5. april – To libyere, der er mistænkt for at have ødelagt et Pan Am Flight 103 i 1988 overlades til skotske myndigheder og skal muligvis stilles for en domstol i Holland. FN sanktionerer Libyen.
3. maj – Tornadoudbruddet i Oklahoma 1999: En F5-tornado rammer Moore, Oklahoma og dræber 38 personer (den største tornado, der er målt i verdenshistorien).
11. juli – Indien tager fat i Kargil igen og tvinger Pakistans hær til at forlade stedet. Indien erklærer sig for sejrherrer, hvilket slutter den 2-måneder lange konflikt
16. juli – John F. Kennedy Jr. dør ved et flystyrt sammen med sin kone Carolyn Bessette Kennedy og hendes søster Lauren Bessette.
17. august – İzmit-jordskælvet 1999: Et 7,6-jordskælv på Richterskalaen rammer İzmit og meget af det nordvestlige Tyrkiet og dræber mere end 17.000 og skader 44.000
21. september – 921-jordskælvet, også kendt som Jiji-jordskælvet (7,6 på Richter-skalaen) dræber omkring 2400 i Taiwan
25. september - Fremskridtspartiets landsmøde ophæver den otte år gamle eksklusion af partiets stifter Mogens Glistrup. Et par uger efter fik det fire af partiets mest kendte folketingsmedlemmer til at melde sig ud af partiet
27. november – Det venstreorientrede Arbejderpartiet i New Zealand danner regering med Helen Clark som leder, hvilket gør hende til landets anden kvindelige premierminister nogensinde.
30. november – ExxonMobil-sammenarbejdet opstår, hvilket gør det til verdens største firma.
December
3. december – NASA mister radiokontakt med Mars Polar Lander, øjeblikke før rumfartøjet kommer til Mars' atmosfære.
3. december – En kraftig orkan rammer det sydlige Danmark og dræber syv mennesker. Lavtryksbanen over Nordjylland giver landsdelen rolige vindforhold en overgang. Skaderne efter århundredes orkan løber op i et milliardbeløb og bliver den hidtil mest ødelæggende naturkatastrofe.