MIR494

MikroRNK 494 je sekvenca mikroRNK koja je kod ljudi kodirana genom MIR494.^[3]

MIR494
Identifikatori
Aliasi	MIR494
Vanjski ID-jevi	OMIM: 616036 GeneCards: MIR494
Lokacija gena (čovjek) Hrom. Hromosom 14 (čovjek)[1] Bend 14q32.31 Početak 101,029,634 bp[1] Kraj 101,029,714 bp[1]
Ortolozi
Vrste	Čovjek	Miš
Entrez	574452	n/a
Ensembl	ENSG00000194717	n/a
UniProt	n a	n/a
RefSeq (mRNK)	n/a	n/a
RefSeq (bjelančevina)	n/a	n/a
Lokacija (UCSC)	Chr 14: 101.03 – 101.03 Mb	n/a
PubMed pretraga	[2]	n/a
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjek

Hartz (2014) mapirala je gen MIR494 u hromosomu 14, sekvenca q32.31, na osnovu poravnavanja zrele sekvence MIR494-3p (UGAAACAUACA
CGGGAAACCUC) sa genomskom sekvencom (GRCh38).^[4]

Opis

MikroRNK (miRNK) su približno 22-nukleotidne nekodirajuće molekule RNK koje su sastavne komponente argonauta, koji sadrže RNK-inducirane komplekse za utišavanje (RISC). Kao dio RISC-a, miRNK potiskuju ekspresiju gena, interakcijom s ciljnim iRNK i smanjenjem stabilnosti i/ili translacije iRNK (sažetak Tominaga et al., 2011).^[5]

Kloniranje i ekspresija

Yamamoto et al. (2012) izvijestili su da je ekspresija Mir494 skromna u masnom tkivu bijelog laboratorijskog miša, ali vrlo malo u srcu, jetri i smeđem masnom tkivu.^[6]

Funkcija

Yamamoto et al. (2012) primijetili su pojačanu ekspresiju Foxj3 i mitohondrijskog transkripcijskog faktora A (mtTFA, ili TFAM;) u diferenciranim miocitima C2C12 miša, istovremeno s smanjenom regulacijom Mir494. Studije nokdauna i prekomjerne ekspresije sa analizama Western blot-a, mikromreža i reporter-gena pokazale su da je Mir494 smanjio translaciju Foxj3 i mtTFA iRNK u proliferirajućim C2C12 mioblastima vezujući se za konzervirane ciljne sekvence u njihovim 3-prim UTR-ima. Mir494 nije uzrokovao degradaciju iRNK. Vježba izdržljivosti kod miševa stimulirala je mitohondrijsku biogenezu u skeletnim mišićima, istovremeno s smanjenom ekspresijom Mir494 i povišenom ekspresijom Foxj3 i mtTFA. Zaključili su da FOXJ3 i mtTFA promoviraju mitohondrijsku biogenezu i da MIR494 inhibira njihovu ekspresiju i aktivnost. Nukleolin funkcionira u jedarcetu da regulira sazrijevanje i preradu ribosomske RNK, a u citoplazmi da regulira stabilizaciju i translaciju iRNK. Tominaga et al. (2011) otkrili su da su se MIR494 i HuR (ELAVL1) takmičili za vezivanje za 3-prim UTR NCL transkripta u HeLa ćelijama. MIR494 inhibirao je translaciju NCL ciljanjem NCL na tijela koja obrađuju RNK. Suprotno tome, HuR je promovirao NCL prijevod ciljajući transkript na polisomima. Niti jedan regulator nije promijenio sadržaj NCL iRNK.

Zhou et al. (2014) identificirali su MIR494-vezujuće mesto u 3-glavnom UTR transkriptu CDKAL1 i njegovom alternativno prerađenom transkriptu, CDKAL1v1. Ekspresija MIR494 oponaša smanjenu ekspresiju i CDKAL1 i CDKAL1v1, dok je ekspresija inhibitora MIR494 imala suprotan učinak.^[7]

Yamamoto et al. (2012) primijetili su pojačanu ekspresiju Foxj3 i mitohondrijskog transkripcijskog faktora A (mtTFA, ili TFAM;) u diferenciranim miocitima C2C12 miša, istovremeno s smanjenom regulacijom Mir494. Studije nokdauna i prekomjerne ekspresije sa analizama Western blot-a, mikromreža i reporter-gena pokazale su da je Mir494 smanjio translaciju Foxj3 i mtTFA iRNK u proliferirajućim C2C12 mioblastima vezujući se za konzervirane ciljne sekvence u njihovim 3-prim UTR-ima. Mir494 nije uzrokovao degradaciju iRNK. Vježba izdržljivosti kod miševa stimulirala je mitohondrijsku biogenezu u skeletnim mišićima, istovremeno s smanjenom ekspresijom Mir494 i povišenom ekspresijom Foxj3 i mtTFA. Zaključili su da FOXJ3 i mtTFA promoviraju mitohondrijsku biogenezu i da MIR494 inhibira njihovu ekspresiju i aktivnost. Nukleolin funkcionira u jedarcetu da regulira sazrijevanje i preradu ribosomske RNK, a u citoplazmi da regulira stabilizaciju i translaciju iRNK. Tominaga et al. (2011) otkrili su da su se MIR494 i HuR (ELAVL1) takmičili za vezivanje za 3-prim UTR NCL transkripta u HeLa ćelijama. MIR494 inhibirao je translaciju NCL ciljanjem NCL na tijela koja obrađuju RNK. Suprotno tome, HuR je promovirao NCL prijevod ciljajući transkript na polisomima. Niti jedan regulator nije promijenio sadržaj NCL iRNK.

Zhou et al. (2014) identificirali su MIR494-vezujuće mesto u 3-glavnom UTR transkriptu CDKAL1 i njegovom alternativno prerađenom transkriptu, CDKAL1v1. Ekspresija MIR494 oponaša smanjenu ekspresiju i CDKAL1 i CDKAL1v1, dok je ekspresija inhibitora MIR494 imala suprotan učinak.^[7]

MikroRNK (miRNK) su kratke (20–24 nukleotidne) nekodirajuće RNK koje su uključene u posttranskripcijsku regulaciju ekspresije gena u višećelijskim organizmima koji utiču i na stabilnost i na translaciju iRNK. miRNK se transkribiraju pomoću RNK-polimeraze II, kao dio zatvorenih i poliadeniliranih primarnih transkripata (pri-miRNK) koji mogu biti protein-kodirajući ili nekodirajući. Primarni transkript se cijepa enzimom Drosha ribonukleaza III da bi se proizvela prekursor miRNK matične petlje sa približno 70 nukleotida (pre-miRNK), koja se dalje cijepa citoplazmatskim Dicer ribonukleazom za stvaranje zrelih proizvoda miRNK i antisens miRNK* ("zvjezdica mi-RNK"). Zrela miRNK ugrađena je u RNK-inducirani kompleks za utišavanje (RISC), koji prepoznaje ciljane miRNK putem nesavršenog uparivanja baza sa miRNK i najčešće rezultira translacijskom inhibicijom ili destabilizacijom ciljne mRNK. Ovaj RefSeq predstavlja predviđenu matičnu petlju mikroRNK.^[3]

Reference

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000194717 - Ensembl, maj 2017
2. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
3. "Entrez Gene: MicroRNA 494". Pristupljeno 19. 10. 2017.
4. Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 9/26/2014.
5. Tominaga, K., Srikantan, S., Lee, E. K., Subaran, S. S., Martindale, J. L., Abdelmohsen, K., Gorospe, M. Competitive regulation of nucleolin expression by HuR and miR-494. Molec. Cell. Biol. 31: 4219-4231, 2011. PubMed: 21859890
6. Yamamoto, H., Morino, K., Nishio, Y., Ugi, S., Yoshizaki, T., Kashiwagi, A., Maegawa, H. MicroRNA-494 regulates mitochondrial biogenesis in skeletal muscle through mitochondrial transcription factor A and forkhead box j3. Am. J. Physiol. Endocr. Metab. 303: E1419-E1427, 2012. Note: Electronic Article. PubMed: 23047984
7. Zhou, B., Wei, F.-Y., Kanai, N., Fujimura, A., Kaitsuka, T., Tomizawa, K. Identification of a splicing variant that regulates type 2 diabetes risk factor CDKAL1 level by a coding-independent mechanism in human. Hum. Molec. Genet. 23: 4639-4650, 2014. PubMed: 24760768

Dopunska literatura

• Diakos C, Zhong S, Xiao Y, Zhou M, Vasconcelos GM, Krapf G, Yeh RF, Zheng S, Kang M, Wiencke JK, Pombo-de-Oliveira MS, Panzer-Grümayer R, Wiemels JL (decembar 2010). "TEL-AML1 regulation of survivin and apoptosis via miRNA-494 and miRNA-320a". Blood. 116 (23): 4885–93. doi:10.1182/blood-2009-02-206706. PMC 3265147. PMID 20807887.
• Olaru AV, Ghiaur G, Yamanaka S, Luvsanjav D, An F, Popescu I, Alexandrescu S, Allen S, Pawlik TM, Torbenson M, Georgiades C, Roberts LR, Gores GJ, Ferguson-Smith A, Almeida MI, Calin GA, Mezey E, Selaru FM (decembar 2011). "MicroRNA down-regulated in human cholangiocarcinoma control cell cycle through multiple targets involved in the G1/S checkpoint". Hepatology. 54 (6): 2089–98. doi:10.1002/hep.24591. PMC 3212606. PMID 21809359.
• Tominaga K, Srikantan S, Lee EK, Subaran SS, Martindale JL, Abdelmohsen K, Gorospe M (oktobar 2011). "Competitive regulation of nucleolin expression by HuR and miR-494". Molecular and Cellular Biology. 31 (20): 4219–31. doi:10.1128/MCB.05955-11. PMC 3187287. PMID 21859890.
• Megiorni F, Cialfi S, Dominici C, Quattrucci S, Pizzuti A (2011). "Synergistic post-transcriptional regulation of the Cystic Fibrosis Transmembrane conductance Regulator (CFTR) by miR-101 and miR-494 specific binding". PLOS ONE. 6 (10): e26601. Bibcode:2011PLoSO...626601M. doi:10.1371/journal.pone.0026601. PMC 3197680. PMID 22028919.
• Kim WK, Park M, Kim YK, Tae YK, Yang HK, Lee JM, Kim H (decembar 2011). "MicroRNA-494 downregulates KIT and inhibits gastrointestinal stromal tumor cell proliferation". Clinical Cancer Research. 17 (24): 7584–94. doi:10.1158/1078-0432.CCR-11-0166. PMID 22042971.
• Ohdaira H, Sekiguchi M, Miyata K, Yoshida K (februar 2012). "MicroRNA-494 suppresses cell proliferation and induces senescence in A549 lung cancer cells". Cell Proliferation. 45 (1): 32–8. doi:10.1111/j.1365-2184.2011.00798.x. PMC 6496138. PMID 22151897.
• Yamanaka S, Campbell NR, An F, Kuo SC, Potter JJ, Mezey E, Maitra A, Selaru FM (juli 2012). "Coordinated effects of microRNA-494 induce G₂/M arrest in human cholangiocarcinoma". Cell Cycle. 11 (14): 2729–38. doi:10.4161/cc.21105. PMC 3409013. PMID 22785131.
• Altmäe S, Martinez-Conejero JA, Esteban FJ, Ruiz-Alonso M, Stavreus-Evers A, Horcajadas JA, Salumets A (mart 2013). "MicroRNAs miR-30b, miR-30d, and miR-494 regulate human endometrial receptivity". Reproductive Sciences. 20 (3): 308–17. doi:10.1177/1933719112453507. PMC 4077381. PMID 22902743.
• Romano G, Acunzo M, Garofalo M, Di Leva G, Cascione L, Zanca C, Bolon B, Condorelli G, Croce CM (oktobar 2012). "MiR-494 is regulated by ERK1/2 and modulates TRAIL-induced apoptosis in non-small-cell lung cancer through BIM down-regulation". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 109 (41): 16570–5. Bibcode:2012PNAS..10916570R. doi:10.1073/pnas.1207917109. PMC 3478630. PMID 23012423.