Kapsomera

Kapsomera (lat. capsa = dio kutije) je morfološka podjedinica kapside ili ikosahedralna ili spiralna spoljna ljuska proteina ili poliprotein koji štiti genetički materijal virusa. Kapsomere se samosastavljaju i formiraju kapside.^[1]

Dijagram jednog adenovirusa, sa jasno vidljivim kapsidnim molekulama

Oni formiraju grupe identičnih molekula proteina (protomera) kojie su povezane nekovalentnim vezama koje su su vidljive pod elektronskim mikroskopom. Svaka kapsomera može se sastojati od jednog ili više proteina. U ovom dijagramu adenovirusne kapside, molekule su jasno vidljive.

Ikosaedarska kapsida

Kapsomere ikosaedarske kapside

Kapsomere mogu se svrstati prema njihovoj lokaciji u kapside. Naprimjer, u ilosahedarskoj kapsidi, postoji 12 tjemenih čvorova. Svaki od ovih dvanaest čvorova zauzima pentamer. Pentamer se tako zove jer ima pet susjednih kapsomera. U prostoru između pentamera su heksamere, koje čine većinu u ikosahedarskoj kapsidi. Ovi imaju po šest susjednih kapsomeres. U ikosahedarskoj kapsidi, uvijek ima 12 pentamera, heksamera ali taj broj je varijabilan.^[2]

Helikoidne kapsomere (protomere) su često klinastog oblika i čine spiralne kapside. Kompleksne kapsomere imaju različite oblike, kao što su u kapsidama boginja, HIV-a ili rabdovirusa.^[3]

Ikosahedarske kapsidne kapsomere (morfološke jedinice) su polproteini koji se sastoje od pet ili šest proteina ili proteinskih monomera (strukturnih jedinica). Ove proteinske monomere se nalaze u nekim grupama virusa, kao što su pikornavirusne protomere. S druge strane, u određenim virusima, protomere imaju različite protein domene pod nazivom domenska kamera za vožnju unazad. To je zajedničko uvjerenje da lice jednog ikosahedarskog virusa odgovara broju monomera ili protomera, ali to ne mora biti uvijek tako.

Također pogledajte

• Kapsida
• Protomera