Thorarchaeota
From Wikipedia, the free encyclopedia
Kmen Thorarchaeota se řadí do skupiny Asgard v rámci domény Archea.[1] Skupina Asgard je tvořena kromě zástupci z kmene Thorarchaeota také následujícími kmeny: Lokiarchaeota, Odinarchaeota, Heimdaarchaeota, Helarchaeota a Gerdarchaeota.[2]
| Thorarchaeota | |
|---|---|
 | |
| Vědecká klasifikace | |
| Doména | archea (Archaea) |
| Říše | Proteoarchaeota |
| Nadkmen | asgard (Asgard) |
| Kmen | Thorarchaeota |
| Některá data mohou pocházet z datové položky. | |
Objev
Tento kmen byl popsán na základě částečných až téměř úplných genomů, které byly získány ze sedimentů ústí řeky White Oak v Severní Karolíně. Spolu s dalšími metagenomickými údaji o kmenech Lokiarchaeota a Thorarchaeota byla prokázána přítomnost charakteristických eukaryotických proteinů, jako jsou například tubuliny nebo homology ε DNA polymerasy. Studium Thorarchaeot tedy může vést k dosažení dalších poznatků o procesech, které vedly ke vzniku první eukaryotické buňky na základě další evoluční analýzy asgardských linií.[3]
Charakteristika
Genom
V rámci Asgard skupiny je pro kmen Thorarchaeota jedinečná přítomnost genů, které kódují proteiny pro eukaryotické membránové transportní systémy. Taktéž se v genomu vyskytují geny pro proteiny sloužící pro tvorbu vezikul, což naznačuje potenciální roli v evoluci eukaryot. Genomy zástupců Thorarchaeota nese geny pro degradaci organické hmoty a také geny, které kódují proteiny pro asimilaci extracelulárních proteinů.[1]
Metabolismus
Thorarchaeota jsou schopna fixovat anorganický uhlík ve formě CO2, jak napovídá analýza genomů získaných z hlubokých anoxických vrstev.[1] Z toho lze usuzovat, že se jedná o obligátní anaeroby, avšak Thorarchaeota jsou kromě fermentace, při které je produkován vodík, schopna i oxidace organických látek s generováním membránového potenciálu pomocí odvozeného komplexu I dýchacího řetězce.[4]
Thorarchaeota se řadí mezi mixotrofy, fixace uhlíku v těchto mikroorganismech probíhá pomocí Wood-Ljungdahlovy dráhy a elektrony mohou získávat z různých organických substrátů.[5] Ve Wood-Ljungdahlově dráze v těchto mikroorganismech je využíván tetrahydromethanopterin i tetrahydrofolát (který je běžný spíše u bakterií) jakožto jednouhlíkaté nosiče.[4] Mohou se taktéž podílet na produkci ethanolu, jsou schopna fixace dusíku, redukce dusitanů a síry a detoxikace arsenu.[1]
Výskyt
Z analýzy genu 16S rRNA vyplývá rozšíření zástupců Thorarchaeota v mořských a sladkovodních sedimentech a v odpadních vodách. Vyskytují se pravděpodobně po celém světě bez geografické preference.[1]
Reference
Wikiwand - on
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.