’Alessandria (Ölgemälde, 1607 entstanden[7])
Rapolano Terme, Ortsteil Serre di Rapolano, Chiesa della Compagnia di Santa Caterina della Misericordia: Maria Vergine in Gloria, Santa Caterina che riceve le stigmate davanti al Crocifisso e i Santi Rocco ed Elisabetta[8][9]
Roccalbegna, Oratorio del Santissimo Crocifisso, heute Museum von Roccalbegna: Madonna della Misericordia, Cristo in Pietà, Due confratelli in adorazione della Croce[10]
Sposalizio mistico di Santa Caterina d’Alessandria (Linke Seite des Kirchenschiffs, 1609 entstanden)
Visione di Santa Caterina da Siena (Rechte Seite der Krypta)
Siena, Casa Mensini: Compianto sul Cristo morto (Fresko)
Siena, Chiesa di Santa Lucia (Chiesa dei Santi Niccolò e Lucia):
Evangelisti (Fresko, 1619 entstanden)
Gloria / Trionfo di Santa Lucia (Lünettenfresko, 1612 entstanden)
Siena, Chiesa di San Michele al Monte di San Donato: Cristo coronato di spine
Siena, Chiesa di San Pietro a Ovile: Famiglie di Gesù e di San Giovannino (Leinwandgemälde, 1614 entstanden, im 19. Jahrhundert vom Palazzo Pubblico nach hier verlegt)
Missione di Caterina ad Avignone presso Papa Gregorio XI
Riconciliazione coi fiorentini ottenuta dalla Santa senese
Ritorno di Caterina a Firenze
Siena, Santa Maria della Scala: Santa Caterina da Siena (Ölgemälde auf Leinwand, ca. 1610 entstanden, befindet sich derzeit in den Räumen neben dem Verbindungsgang)
Folli (Sebastiano). In: Dictionnaire critique et documentaire des peintres, sculpteurs, dessinateurs et graveurs de tous les temps et de tous les pays. Band 4: Dughet–Gillet. Gründ, Paris 1976, ISBN 2-7000-0152-4, S. 418 (französisch, Textarchiv– Internet Archive – Leseprobe).
Anna Maria Guiducci: I Luoghi della Fede. Le Crete senesi, la Val d’Arbia e la Val di Merse, Arnoldo Mondadori Editore, Mailand 1999, ISBN 88-04-46774-6, S. 98 f.
Abb. des Werkes Maria Vergine in Gloria, Santa Caterina che riceve le stigmate davanti al Crocifisso e i Santi Rocco ed Elisabettabei cretesenesi.com, abgerufen am 8. April 2013 (italienisch).