Međunarodni kodeks filogenetičke nomenklature, poznat po skraćenici FiloKod (engleski: PhyloCode), je nacrt za formalni skup pravila koji reguliraju filogenetičku nomenklaturu. Njegova sadašnja verzija posebno je dizajnirana da regulira imenovanje kladusa, ostavljajući upravljanje imenima vrsta do ranga Nomenklaturnih kodeksa (Međunarodni kodeks nomenklature algi, gljiva i biljaka (CN), Međunarodni kodeks zoološke nomenklature (ICZN), Međunarodni kodeks nomenklature bakterija (ICNB), Međunarodni komitet za taksonomiju virusa (ICTV).
FiloKod povezan je s Međunarodnim društvom za filogenetičku nomenklaturu (ISPN).[1] Njegov prateći volumen, Filonimi, uspostavit će prva taksonska imena pod FiloKod-om, posluživši kao primjer onima koji nisu s upoznati s kodom.[2] RegNum je povezana internetska baza podataka za filogenska imena.[3]
FiloKod predlaže da se regulira filogenetička nomenklatura osiguravanjem pravila za odlučivanje koje će se asocijacije imena i definicija smatrati uspostavljenim,[4] koji će se od njih smatrati homonimima[5] or synonyms,[6] i koji će se iz skupa sinonima ili homonima smatrati prihvaćenim (uglavnom onaj koji je prvi registrovan; vidi dolje). FiloKod će dopustiti samo imenovanje kladusa,[7] ali ne iz parafilskih ili polifiletnih grupa, i dozvolit će upotrebu primjeraka, vrsta i apomorfija kao specifera (sidra).[8]
Za razliku od rangirane nomenklature kodova (ICN, ICZN, ICNB), FiloKod ne zahtijeva upotrebu rangova, iako po želji dopušta njihovu upotrebu.[9] Kodovi temeljeni na rangu definiraju taksone koristeći rang (kao što su rod, porodica, itd), a u mnogim slučajevima i tip ili tipski podtakson. Tačan sadržaj taksona, osim vrste, nije naveden kodovima koji se temelje na rangu.
Suprotno tome, pod filogenetskom nomenklaturom sadržaj taksona razgraničava se definicijom koja je zasnovana na filogeniji (tj. precima i potomcima) i koristi specifikatore (npr. vrste, primjerke, apomorfije) za označavanje stvarnih organiama. Formula definicije ukazuje na pretka. Definirani takson je, dakle, taj predak i svi njegovi potomci. Stoga se sadržaj filogenetički definiranog taksona oslanja na filogenetičku hipotezu.
Slijede primjeri tipova filogenetičke definicije (velika slova označavaju specifikatore):[10]
- Temeljen na koljenu: kladus koji potiče od najbližeg drevnog zajedničkog pretka za A i B ili "najmanje uključiv kladus koja sadrži A i B
- Temeljen na grani: kladus koji se sastoji od A i svih organizama ili vrsta koji imaju najbližeg zajedničkog pretka s A a ne sa Z ili najobuhvatniji kladus koji sadrži A, ali ne i Z. Još jedan pojam za definicije ove vrste je temeljen na izvorima.
- Na bazi apomorfije: kladus koji potiče od prvog organizma ili vrste koja posjeduje apomorfiju M nasljeđenu od A.
Moguće su i druge vrste definicije uzimajući u obzir ne samo filogenetičke odnose organizma i apomorfije, već i jesu li povezani organizmi ili nisu postojeći.
Sljedeća tabela sadrži primjere filogenetičkih definicija razreda koji također imaju rang u tradicijskoj nomenklaturi. Kad su svi specifikatori u definiciji utemeljenoj na koljenima postojeći primjerci ili vrste, kao što je u sljedećoj definiciji Mammalia, definirana je krunska grupa. (Uobičajena definicija sisara je manje restriktivna, uključujući neke fosilne grupe izvan krunske grupe.)[11]
| Ime | Rang | Tip | Moguća filogenetička definicija |
|---|---|---|---|
| Tyrannosauridae | Porodica | Tyrannosaurus Osborn 1905 |
Posljednji uključujući kladus koji sadrži i Tyrannosaurus rex Osborn 1905, Gorgosaurus libratus Lambe 1914, i Albertosaurus sarcophagus Osborn 1905 |
| Mammalia | Razred | N/A | Kladus koji potiče s najbližim zajedničkim pretkom ljudi, Homo sapiens Linnaeus 1758, kljunara Ornithorhynchus anatinus Shaw 1799 |
| Rodentia | Red | N/A | Najobuhvatniji kladus koja sadrži kućnog miša, Mus musculus Linnaeus 1758, ali ne i istočni pamučasti rep, Sylvilagus floridanus Allen 1890 |
| Neornithes (Moderne ptice) |
Podrazred | N/A | Kladus koji potiče sa najbrižim recentnim zajedničkim pretkom najobuhvatnijeg kladusa koji uključuj vrapca Passer domesticus Linnaeus 1758 ali ne dinosaura Stegosaurus armatus Marsh 1887 |
| Tetrapoda | Nadrazred | N/A | Kladus koji potiče sa najranijim pretkom sa Homo sapiens Linnaeus 1758 sa naslijeđenim udovima s prstima ili nožnim prstima |
Nacrt /draft) FiloKoda prošao je kroz nekoliko revizija. Sve starije verzije se mogu na sajtu Arhivirano 4. 4. 2019. na Wayback Machine. Od januara 2020., sadašnja verzija je 5., finalizirana januara 2014., a važi 21. Januara 2019.
Kao i kod drugih nomenklaturnih kodeksa, pravila FiloKoda su organizirana kao članci, koji su zauzvrat organizirani kao poglavlja. Svaki članak može sadržavati i bilješke, primjere i preporuke.
Tabela sadržaja
- Preface Arhivirano 4. 11. 2019. na Wayback Machine (including Literature Cited Arhivirano 23. 9. 2021. na Wayback Machine)
- Preamble Arhivirano 24. 9. 2021. na Wayback Machine
- Division I. Principles Arhivirano 1. 9. 2021. na Wayback Machine
- Division II. Rules Arhivirano 1. 8. 2020. na Wayback Machine
- Chapter I. Taxa Arhivirano 1. 8. 2020. na Wayback Machine (Arts. 1-3)
- Chapter II. Publication Arhivirano 15. 6. 2021. na Wayback Machine (Arts. 4-5)
- Chapter III. Names Arhivirano 1. 9. 2021. na Wayback Machine (Arts. 6-8)
- Chapter IV. Clade Names Arhivirano 25. 6. 2020. na Wayback Machine (Arts. 9-11)
- Chapter V. Selection of Established Names Arhivirano 1. 9. 2021. na Wayback Machine (Arts. 12-15)
- Chapter VI. Provisions for Hybrids Arhivirano 22. 9. 2021. na Wayback Machine (Art. 16)
- Chapter VII. Orthography Arhivirano 22. 9. 2021. na Wayback Machine (Arts. 17-18)
- Chapter VIII. Authorship of Names Arhivirano 3. 6. 2021. na Wayback Machine (Art. 19)
- Chapter IX. Citation of Authors and Registration Numbers Arhivirano 22. 9. 2021. na Wayback Machine (Art. 20)
- Chapter X. Species Names Arhivirano 28. 9. 2021. na Wayback Machine (Art. 21)
- Chapter XI. Governance Arhivirano 1. 9. 2021. na Wayback Machine (Art. 22)
- Glossary Arhivirano 20. 11. 2017. na Wayback Machine
- Tables Arhivirano 1. 9. 2021. na Wayback Machine
- Appendices Arhivirano 27. 11. 2018. na Wayback Machine
- Appendix A. Registration Procedures and Data Requirements Arhivirano 27. 11. 2018. na Wayback Machine
- Appendix B. Code of Ethics Arhivirano 24. 9. 2021. na Wayback Machine
Jednom implementiran, FiloKod će biti povezan s registracijom baze podataka zvanom RegNum, koja će pohraniti sva imena kladusa i definicije koje će se smatrati prihvatljivim.[12] Očekuje se da će ovo pružiti javno upotrebljiv alat za pridruživanje imena kladusa definicijama, koji se zatim mogu povezati sa grupsms subtakson ili primjercima putem filogenijske baze podataka stabala (poput TreeBASE).
Kao što je planirano, međutim. najvažnija upotreba RegNum-a bit će odluka koja će se smatrati prihvaćenom jednog od niza sinonima ili homonima: onaj s najmanjim registracijskim brojem, osim u slučajevima konzervacije.
Wikiwand in your browser!
Seamless Wikipedia browsing. On steroids.
Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.
Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.
