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国家级畜禽遗传资源保护名录，是中华人民共和国农业部为对原产中国的珍贵、稀有、濒危的畜禽遗传资源实行重点保护而制定并公布的畜禽品种名录。2006年确定畜禽品种138个[1]。2014年修订《国家级畜禽遗传资源保护名录》，国家级保护品种从138个增加到159个[2]。2020年，农业农村部公布《国家畜禽遗传资源目录》，首次明确了家养畜禽种类33种，包括其地方品种、培育品种、引入品种及配套系[3]。2021年，国家畜禽遗传资源委员会办公室发布《国家畜禽遗传资源品种名录（2021年版）》。
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- 马身猪
- 河套大耳猪
- 民猪
- 枫泾猪
- 浦东白猪
- 东串猪
- 二花脸猪
- 淮猪（淮北猪、山猪、灶猪、定远猪、皖北猪、淮南猪）
- 姜曲海猪
- 梅山猪
- 米猪
- 沙乌头猪
- 碧湖猪
- 岔路黑猪
- 金华猪
- 嘉兴黑猪
- 兰溪花猪
- 嵊县花猪
- 仙居花猪
- 安庆六白猪
- 院南黑猪
- 圩猪
- 皖浙花猪
- 官庄花猪
- 槐猪
- 闽北花猪
- 莆田猪
- 武夷黑猪
- 滨湖黑猪
- 赣中南花猪
- 杭猪
- 乐平猪
- 玉江猪
- 大蒲莲猪
- 莱芜猪
- 南阳黑猪
- 确山黑猪
- 清平猪
- 阳新猪
- 大围子猪
- 华中两头乌猪（沙子岭猪、监利猪、通城猪、赣西两头乌猪、东山猪）
- 宁乡猪
- 黔邵花猪
- 湘西黑猪
- 大花白猪
- 蓝塘猪
- 粤东黑猪
- 巴马香猪
- 德保猪
- 桂中花猪
- 两广小花猪（陆川猪、广东小耳花猪、墩头猪）
- 隆林猪
- 海南猪
- 五指山猪
- 荣昌猪
- 成华猪
- 湖川山地猪（恩施黑猪、盆周山地猪、合川黑猪、罗盘山猪、渠溪猪、丫杈猪)
- 内江猪
- 乌金猪（柯乐猪、大河猪、昭通猪、凉山猪）
- 雅南猪
- 白洗猪
- 关岭猪
- 江口萝卜猪
- 黔北黑猪
- 黔东花猪
- 香猪
- 保山猪
- 高黎贡山猪
- 明光小耳猪
- 滇南小耳猪
- 撒坝猪
- 藏猪（西藏藏猪、迪庆藏猪、四川藏猪、合作猪）
- 汉江黑猪
- 八眉猪
- 兰屿小耳猪
- 桃园猪
- 烟台黑猪
- 五莲黑猪
- 沂蒙黑猪
- 里岔黑猪
- 深县猪
- 丽江猪
- 枣庄黑盖猪
- 光明猪配套系
- 深农猪配套系
- 冀合白猪配套系
- 中育猪配套系
- 华农温氏I号猪配套系
- 滇撒猪配套系
- 鲁农I号猪配套系
- 渝荣I号猪配套系
- 天府肉猪
- 龙宝1号猪
- 川藏黑猪
- 江泉白猪配套系
- 温氏WS501猪配套系
- 湘沙猪
- 斯格猪
- 皮埃西猪
- 秦川牛（早胜牛）
- 南阳牛
- 鲁西牛
- 晋南牛
- 延边牛
- 冀南牛
- 太行牛
- 平陆山地牛
- 蒙古牛
- 复州牛
- 徐州牛
- 温岭高峰牛
- 舟山牛
- 大别山牛
- 皖南牛
- 闽南牛
- 广丰牛
- 吉安牛
- 锦江牛
- 渤海黑牛
- 蒙山牛
- 郏县红牛
- 枣北牛
- 巫陵牛
- 雷琼牛
- 隆林牛
- 南丹牛
- 涠洲牛
- 巴山牛
- 川南山地牛
- 峨边花牛
- 甘孜藏牛
- 凉山牛
- 平武牛
- 三江牛
- 关岭牛
- 黎平牛
- 威宁牛
- 务川黑牛
- 邓川牛
- 迪庆牛
- 滇中牛
- 文山牛
- 云南高峰牛
- 昭通牛
- 阿沛甲咂牛
- 曰喀则驼峰牛
- 西藏牛
- 樟木牛
- 柴达木牛
- 哈萨克牛
- 台湾牛
- 阿勒泰白头牛
- 皖东牛
- 夷陵牛
- 中国荷斯坦牛
- 中国西门塔尔牛
- 三河牛
- 新疆褐牛
- 中国草原红牛
- 夏南牛
- 延黄牛
- 辽育白牛
- 蜀宣花牛
- 云岭牛
- 海子水牛
- 盱眙山区水牛
- 温州水牛
- 东流水牛
- 江淮水牛
- 福安水牛
- 鄱阳湖水牛
- 峡江水牛
- 信丰山地水牛
- 信阳水牛
- 恩施山地水牛
- 江汉水牛
- 滨湖水牛
- 富钟水牛
- 西林水牛
- 兴隆水牛
- 德昌水牛
- 涪陵水牛
- 宜宾水牛
- 贵州白水牛
- 贵州水牛
- 槟榔江水牛
- 德宏水牛
- 滇东南水牛
- 盐津水牛
- 陕南水牛
- 上海水牛
- 摩拉水牛
- 尼里-拉菲水牛
- 地中海水牛
- 九龙牦牛
- 麦洼牦牛
- 木里牦牛
- 中甸牦牛
- 娘亚牦牛
- 帕里牦牛
- 斯布牦牛
- 西藏高山牦牛
- 甘南牦牛
- 天祝白牦牛
- 青海高原牦牛
- 巴州牦牛
- 金川牦牛
- 昌台牦牛
- 类乌齐牦牛
- 环湖牦牛
- 雪多牦牛
- 玉树牦牛
- 大通牦牛
- 阿什旦牦牛
- 新疆细毛羊
- 东北细毛羊
- 内蒙古细毛羊
- 甘肃高山细毛羊
- 敖汉细毛羊
- 中国美利奴羊
- 中国卡拉库尔羊
- 云南半细毛羊
- 新吉细毛羊
- 巴美肉羊
- 彭波半细毛羊
- 凉山半细毛羊
- 青海毛肉兼用细毛羊
- 青海高原毛肉兼用半细毛羊
- 鄂尔多斯细毛羊
- 呼伦贝尔细毛羊
- 科尔沁细毛羊
- 乌兰察布细毛羊
- 兴安毛肉兼用细毛羊
- 内蒙古半细毛羊
- 陕北细毛羊
- 昭乌达肉羊
- 察哈尔羊
- 苏博美利奴羊
- 高山美利奴羊
- 象雄半细毛羊
- 鲁西黑头羊
- 乾华肉用美利奴羊
- 戈壁短尾羊
- 鲁中肉羊
- 草原短尾羊
- 黄淮肉羊
- 夏洛来羊
- 考力代羊
- 澳洲美利奴羊
- 德国肉用美利奴羊
- 萨福克羊
- 无角陶赛特羊
- 特克赛尔羊
- 杜泊羊
- 白萨福克羊
- 南非肉用美利奴羊
- 澳洲白羊
- 东佛里生羊
- 南丘羊
- 西藏山羊
- 新疆山羊
- 内蒙古绒山羊
- 辽宁绒山羊
- 承德无角山羊
- 吕梁黑山羊
- 太行山羊
- 乌珠穆沁白山羊
- 长江三角洲白山羊
- 黄淮山羊
- 戴云山羊
- 福清山羊
- 闽东山羊
- 赣西山羊
- 广丰山羊
- 尧山白山羊
- 济宁青山羊
- 莱芜黑山羊
- 鲁北白山羊
- 沂蒙黑山羊
- 伏牛白山羊
- 麻城黑山羊
- 马头山羊
- 宜昌白山羊
- 湘东黑山羊
- 雷州山羊
- 都安山羊
- 隆林山羊
- 渝东黑山羊
- 大足黑山羊
- 酉州乌羊
- 白玉黑山羊
- 板角山羊
- 北川白山羊
- 成都麻羊
- 川东白山羊
- 川南黑山羊
- 川中黑山羊
- 古蔺马羊
- 建昌黑山羊
- 美姑山羊
- 贵州白山羊
- 贵州黑山羊
- 黔北麻羊
- 凤庆无角黑山羊
- 圭山山羊
- 龙陵黄山羊
- 罗平黄山羊
- 马关无角山羊
- 弥勒红骨山羊
- 宁蒗黑头山羊
- 云岭山羊
- 昭通山羊
- 陕南白山羊
- 子午岭黑山羊
- 河西绒山羊
- 柴达木山羊
- 中卫山羊
- 牙山黑绒山羊
- 威信白山羊
- 关中奶山羊
- 崂山奶山羊
- 南江黄羊
- 陕北白绒山羊
- 文登奶山羊
- 柴达木绒山羊
- 雅安奶山羊
- 罕山白绒山羊
- 晋岚绒山羊
- 简州大耳羊
- 云上黑山羊
- 疆南绒山羊
- 萨能奶山羊
- 安哥拉山羊
- 波尔山羊
- 努比亚山羊
- 阿尔卑斯奶山羊
- 吐根堡奶山羊
- 阿巴嘎黑马
- 鄂伦春马
3•蒙古马
- 三河马
- 金州马
- 铁岭挽马
- 吉林马
- 关中马
- 渤海马
- 山丹马
- 伊吾马
- 锡林郭勒马
- 科尔沁马
- 张北马
- 新丽江马
- 伊犁马
- 太行驴
- 阳原驴
- 广灵驴
- 晋南驴
- 临县驴
- 库伦驴
- 泌阳驴
- 庆阳驴
- 苏北毛驴
- 淮北灰驴
- 德州驴
- 长垣驴
- 云南驴
- 西藏驴
- 关中驴
- 佳米驴
- 陕北毛驴
- 凉州驴
- 青海毛驴
- 西吉驴
- 和田青驴
- 吐鲁番驴
- 新疆驴
- 阿拉善双峰驼
- 苏尼特双峰驼
- 青海胳5它
- 新疆塔里木双峰驼
- 新疆准噶尔双峰驼
- 福建黄兔
- 闽西南黑兔
- 万载兔
- 九疑山兔
- 四川白兔
- 云南花兔
- 福建白兔
- 莱芜黑兔
- 中系安哥拉兔
- 浙系长毛兔
- 院系长毛兔
- 苏系长毛兔
- 西平长毛兔
- 吉戎兔
- 哈尔滨大白兔
- 塞北兔
- 豫丰黄兔
- 川白獭兔
- 康大1号肉兔
- 康大2号肉兔
- 康大3号肉兔
- 蜀兴1号肉兔
- 德系安哥拉兔
- 法系安哥拉兔
- 青紫蓝兔
- 比利时兔
- 新西兰白兔
- 加利福尼亚兔
- 力克斯兔
- 德国花巨兔
- 日本大耳白兔
- 伊拉肉兔
- 齐卡肉兔
- 伊普吕肉兔
- 伊高乐肉兔
- 北京油鸡
- 坝上长尾鸡
- 边鸡
- 大骨鸡
- 林甸鸡
- 浦东鸡
- 狼山鸡
- 溧阳鸡
- 鹿苑鸡
- 如皋黄鸡
- 太湖鸡
- 仙居鸡
- 江山乌骨鸡
- 灵昆鸡
- 萧山鸡
- 淮北麻鸡
- 淮南麻黄鸡
- 黄山黑鸡
- 皖北斗鸡
- 五华鸡
- 皖南三黄鸡
- 德化黑鸡
- 金湖乌凤鸡
- 河田鸡
- 闽清毛脚鸡
- 象洞鸡
- 漳州斗鸡
- 安义瓦灰鸡
- 白耳黄鸡
- 崇仁麻鸡
- 东乡绿壳蛋鸡
- 康乐鸡
- 宁都黄鸡
- 丝羽乌骨鸡
- 余干乌骨鸡
- 济宁百日鸡
- 鲁西斗鸡
- 琅琊鸡
- 寿光鸡
- 汶上芦花鸡
- 固始鸡
- 河南斗鸡
- 卢氏鸡
- 淅川乌骨鸡
- 正阳三黄鸡
- 洪山鸡
- 江汉鸡
- 景阳鸡
- 双莲鸡
- 郧阳白羽乌鸡
- 郧阳大鸡
- 东安鸡
- 黄郎鸡
- 桃源鸡
- 雪峰乌骨鸡
- 怀乡鸡
- 惠阳胡须鸡
- 清远麻鸡
- 杏花鸡
- 阳山鸡
- 中山沙栏鸡
- 广西麻鸡
- 广西三黄鸡
- 广西乌鸡
- 龙胜凤鸡
- 霞烟鸡
- 瑶鸡
- 文昌鸡
- 城口山地鸡
- 大宁河鸡
- 峨眉黑鸡
- 旧院黑鸡
- 金阳丝毛鸡
- 泸宁鸡
- 凉山崖鹰鸡
- 米易鸡
- 彭县黄鸡
- 四川山地乌骨鸡
- 石棉草科鸡
- 矮脚鸡
- 长顺绿壳蛋鸡
- 高脚鸡
- 黔东南小香鸡
- 乌蒙乌骨鸡
- 威宁鸡
- 竹乡鸡
- 茶花鸡
- 独龙鸡
- 大围山微型鸡
- 兰坪绒毛鸡
- 尼西鸡
- 瓢鸡
- 腾冲雪鸡
- 他留乌骨鸡
- 武定鸡
- 无量山乌骨鸡
- 西双版纳斗鸡
- 盐津乌骨鸡
- 云龙矮脚鸡
- 藏鸡
- 略阳鸡
- 太白鸡
- 静原鸡
- 海东鸡
- 拜城油鸡
- 和田黑鸡
- 吐鲁番斗鸡
- 麻城绿壳蛋鸡
- 太行鸡
- 广元灰鸡
- 荆门黑羽绿壳蛋鸡
- 富蕴黑鸡
- 天长三黄鸡
- 宁蒗高原鸡
- 沂蒙鸡
- 新狼山鸡
- 新浦东鸡
- 新扬州鸡
- 京海黄鸡
- 雪域白鸡
- 京白939
- 康达尔黄鸡128配套系
- 新杨褐壳蛋鸡配套系
- 江村黄鸡JH-2号配套系
- 江村黄鸡JH-3号配套系
- 新兴黄鸡II号配套系
- 新兴矮脚黄鸡配套系
- 岭南黄鸡I号配套系
- 岭南黄鸡II号配套系
- 京星黄鸡100配套系
- 京星黄鸡102配套系
- 农大3号小型蛋鸡配套系
- 邵伯鸡配套系
- 鲁禽1号麻鸡配套系
- 鲁禽3号麻鸡配套系
- 新兴竹丝鸡3号配套系
- 新兴麻鸡4号配套系
- 粤禽皇2号鸡配套系
- 粤禽皇3号鸡配套系
- 京红1号蛋鸡配套系
- 京粉1号蛋鸡配套系
- 良凤花鸡配套系
- 墟岗黄鸡1号配套系
- 皖南黄鸡配套系
- 皖南青脚鸡配套系
- 皖江黄鸡配套系
- 皖江麻鸡配套系
- 雪山鸡配套系
- 苏禽黄鸡2号配套系
- 金陵麻鸡配套系
- 金陵黄鸡配套系
- 岭南黄鸡3号配套系
- 金钱麻鸡1号配套系
- 南海黄麻鸡1号
- 弘香鸡
- 新广铁脚麻鸡
- 新广黄鸡K996
- 大恒699肉鸡配套系
- 新杨白壳蛋鸡配套系
- 新杨绿壳蛋鸡配套系
- 凤翔青脚麻鸡
- 凤翔乌鸡
- 五星黄鸡
- 金种麻黄鸡
- 振宁黄鸡配套系
- 潭牛鸡配套系
- 三高青脚黄鸡3号
- 京粉2号蛋鸡
- 大午粉1号蛋鸡
- 苏禽绿壳蛋鸡
- 天露黄鸡
- 天露黑鸡
- 光大梅黄1号肉鸡
- 粤禽皇5号蛋鸡
- 桂凤二号黄鸡
- 天农麻鸡配套系
- 新杨黑羽蛋鸡配套系
- 豫粉1号蛋鸡配套系
- 温氏青脚麻鸡2号配套系
- 农大5号小型蛋鸡配套系
- 科朗麻黄鸡配套系
- 金陵花鸡配套系
- 大午金凤蛋鸡配套系
- 京白1号蛋鸡配套系
- 京星黄鸡103配套系
- 栗园油鸡蛋鸡配套系
- 黎村黄鸡配套系
- 凤达1号蛋鸡配套系
- 欣华2号蛋鸡配套系
- 鸿光黑鸡配套系
- 参皇鸡1号配套系
- 鸿光麻鸡配套系
- 天府肉鸡配套系
- 海扬黄鸡配套系
- 肉鸡WOD168配套系
- 京粉6号蛋鸡配套系
- 金陵黑凤鸡配套系
- 大恒799肉鸡
- 神丹6号绿壳蛋鸡
- 大午褐蛋鸡
- 三水白鸭配套系
- 仙湖肉鸭配套系
- 南口1号北京鸭配套系
- Z型北京鸭配套系
- 苏邮1号蛋鸭
- 国绍I号蛋鸭配套系
- 中畜草原白羽肉鸭配套系
- 中新白羽肉鸭配套系
- 神丹2号蛋鸭
- 强英鸭
咔叽•康贝尔鸭
- 奥白星鸭
- 狄高鸭
- 枫叶鸭
- 海加德鸭
- 丽佳鸭
- 南特鸭
- 樱桃谷鸭
- 扬州鹅
- 天府肉鹅
- 江南白鹅配套系
- 莱茵鹅
- 朗德鹅
- 罗曼鹅
- 匈牙利白鹅
- 匈牙利灰鹅
- 霍尔多巴吉鹅
- 石岐鸽
- 塔里木鸽
- 太湖点子鸽
- 天翔1号肉鸽配套系
- 苏威1号肉鸽
- 美国王鸽
- 卡奴鸽
- 银王鸽
(四）引入配套系
- 欧洲肉鸽
- 神丹1号鹌鹑
- 朝鲜鹌鹑
- 迪法克FM系肉用鹌鹑
- 吉林梅花鹿
- 四平梅花鹿
- 敖东梅花鹿
- 东丰梅花鹿
- 兴凯湖梅花鹿
- 双阳梅花鹿
- 西丰梅花鹿
- 东大梅花鹿
- 东北马鹿
- 清原马鹿
- 塔河马鹿
- 伊河马鹿
- 新西兰赤鹿
- 敖鲁古雅驯鹿
- 闽南火鸡
- 尼古拉斯火鸡
- 青铜火鸡
- BUT火鸡
- 贝蒂纳火鸡
- 中国山鸡
- 天峨六画山鸡
- 左家雉鸡
- 申鸿七彩雉
- 美国七彩山鸡
- 中国番鸭
- 温氏白羽番鸭1号
- 克里莫番鸭
- 非洲黑鸵鸟
- 红颈鸵鸟
- 蓝颈鸵鸟
- 吉林白水貂
- 金州黑色十字水貂
- 山东黑褐色标准水貂
- 东北黑褐色标准水貂
- 米黄色水貂
- 金州黑色标准水貂
- 明华黑色水貂
- 名威银蓝水貂
- 银蓝色水貂
- 短毛黑色水貂
- 北美赤狐
- 银黑狐
- 乌苏里貉
- 吉林白貉
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