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CPK配色

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CPK配色
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化學中,CPK配色是一種國際通用的原子分子模型的配色方式,也是最常用、最多人使用的分子模型上色方式,可用於各種分子模型元素標示,最常用於球棒模型空間填充模型。該配色方式由CPK模型的設計者Corey、Pauling(萊納斯·鮑林)與Koltun提出且改進。

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一個塑膠製的脯胺酸MolyMod球棒模型。 這些模型通常遵守CPK配色。
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一個依照CPK配色上色的元素週期表

歷史

1952年,科裡和鮑林發表了描述蛋白質和其他生物分子空間填充模型,他們已經在加州理工學院製做出一個模型[1]。他們用硬球表示原子並塗上一些代表性的鮮豔顏色,來表示相應的化學元素。他們的上色模式為:

更多資訊 元素, 用色 ...

他們還建立塑膠球小模型使用搭配同色系的架構。

1965年,Koltun將Corey和鮑林建模技術的改進版本申請專利獲准[2]。在他的專利中,他提到了以下顏色:

更多資訊 元素, 用色 ...

現在常用的CPK配色將色彩更變為:

更多資訊 元素, 用色 ...
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典型的配色

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一箱球棒模型零件,相同顏色代表同一種元素

典型的CPK配色包括:

  (H) 白色
  (C) 黑色
  (N) 深藍色
  (O) 紅色
  (F)、 (Cl) 草綠
  (Br) 紅棕色
  (I) 深紫羅蘭色
  惰性氣體HeNeArKrXe 水藍色
  (P) 橘色
  (S) 黃色
  (B)、大多數過渡金屬 桃色、 鮭魚的顏色
  鹼金屬LiNaKRbCsFr 紫色
  鹼土金屬BeMgCaSrBaRa 深綠色
  (Ti) 灰色
  (Fe) 鐵鏽色
  其他元素 洋紅色

有些CPK顏色是來自於純元素的顏色或該元素的常見化合物的顏色,以便於記憶。例如,是一種無色氣體木炭石墨皆是黑色;常見的黃色的;氯氣是一種綠色氣體溶於乙醚是一個暗紅色液體羅蘭色的;無定形磷紅色鐵鏽暗橙色紅色等。對於一些的顏色,如氧氣氮氣,則來源不可考。也許是因為氧氣燃燒或含氧血液血紅蛋白紅色所以將氧定義成紅色;地球大氣層的主要組成部分,從而出現到人看到的天空天藍色因此將氮設定成藍色。[來源請求]

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化學鍵的顏色

一般化學鍵的顏色會依據鄰近元素上色,若兩端元素相同,則將鍵漆上鄰近原子的顏色,若兩端原子不同,則依照電子雲可能的分佈來決定兩端元素在鍵上上色的比例。有些模型則將鍵統一塗上同一種顏色,常見的顏色為灰色或白色。離子鍵一般不會描繪,另外氫鍵也有人使用黃色的虛線表示[3]

其他的CPK配色方式

下表顯示了一些流行的軟體分配給每個元素的顏色。C列是原始由Corey和鮑林設定的CPK配色[1],K是Koltun的專利[2],J列是由分子可視化的Jmol使用的配色方案[4],R列是Rasmol使用的配色方案,其顯示兩種顏色,第二種表是2.7.3及以後版本所使用的顏色[4][5]。所有的顏色都很相似的,並且可能依賴於顯示硬體和觀看條件。

更多資訊 原子序, 符號 ...
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參見

參考文獻

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