Der Name der Familie, Herelle, wurde anlässlich des 100. Jahrestages der Entdeckung der Bakteriophagen zu Ehren ihres Entdeckers Félix d’Hérelle (1873–1994), eines französisch-kanadischen Mikrobiologen vergeben, das Suffix ‚-viridae‘ ist das Standardsuffix für Virenfamilien.[5][6][8]
Morphologie
Die Virionen (Virusteilchen) der Herelleviridae haben Kopf-Schwanz-Struktur; der Kopf ist ein ikosaedrischesKapsid mit einem Durchmesser von 85–100nm.
Die Kapside sind nicht umhüllt und zeigen deutliche die Kapsomere, d.h. die Kapsiduntereinheiten, diese sind in Fünf- und Sechsecken angeordnet, die sich zum ikosaedrischen Kapsid zusammenfügen.
Die Kapside können bis zu 35 Proteine beherbergen.
Die unkontrahierten Schwänze sind 130–185nm lang. Der Hals hat eine Grundplatte von ca. 60nm und einen kleinen Kragen.[5][9][6]
Listeria-Phage A511 (Spezies Pecentumvirus A511): Aufbau der Basisplatte und Veränderung während der Absorption an der Zellwand des Wirtsbalterium.
Genom
Das Genom der Herellevidae ist eine lineare doppelsträngige DNA (dsDNA) mit langen terminalen Wiederholungen (englischrepeats) von 3–16kbp (Kilo-Basenpaaren) Länge.
Die Genome sind 125–170kbp groß und kodieren etwa 165–301 Gene.
Mehrere Introns wurden auch in Herellevirus-Genomen nachgewiesen.[5][9][6]
Replikationszyklus
Die Replikation findet mit Hilfe DNA-Polymerase der Wirte statt.[5][9][6]
Nach den Untersuchungen sind die Phagen dieser Familie obligat lytisch, aber einige können eine anhaltende bzw. pseudolysogene Infektion verursachen.[5][6]
Die Herelleviridae bilden nach allgemeiner Auffassung eine monophyletischeKlade, was u.a. durch genombasierten Phylogenien gut unterstützt wird. Die Familienmitglieder haben mindestens 60% Übereinstimmung in der Nukleotidsequenz.[5][6]
Gemäß ICTV mit Stand Mai 2024 gliedert sich die Familie Herelleviridae wie folgt in Unterfamilien und Gattungen (mit einer Auswahl an Spezies):[10][11][9][8]
Familie Herelleviridae
Unterfamilie Bastillevirinae
Gattung Agatevirus
Spezies Agatevirus agate (Bacillus-Virus Agate, ehem. Typus) mit Bacillus-Phage phiAGATE
Gattung Bastillevirus
Spezies Bastillevirus bastille (Bacillus-Virus Bastille, ehem. Typus) mit Bacillus-Phage Bastille
Spezies Agatevirus bobb mit Bacillus-Phage Bobb
Spezies Agatevirus Bp8pC mit Bacillus-Phage Bp8p-C und Bacillus-Phage Bp8p-T
Gattung Bequatrovirus (veraltet: B4virus)
Spezies Bequatrovirus B4 (Bacillus-Virus B4, ehem. Typus) mit Bacillus-Phage B4 und B55
Spezies Bastillevirus CAM003 mit Bacillus-Phage CAM003
Spezies Bastillevirus evoli mit Bacillus-Phage Evoli
Spezies Bastillevirus hoodyT mit Bacillus-Phage Hoody T
Gattung Caeruleovirus (veraltet: Bc431virus)
Spezies Caeruleovirus Bc431 (Bacillus-Virus Bc431, ehem. Typus) mit Bacillus-Phage vB_BceM_Bc431v3
Spezies …
Gattung Eldridgevirus
Spezies Eldridgevirus eldridge mit Bacillus-Phage Eldridge
Gattung Goettingenvirus
Spezies Goettingenvirus goe8 mit Bacillus-Phage vB_BmeM-Goe8
Gattung Grisebachstrassevirus
Spezies Grisebachstrassevirus goe3 mit Bacillus-Phage vB_BsuM-Goe3
Gattung Jeonjuvirus
Spezies Jeonjuvirus BSP38 mit Bacillus-Phage BSP38
Gattung Matervirus
Spezies Matervirus mater mit Bacillus-Phage Mater
Gattung Moonbeamvirus
Spezies Moonbeamvirus moonbeam mit Bacillus-Phage Moonbeam
Gattung Nitunavirus (veraltet: Nit1virus)
Spezies Nitunavirus grass mit Bacillus-Phage Grass
Spezies Nitunavirus NIT1 (Bacillus-Virus NIT1, ehem. Typus) mit Bacillus-Phage phiNIT1
Spezies Nitunavirus SPG24 mit Bacillus-Phage SPG24
Gattung Shalavirus
Spezies Shalavirus Shbh1 mit Bacillus-Phage Shbh1
Gattung Siophivirus
Spezies Siophivirus SIOphi mit Bacillus-Phage SIOphi
Spezies Sepunavirus SEP1 (Staphylococcus-Virus SEP1, ehem. Typus) mit Staphylococcus-Phage phiIBB-SEP1
Gattung Silviavirus
Spezies Silviavirus remus (Staphylococcus-Virus Remus, ehem. Typus) mit Staphylococcus-Phage vB_SauM_Remus und Staphylococcus-Phage vB_SauM_Romulus
Spezies Silviavirus SA11 mit Staphylococcus-Phage SA11
Spezies Silviavirus stau2 mit Staphylococcus-Phage Stau2[23]
Gattung Twortvirus (veraltet: Twortlikevirus, früher zur Familie Myoviridae, da vom MorphotypMyoviren)[24]
Spezies Twortvirus twort (Staphylococcus-Virus Twort, ehem. Typus) mit Staphylococcus-Phage Twort[25]
ohne zugewiesene Unterfamilie
Gattung Elpedvirus
Spezies Elpedvirus LpeD mit Lactobacillus-Phage LpeD
Gattung Harbinvirus
Spezies Harbinvirus bacchae mit Lactobacillus-Phage Bacchae
Spezies Harbinvirus bromius mit Lactobacillus-Phage Bromius
Spezies Harbinvirus iacchus mit Lactobacillus-Phage Iacchus
Spezies Harbinvirus Lpa804 (Lactobacillus-Virus Lpa804, ehem. Typus) mit Lactobacillus-Phage Lpa804
Spezies Harbinvirus semele mit Lactobacillus-Phage Semele
Gattung Hopescreekvirus
Spezies Hopescreekvirus LfeInf mit Lactobacillus-Phage LfeInf
Gatting Klumppvirus
Spezies Klumppvirus A9 (Brochothrix-Virus A9, ehem. Typus) mit Brochothrix-Phage A9[26][27], infiziert Bakterien der Gattung Brochothrix, Familie Listeriaceae. Nicht zu verwechseln mit dem Riesenphagen Huge Phage A9.[28]
Gattung Mooreparkvirus
Spezies Mooreparkvirus Lb3381 (Lactobacillus-Virus Lb338-1, ehem. Typus) mit Lactobacillus-Phage Lb338-1
Gattung Salchichonvirus
Spezies Salchichonvirus LP65 (Lactobacillus-Virus LP65, ehem. Typus) mit Lactobacillus-Phage LP65
Spezies Lactobacillus-Virus LP65
Gattung Tybeckvirus
Spezies Tybeckvirus SAC12B mit Lactobacillus-Phage SAC12B
Spezies Tybeckvirus tv521B mit Lactobacillus-Phage 521B
Gattung Watanabevirus
Spezies Watanabevirus wv3521 mit Lactobacillus-Phage 3-521
Jakub Barylski, Andrew M. Kropinski, Nabil-Fareed Alikhan, Evelien M. Adriaenssens, ICTV Report Consortium: ICTV Virus Taxonomy Profile: Herelleviridae. In: The Journal of General Virology. 101. Jahrgang, Nr.4, April 2020, S.362–363, doi:10.1099/jgv.0.001392, PMID 32022658 (englisch).
Jakub Barylski, François Enault, Bas E. Dutilh, Margo B.P. Schuller, Robert A. Edwards, Annika Gillis, Jochen Klumpp, Petar Knezevic, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn, Rob Lavigne, Hanna Maarit Oksanen, Matthew B. Sullivan, Ho Bin Jang, Peter Simmonds, Pakorn Aiewsakun, Johannes Wittmann, Igor Tolstoy, J. Rodney Brister, Andrew M. Kropinski (2020). Taxonomy proposal: To create one (1) new family, Herelleviridae, in the order Caudovirales. University of Helsinki.
Jakub Barylski, François Enault, Bas E. Dutilh, Margo B.P. Schuller, Robert A. Edwards, Annika Gillis, Jochen Klumpp, Petar Knezevic, Mart Krupovic, Jens H. Kuhn etal.: Analysis of Spounaviruses as a Case Study for the Overdue Reclassification of Tailed Phages. In: Systematic Biology, Band 69, Nr.1, Januar 2020, S.110–123; doi:10.1093/sysbio/syz036, Epub 25. Mai 2019 (englisch)
Marta Matuszewska, Gemma G.R. Murray, Xiaoliang Ba, Rhiannon Wood, Mark A. Holmes, Lucy A. Weinert: Stable antibiotic resistance and rapid human adaptation in livestock-associated MRSA. In: eLife, 28. Juni 2022; doi:10.7554/eLife.74819 (englisch). Dazu:
Romain Guérillot, Xenia Kostoulias, Liam Donovan, Lucy Li, Glen P. Carter, Abderrahman Hachani, Koen Vandelannoote, Stefano Giulieri, Ian R. Monk, Mayu Kunimoto, Lora Starrs, Gaétan Burgio, Torsten Seemann, Anton Y. Peleg, Timothy P. Stinear, and Benjamin P. Howden: Unstable chromosome rearrangements in Staphylococcus aureus cause phenotype switching associated with persistent infections. In: PNAS, Band 116, Nr.40, 16. September 2019, S.20135-2014; doi:10.1073/pnas.1904861116, ResearchGate:335865826 (englisch). Siehe insbes. Fig.1.
Vijay Aswani, Fares Najar, Madhulatha Pantrangi, Bob Mau, William R. Schwan & Sanjay K. Shukla: Virulence factor landscape of a Staphylococcus aureus sequence type 45 strain, MCRF184. In: BMC Genomics, Band 20, Nr.123, 8. Februar 2019, Projekt: MCRF184; doi:10.1186/s12864-018-5394-2; ResearchGate:330978998 (englisch).
Roman Pantůček, J. Doskar, V. Růzicková, P. Kaspárek etal.: Identification of bacteriophage types and their carriage in Staphylococcus aureus. In: Archives of Virology, Band 149, Nr.9, S.1689–1703, Oktober 2004; doi:10.1007/s00705-004-0335-6, PMID 15593413 (englisch)