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兩個胺基酸透過肽鍵生成合為一個二肽,此稱縮合反應。在縮合反應中,兩個胺基酸靠近對方,羧基與氨基相互接近,一個會失去在羧基()上的一氫一氧,另一個則會失去氨基()上的一氫。此反應生成一分子的水() 及被肽鍵()連結的胺基酸,其連結的氨基酸被稱為二肽。
在肽鍵生成時,一胺基酸的羧基會與另一個胺基酸的氨基反應,失去一分子的水(),故過程為脫水反應(也名為脫水縮合)。
形成肽鍵需消耗能量,因而在生物體內,會由ATP提供。[1]肽鍵連結形成的胺基酸鍊會成為多肽與蛋白質。 生物體使用酵素及核糖酶,製造多肽和蛋白質。胜肽由專屬的酶製成,舉例而言,藉由兩種酵素(γ谷氨酰半胱氨酸合成酶、谷氨醯胺合成酶)及兩步驟,可生成三肽的穀胱甘肽。[2][3]
藉由水解便可讓肽鍵斷裂,分解並釋放8–16千焦耳/莫耳(2–4卡/莫耳)[4]的自由能,但這過程相當緩慢。而在活體中,此過程可被酵素催化使反應加速,肽酶與蛋白酶即具有此功能。
由於共振穩定,以生理條件而言是相對穩定,甚至勝過類似的化合物,如酯類。肽鍵在化學反應下可以保持不變,通常會透過陰電性原子攻擊羰基碳,打斷羰基雙鍵形成四面體。這是蛋白水解的過程,而且更常發生在、酰基的交換反應中,好比內含蛋白。