川苔草科又名河苔草科或川草科，共有48属约270种，分布在全世界的热带和亚热带地区。中国有3属共3种，分布在云南和福建，是被保护物种。
本科植物为水生草本；植物体退化成扁平或枝状的叶状体，形似苔、藓、藻类或地衣，生长在河流甚至湍急的瀑布中，一年生或多年生，没有根，有时有根状物附着在水中的石头上。
1981年的克朗奎斯特分类法单独设立一个川苔草目，属于蔷薇亚纲，1998年根据基因亲缘关系分类的APG 分类法认为无法放在任何一个目中，直接放在蔷薇分支之下，并分出一个三裂科，2003年经过修订的APG II 分类法将三裂科合并到本科，一同放在金虎尾目中。
- Angolaea Wedd.
- Apinagia Tul.
- Butumia G.Taylor
- Castelnavia Tul. & Wedd.
- Ceratolacis (Tul.) Wedd.
- 飞瀑草属 Cladopus H.Moeller
- 川藻属 Dalzellia Wight
- Devillea Tul. & Wedd.
- Dicraeanthus Engl.
- Dicraeia Thouars
- Diplobryum C.Cusset
- Djinga C.Cusset
- Endocaulos C.Cusset
- Farmeria Willis ex Trimen
- Griffithella (Tul.) Warm.
- Heterotristicha Tobler
- 水石衣属 Hydrobryum Endl.
- Indotristicha P.Royen
- Jenmaniella Engl.
- Ledermanniella Engl.
- Leiothylax Warm.
- Letestuella G.Taylor
- Lonchostephus Tul.
- Lophogyne Tul.
- Macarenia P.Royen
- Macropodiella Engl.
- Malaccotristicha C.Cusset & G.Cusset
- Marathrum Bonpl.
- Mniopsis Mart. & Zucc.
- Monostylis Tul.
- 木海拉属 Mourera Aubl.
- Oserya Tul. & Wedd.
- Paleodicraeia C.Cusset
- 川苔草属 Podostemum Michx.
- Pohliella Engl.
- Polypleurella Engl.
- Polypleurum (Tul.) Warm.
- Rhyncholacis Tul.
- Saxicolella Engl.
- Sphaerothylax Bisch. ex Krauss
- Stonesia G.Taylor
- Thelethylax C.Cusset
- Torrenticola Domin
- 三裂属 Tristicha Thouars
- Tulasneantha P.Royen
- Weddellina Tul.
- Wettsteiniola Suess.
- Willisia Warm.
- Winklerella Engl.
- Zehnderia C.Cusset
