VMD(英語:Visual molecular dynamics, 可视化分子动力学)是一套分子建模与可视化软件[2],主要用来分析分子动力学模拟的实验数据。同时,软件也包含处理长度与提及相关数据的模块,能可视化与分析轨迹,添加任意图形,并能导出成其他软件能利用的格式例如POV-Ray,PRMan,VRML等。用户能运行Tcl和Python脚本进行批量操作,也可通过Tcl/Tk与其他程序进行交互。VMD能在Unix,MacOS,Microsoft Windows等操作系统下运行[3]。对于非商业用途,VMD通过特定分发协议发布,用户注册后可免费使用和修改源码[4]。
外部链接
参考资料
VMD User's Guide Version 1.9.1 (PDF). Massachusetts Institute of Technology. NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics. [January 29, 2012]. (原始内容 (PDF)存档于2016-06-09).
VMD License. Theoretical and Computational Biophysics Group. NIH Center for Macromolecular Modeling & Bioinformatics, University of Illinois at Urbana–Champaign. [4 January 2016]. (原始内容存档于2022-01-21).