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根莖（英語：Rhizome）是植物的一種變態莖，其外觀似根但具有節的構造，節上可生芽或及不定根；大多在地下水平蔓生，少數在地下呈直立型態，極少數根莖會匍匐於土壤表面；其功能為儲存養分及無性繁殖。根莖有時也被稱作「根狀莖」，除了少數例外，一般屬於一種地下莖。
某些植物的莖部會在土壤中生長形成根莖，在另一些植物中，根莖是唯一的莖。根莖從形態上看有如植物的根，但不具備根部吸收土壤水份和礦物質的作用，也無根冠，而是作為貯藏器官並有無性生殖的作用；塊莖亦有類似功能。根莖從腋芽發育而來，並具有向重力性。根莖還保留允許新梢向上生長的能力[1]。
根莖可以依走向，分為兩型：直立型、匍匐型。一些鳶尾屬品種和蕨類植物甚至具有長出地面的或躺在土壤表面的根莖；具有地下根莖的植物則包括生薑、竹、捕蠅草、錦燈籠、西毒橡樹[2]、啤酒花、六出花屬、石茅、狗牙根和紫色堅果莎草。
根莖若在底下匍匐，一般形成單層水平根莖系統，但在巨型木賊（giant horsetails）根莖可以是多層的，問荊（Equisetum arvense）被發現具有由垂直的根莖連接的五個漸次的水平根莖層。[3]。
如根莖被分割成片，每片有機會長成新的植物個體。由於植物用根莖存儲澱粉、蛋白質和其他營養物質，根莖可以在過冬後形成新梢，而營養成分將被消耗[1]。這種過程稱為營養繁殖，被廣泛運用於植物的大規模繁殖。以這種方式繁殖的植物的例子包括啤酒花、蘆筍、菖蒲、鈴蘭、美人蕉、蘭花、叢生草本植物和竹子等。可作為食材的根莖包括姜、薑黃、高良姜和凹唇姜等。
根莖受到細菌或真菌感染便不適合再種植，往往造成大量農作物損失。因而一般採用人工的組織培養來製備根莖，以提高作物的產量和質量。[4]。植物激素乙烯和茉莉酸（jasmonic acid）有助於促使和調節根莖的生長，尤其是大黃。外部施加的乙烯可影響植物內部乙烯的水平，使乙烯濃度的方便操縱[5]，此發現有助農民和生物學家更易從根莖培養出成長優良的植物。
楊樹（胡楊種）是使用根莖傳播的樹木品種之一，在猶他州的潘多(樹)群體已經存活了約80000年。當地上部分受到昆蟲等覓食者、真菌以及森林火災的威脅時，根莖可使植株免於死亡。
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