![cover image](https://wikiwandv2-19431.kxcdn.com/_next/image?url=https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/16/PDB_1lyb_EBI.jpg/640px-PDB_1lyb_EBI.jpg&w=640&q=50)
Aspartil proteaza
From Wikipedia, the free encyclopedia
Aspartil proteaze ili aspartat proteaze EC 3.4.23 su katalitski tip proteaznih enzima, koji koriste aktivirane molekule vode vezane za jedan ili više aspartatnih ostataka. Kataliziraju razgradnju peptidnih supstrata. U principu, oni u aktivnom mjestu imaju dva visoko konzervirania aspartata, a optimalno su aktivne u kiselom pH. Gotovo sve poznate aspartil proteaze se inhibiraju pepstatinom.[2][3]
Eukariotska aspartil proteaza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
![]() Strukture prirodne i inhibirane forme ljudskog kaatepsina D[1] | |||||||||
Identifikatori | |||||||||
Simbol | Asp | ||||||||
Pfam | PF00026 | ||||||||
InterPro | IPR001461 | ||||||||
PROSITE | PDOC00128 | ||||||||
SCOP2 | 1mpp / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
OPM superporodica | 108 | ||||||||
OPM protein | 1lyb | ||||||||
|
Karakterizirane su aspartat endopeptidaze kičmenjačkog, gljivičnog i retrovirusnog porijekla.[4] Opisano je Više današnjih aspartil endopeptidaza asociranih sa procesuirajućim bakterijskim tipom 4 prepilina[5] i arheanskog preflagelina.[6][7]
Eukariotske asparaginske proteaze uključuju pepsine, katepsine i renina e. Oni imaju dvodomensku strukturu, koja proizlazi iz predačke duplikacije. HIV-1 retrovirusna proteaza i retrotranspozonska proteaza (PF00077) su znatno manji, a čini se da mogu biti homologni jednoj domeni eukariotskih aspartil proteaza. Svaka domena doprinosi katalitički Asp ostatak, s proširenom aktivnom pukotinom, lokaliziranom između dva molekulska režnja. Jedan režanj je vjerojatno evoluirao iz drugih duplikacijom gena u dalekoj prošlosti. U današnjem enzimu, iako su trodimenzijske strukture vrlo slične, sekvence aminokiselina su divergentne, osim motiva katalitičkog mjesta, koji je vrlo očuvan. Prisustvo i položaj disulfidnih i drugih mostova su konzervirana obilježja asparaginske peptidaze