1994年，以色列將大部分加沙地带的自治權交給巴勒斯坦民族權力機構（法塔赫）。[6]
2005年之前，加沙地带69%的土地与西岸的部分地區由巴勒斯坦民族权力机构管理，其他部分（主要是以色列公民居住的地方）则由以色列管理。由于巴勒斯坦民族权力机构不允许拥有正规军，治安由巴勒斯坦的公共治安队和民警负责。
2005年2月，以色列政府决定在夏天将以色列军队撤出加沙地带，并放弃所有以色列在加沙地带的定居点。撤军后，以色列将依然控制加沙地带的海岸线，以及加沙地带与埃及之间的一个狭长区域。但以色列国内对撤军计划有很大分歧。
2005年8月15日，以色列关闭加沙古什·卡提夫犹太定居点，正式撤出加沙。邊境、海岸與領空依舊被以色列控制。
由於穆斯林居民在2006年巴勒斯坦立法委員會选举出的哈馬斯政权堅持消滅以色列，因此加沙地带的邊境、海岸與領空依舊被以色列重重封鎖，水電基礎設施的使用權亦依然被以色列嚴密管控[7]。
2007年6月，哈马斯通過加沙之战从法塔赫手中夺得加沙地带的控制权，自此法塔赫仅控制约旦河西岸地区，而加沙地带由哈马斯控制[8]。以色列從此開始嚴密封鎖加沙地带，埃及亦關閉加沙地带南部的邊界，居民只能依靠救濟和從與埃及間的地道掙扎求生。國際救援組織前往加沙的援助車隊則常在埃及受到阻撓，然而2010年5月的以色列軍隊襲擊援助加沙船隊的加沙船隊衝突帶來了更多變數[9]。
2008年加沙戰爭，哈馬斯向以色列境內目標發射火箭彈和迫擊炮，以色列则摧毀了包括警察局、監獄和哈馬斯指揮中心等450個哈馬斯目標。同時以色列北部也受到來自黎巴嫩方向發射的火箭彈襲擊。空襲持續一週後，以色列於次年1月3日派出地面部隊進入加沙地帶。
2012年雲柱行動，以色列國防軍於11月14日開始在加沙地帶展開的軍事行動，以報復此前哈馬斯方面對以色列南部城鎮的襲擊。
2012年，加沙地带與約旦河西岸地区作为巴勒斯坦國正式被聯合國接納為觀察員國。[10]
2014年以巴衝突，以色列发动对加沙的大規模空襲，7月8日起在哈馬斯統治加沙地帶展開軍事行動，在衝突進行了50天後，以色列與巴勒斯坦抵抗组织哈马斯已同意埃及提出的方案，從格林威治時間26日16時開始在加沙實施無限期停火，為50天來造成超過2,100多人死亡的加沙戰事畫下句号。
2011年5月，经埃及斡旋，法塔赫和哈马斯在埃及开罗签署和解协议。2012年2月，双方在卡塔尔签署《多哈协议》。2014年4月，双方宣布执行上述和解协议，但未能落实。
2017年9月17日，哈马斯宣布解散掌握加沙地带管理权的“行政委员会”，同意由巴勒斯坦政府接管加沙地带并行使行政权。9月25日，巴勒斯坦政府发言人优素福·穆罕默德在拉姆安拉宣布，巴勒斯坦总理拉米·哈马达拉与总统阿巴斯协商后决定，巴勒斯坦政府将于10月3日在加沙地带召开政府每周例会，而哈姆达拉和部分政府部长将在10月2日进入加沙地带，以便与控制加沙地带的哈马斯进行权力交接[8]，由此加沙地帶的公務員工資將由巴勒斯坦民族權力機構支付。[11]10月12日，雙方簽署和解協議，但其後未能履行該協議。
2018至19年，大批巴勒斯坦人聚集在加沙边境示威，要求以色列当局让原居于以色列的巴勒斯坦人及其后代享有返回故乡定居的权利。
2021年5月，巴勒斯坦人再与以色列发生军事冲突。冲突起因是巴勒斯坦抗议者与以色列警方在东耶路撒冷谢赫·贾拉社区发生的冲突，引发以色列警方突袭位于圣殿山的阿克萨清真寺，造成约300名巴勒斯坦人受伤，从而引爆双方的军事冲突。后来在埃及的斡旋下，双方达成停火协议。
2022年破晓行动，以色列国防军在约旦河西岸以色列占领区的杰宁逮捕杰哈德领导人巴萨姆·萨阿迪，并先发制人地向加沙的武装分子和基础设施发动空袭。后来又经埃及调停，双方再次停火。
2023年10月，巴勒斯坦武裝組織哈瑪斯無預警發動代號為阿克薩洪水的恐怖襲擊，從加沙發射逾5,000枚火箭彈襲擊以色列，並派員進入其南部領土。[12][13][14][15]
2023年12月，阿拉伯國家在聯合國安理會提案呼籲在加沙停火，但因美國行使否決權而未能通過決議。巴勒斯坦衛生部發言人表示，加沙巴人死亡人數已上升至17997人，受傷人數達到49229人。[16]
2024年3月25日，聯合國安理會以14票贊成、1票棄權通過決議，要求以色列與哈瑪斯於穆斯林齋戒月期間在加薩立即停火，並釋放所有人質。[17][18]
