方是民（1967年9月28日—），筆名方舟子，福建雲霄人，中華人民共和國科普作家、網路名人，密西根州立大學生物化學博士。
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方舟子是《新語絲》月刊和同名網站的創辦人之一，長期在網際網路上從事對學術造假和學術腐敗的揭露，批判宗教、偽科學、偽氣功、偽環保，批評中醫等。曾為多家平面媒體從事專欄撰稿。2012年擔任互動百科首席科學顧問[2][3]，約一年後離職。
方舟子的言論涉及社會、生活、學界各個領域，由於其在打假過程中範圍廣泛、批評言辭激烈，往往會引起社會各界廣泛關注，造成爭論。方羅之爭中他的批評者羅永浩指責其在打假有誤時常常不願道歉，以及對人對己實行雙重標準[4][5][6][7]。
2014年10月21日晚上，方舟子在社群網站上的帳號幾乎都被刪除。據民間與他本人猜測[8]，這次被大規模刪號很可能是因為他對網路寫手周小平在《黨建網》發表的文章《夢碎美利堅》進行了反駁[9]，而周小平曾於此前不久參加了習近平的文藝工作座談會。[註 1]
生平
1967年9月，方舟子生於福建省龍溪專區雲霄縣（今漳州市雲霄縣）[11]。
1985年，方考入中國科學技術大學生物系，並於1990年獲得細胞生物學士學位。同年，方前往美國，就讀於密西根州立大學，1995年獲得生物化學博士學位。之後，他陸續在羅徹斯特大學生物系、索爾克生物研究所進行博士後研究，方向為分子遺傳學[11]。
1994年，方舟子與張崢等一些海外華人創辦中文網路文化性綜合刊物《新語絲》月刊。起初該刊物通過在「ACT」上貼而發行。之後於1996年建立了「新語絲之友」通訊網、「新語絲」網站等。1997年，一次內部業務討論不一致，編輯部投票的結果方舟子處於少數一方。方舟子懷疑一家商業機構欲藉此事吞併新語絲，因此在投票結束兩天後，在其他編輯不知情的情況下，自行向紐約州政府註冊登記新語絲，建社理事為他與另外兩人。原來的新語絲編輯團隊憤然退出，另外成立了一個網際網路刊物[12]。之後，方舟子開始投入精力運作新語絲社及新語絲網站，發展具有個人特色的網路媒體。
2000年，以新語絲為基地，方舟子開始在網際網路上進行學術打假。他創立「立此存照」欄目，專門揭露科學界、教育界的學術腐敗現象和新聞界各種不實報道。他在引起人們極大關注的同時也引起極大的爭議，並招致多起官司。美國《科學》雜誌在2001年8月10日曾對此進行過報道[14]。
除了打假，方還從事文學與科普創作，在報紙雜誌上發表過大量的文章，還出版過多本著作，目前為自由職業者。
方從博士後時期開始居於美國加利福尼亞州[11]，持有美國綠卡與中國大陸的護照，為中國公民，但身分證和戶口都在出國時按當時規定註銷[15]。曾回中國北京居住近十年，與新華社記者劉菊花結婚，育有一女。2014年10月因批評周小平而遭中國網路封殺後，攜全家回加利福尼亞定居。
主要活動
由於方舟子以自己創辦的新語絲為基地、利用網際網路來進行打假，他被媒體稱為「科學鬥士」或「打假鬥士」。
方舟子打假、批評的對象往往直指中國國家研究部門和高校的著名教授和研究員、行政領導，以及社會各界知名人士等。
受到方舟子質疑造假的公眾人物包括：
- 企業界人士唐駿[16]
- IT人李開復[17]。
- 作家韓寒：方舟子認為韓寒的作品是別人代寫的，並且韓寒在身高上造假，使用了增高鞋和假髮。（參見韓寒被質疑造假事件）
- 節目主持人樂嘉：方舟子稱樂嘉的「性格色彩學」剽竊了美國人Talor Hartman的「性格密碼」學說，而且樂嘉的母校阿姆斯壯大學是野雞學校[18]。
- 「中國雨人」周瑋：方舟子認為擅長速算的智障青年周瑋是騙子[19][20]，其速算答案是背的[21][22]。2014年1月，周瑋經過上海交通大學、華東師範大學專家的測試，聲稱證實了其心算能力的確遠超常人，且並非死記硬背[23]。
- 學者于建嶸：2005年10月8日，新語絲網站當日的「新到資料」頭條發表了一篇署名「嚴晉」的文章，對于建嶸提出五點質疑。次日，新語絲刊登了于建嶸的答覆文章，回應了五點質疑。該文被放在「新到資料」的第七條，加上了方舟子的按語[24]。
- 原清華大學醫學院教授劉輝：方舟子認為劉輝利用其姓名縮寫「Liu H」同一位名為「劉宏（Liu H）」兩者姓名縮寫一致的巧合，將劉宏的論文記入自己名下，通過詐騙的手段獲得清華大學醫學院院長助理的職位。（參見清華劉輝履歷事件）
- 「基因皇后」陳曉寧：方舟子稱陳曉寧只是一家私營機構的技術人員，雖然兼任加州大學（UCLA）醫學院的「附屬副教授（Adjunct Associate Professor）」，但這些都是掛名的職務，既不是「博士」，也不是「加州大學教授」[25]。
- 南京大學朱涵：2004年3月初，媒體報道稱，南京大學物理系本科生朱涵發表了10篇學術論文，其中有8篇論文是發表在SCI上。方舟子認為：朱涵的論文通訊作者是其父北京師範大學物理系教授朱建陽，因此朱涵是「沾老爹的光，老爹發表論文時把兒子的名字順便也寫上」。「中國科技界子承父業的多得是，但是像朱氏父子這樣從兒子還是個本科生時就肆無忌憚地加以提攜的，還是聞所未聞的[26]」
- 中國科學院院士魏於全、楊煥明、郭光燦、加拿大國家航天局科學家劉維寧
- 南京大學院士候選人陳坤基：2007年6月16日新語絲刊出了若智的《南京大學：這難道還不算一稿多投？》一文，稱南京大學固體微結構物理國家重點實驗室K. J. Chen（陳坤基）等發表於國際著名學術期刊Physical Review Letters和Advanced Materials上的兩篇論文為典型蓄意一稿兩投。
- 「美國總統獎」獲得者葉菲：方舟子指出葉菲在出版的書中誇大其求學經歷，稱其獲得的「美國總統獎」並非由美國總統親自頒發的每個州只有一個名額的獎勵，而是每年頒發給幾十萬學生的「總統教育獎」，其含金量僅相當於中國的「三好學生」[27]。
- 中國科學院院士潘建偉：方舟子指潘建偉誇大其在國外的學術成就[28]。
- 軍事醫學科學院研究員裴雪濤[29]：方舟子稱其「發無厘頭的感慨」，呼籲國家停止資助其研究專案[30]。並且認為其在國際期刊上僅僅發表了6篇論文，「在國內也是拿不出手的」[31]。
- 河北科技大學副教授韓春雨：2016年，方舟子多次撰文指出韓春雨的基因編輯技術「NgAgo」的論文涉嫌造假[32]，並於2016年9月9日向國家自然科學基金委員會正式舉報韓春雨，要求對韓春雨進行深入調查[33]。
- 上海復旦大學附屬華山醫院感染科主任、黨支部書記張文宏：2021年8月，方舟子舉報張文宏的博士論文涉嫌抄襲他人[34]。
被方舟子批評的人物包括：
- 法律學者賀衛方：方舟子稱賀衛方「一稿多投」，認為賀衛方是「法學界的水貨」、「尸位素餐」[35]。
- 呼吸道疾病專家鍾南山：方舟子稱其與藥廠合作賣假藥[36]，並指責鍾南山誇大霧霾和家居裝修的危害性[37]。
- 科學家錢學森：2009年11月4日，錢逝世4天後，方舟子發表了《〈人民科學家錢學森〉若干可商榷之處》[38]一文，批評錢在大躍進期間為糧食畝產萬斤提供「科學」證明，及為研究「人體特異功能」運動發揮領導和指導作用。
- 雜交水稻之父袁隆平：因袁隆平對轉基因大米的安全性有疑慮，方舟子對其提出批評[39]，稱「袁隆平本人也在搞轉基因大米但還沒做出來」，並質疑袁的科學素養[40]。
- 調查記者柴靜[41][29]：方舟子批評柴靜既然作為「調查型記者」，就要「對事實的真相要有潔癖，不要輕信、傳播當事人的自吹自擂、神吹胡侃和道聽途說」[31]。羅永浩因此事與方舟子交惡，方舟子譏其為「羅三桂」[42]。
- 作家木子美（在新浪微博名為「不加V」）：方舟子稱其為「三髒女」。
- 作家李承鵬：方舟子指責平時大喊打倒房地產商的李承鵬，其實私下與房地產商過從甚密，並表示李承鵬為房地產商「寫軟文」，涉嫌虛假宣傳[43]。同時方舟子承認攻擊李承鵬是因為後者幫孫海峰說話[44]。
- 歌手王菲、海派清口表演家周立波、藝人林志穎
- 企業家羅永浩：方舟子稱羅永浩是流氓，是其見過最惡心的人[45]。方舟子亦稱羅永浩「非法辦學，沒有辦學資質，還涉嫌偷稅漏稅，做虛假廣告」[46]。從2011年底開始，方與羅在新浪微博上進行了曠日持久的爭執。
- 奇虎360董事長周鴻禕
- 央視主持人崔永元、央視調查記者王志安
- 央視主持人白岩松：方舟子譏其為「白拓寬」（但方舟子否認曾如此稱呼白，說這是其他人叫出來的，他只是在微博上回覆那些言論時自動參照）。
- 網路作家周小平：方舟子稱從未聽說過周小平這「網路作家代表」，參照清華大學教授肖鷹的說話稱其為「流氓文化代表」。方舟子說，周小平所寫的《夢碎美利堅》一文屬於胡思亂想捏造，是在「夢游美利堅」。
- 生物學教授饒毅：方舟子質疑其論文造假
- 異見人士艾未未、王丹、陳光誠
- 柴玲：方舟子指六四事件時，其於五月底領了救濟款逃跑
- 郭文貴
- 李老師不是你老師：方舟子稱該推特使用者在白紙運動期間發布的民眾抗議資訊剽竊自其它使用者，背後有團隊運營[47]
- 諾貝爾生理學或醫學獎獲獎者屠呦呦：方舟子稱其「誇大自己的成就」，在成果發表過程中存在拔高自己、貶低他人、忽略別人貢獻的缺點，並表示「青蒿素不是中藥」[48]
被方舟子質疑或批評的機構包括：
- 南方周末：方舟子認為其在報道自己與于建嶸的爭執時不公，已「墮落了」[49]。2012年6月南方周末頭版和四個版面發表對方舟子的報導[50]，方舟子稱其是「構陷」，認為南方周末已「淪落為泄私憤的構陷私器，連最基本的新聞道德和做人道德都不顧。」2013年初南周事件時，方舟子抨擊南周為「撒嬌」、「戲子作秀」。
- 人民網、人民日報（含海外版）、環球時報、新華網、光明網等多家中國大陸官方媒體：由於這些媒體在方舟子評周小平文章遭封殺後發表評論員文章為周小平辯護，方舟子稱這些媒體發表的這些文章「都是統一部署的結果」，並戲稱為「黑色幽默」、「最進階別的黑」，稱他們「把一個不學無術的『網路作家』吹捧成『網路世界的敲鐘人』、『這一代』的代表，把他那些東抄西湊、信口開河、錯誤百出的部落格吹捧成『網路正能量』、『愛國正能量』[51]。」
- 紐約時報
- BBC中文網
- 漢芯
- 方舟子批判中醫、中藥等的大量文章也產生了比較大的社會影響[52]。方舟子在新語絲上設立「中醫騙子」專輯[53]，認為中醫和中藥沒有經過現代科學的檢驗，中醫基於陰陽五行的理論沒有實際依據，而中藥的療效也沒有被嚴格的雙盲法證明，認為應該「廢醫驗藥」[54]。另有專著《批評中醫》。
- 2015年1月，歌手姚貝娜因乳腺癌去世。方舟子提出「姚貝娜是給中醫害了」，他指出：姚貝娜早期病情發作時因為吃中藥「調理」後病情反而加重，接受規範治療，症狀得以改善，雖然乳腺癌治癒率可達到90%以上，而且她的病情屬於預後良好的類型（雌激素受體陽性），可以通過內分泌治療降低體內雌激素含量減輕病情以致治癒，但是有可能會發生絕經期症狀，姚貝娜遂拒絕接受這一治療並再次服用中藥，由於中藥的藥方中有些藥物（如當歸）具有雌激素活性，會加重病情，致使兩年後疾病復發、擴散而逝世。
- 2015年10月，中國藥物化學家屠呦呦因在研製青蒿素等抗瘧藥方面的貢獻被授予諾貝爾醫學獎。由於屠呦呦聲稱其發現青蒿素治療瘧疾是受到傳統中醫典籍《肘後備急方》啟發而來，遭到反對中醫的方舟子的批評，並指屠呦呦在學術道德方面存在瑕疵。[55]
- 雖然主張「廢醫驗藥」，但方舟子贊成將中醫作為文化加以整理、研究。
- 方舟子批判虛假保健品。包括以褪黑激素為主要成分的「腦白金」以及核酸營養品「珍奧核酸」都被揭露為虛假宣傳。2007年到2009年期間，方舟子揭露蒙牛乳業產品「特侖蘇」牛奶聲稱添加的名為「OMP（造骨牛奶蛋白）」的物質就是IGF-1（胰島素樣生長因子-1）[56]，正常情況下口服無作用，而如果血液中IGF-1濃度過高則有增加患癌症的風險。在這個事件中，聲援方舟子的廣東奶業協會在其主辦的南方奶業網[57]上刊登了有關資訊。
- 方舟子在轉基因食品方面持支援態度，他表示：「眾多國外權威機構，包括世界衛生組織、聯合國糧農組織、歐盟執委會、美國科學院、美國食品藥品管理局、英國皇家醫學會都指出，轉基因食品的安全風險並不比其他食品更高，反而可能更低[58]。」
- 方舟子對於瘦肉精持解禁態度。2011年4月1日，他在新華每日電訊上發表署名文章，批評媒體過度「妖魔化」瘦肉精（萊克多巴胺）的現象。在文中，他表示由於養豬業有提高豬肉瘦肉率的需求，杜絕「瘦肉精」的使用非常困難。如果一概禁用，那麼養豬戶在選擇時就寧願選用價格最低廉、但是毒性也最強的鹽酸克倫特羅，而如果政府允許使用安全且副作用很低的萊克多巴胺，那麼很多農戶就不會冒違法的風險了。目前有二十多個國家允許使用萊克多巴胺，但中國卻禁用[59]。
- 2019冠狀病毒病疫情期間，方舟子認爲選一名政客當世衛組織總幹事，必然會讓它從專業組織變成政治組織，因為政客眼裡只有利益，沒有原則。方舟子反對封城，也反對民眾普遍佩戴口罩，甚至建議美國政府沒收華人超市販售的口罩[60]。
方舟子對宗教持批判態度。在新語絲，方舟子作為無神論者多次批評基督教。他揭露重慶道士李一與唯一教、奧修靜修會的邪教性質，及質疑李一動輒半年的辟穀、長達兩小時的胎息等非常傳奇的個人經歷。2011年2月5日，方舟子與歌手王菲在網路上展開了一場對「一尊佛像」的見解，方舟子認為公眾人物的宗教信仰宣傳會誤導大眾[61]。但方舟子也主張宗教信徒應享有信仰自由的權利。
2006年11月，何祚庥、郭正誼、司馬南、袁鍾成立了「科技打假基金籌備組」，由方舟子律師彭劍任秘書，面向社會募集捐款，用來資助方舟子打假（即「打假基金」）[62]，並申明將公開帳目、接受監督[63]。此外，2010年方舟子遇襲後，彭劍又以個人名義向社會募集「安保資金」，用於保障方舟子的人身安全。同時成立監管小組，向小組公開帳目並接受監督。這兩項基金未向社會公布過其基金使用明細[64]。在2013年與崔永元有關轉基因食品的爭論中，這一點亦遭崔永元及其支持者的質疑[65]，被指為「黑資金」。
2007年1月，冼岩發表評論，認為方舟子巧妙避開何祚庥曾留下污點的控制論、共振論和基因學說等，恰到好處既抨擊「偽科學」，又保護了成為他衣食父母的何院士[66]。
2014年1月13日，「新語絲」網站經營者方舟子授予何祚庥由林樹坤贊助的「新語絲科學精神獎」，獎金為一萬瑞士法郎[67]。
遭襲事件
2010年8月29日下午5點，方舟子在北京的住所附近被兩名不明人士用麻醉劑和鐵錘襲擊，受輕傷。當時，方舟子在一個茶館接受遼寧電視台《王剛講故事》採訪，在結束後走出茶館時被迎面噴射麻醉劑；襲擊者同時試圖使用鐵錘擊打其頭部，但方及時躲開。方舟子在試圖逃開時被鐵錘擊中腰部。
9月21日下午，北京警方宣佈破獲該案。經初步審查，該案系因肖傳國認為方是民、方玄昌通過媒體、網路對其學術「打假」，從而導致其未能入選中國科學院院士，為報復二人，遂指使人襲擊了方舟子。10月10日，石景山區人民法院做出一審判決，認定肖傳國「接受被告人戴建湘找人毆打方是民和方玄昌的建議」，犯尋釁滋事罪，判處拘役5個半月。對此，方舟子質疑北京司法機關判決過輕，有放縱之嫌。肖傳國方認為判罰過重，並提出上訴[68]。11月2日，北京中院做出終審判決：維持原判[69]。2011年4月，肖出獄後，旋即召開新聞招待會[70]，為肖氏手術正名[71][72]，並在接受《新快報》採訪時表示，自己並未雇凶傷人，只是未能阻止親戚「教訓」方舟子，並認為「尋釁滋事」的罪名有誤，已提出申訴[73]。肖認為自己受到了媒體不公正的待遇，並於2012年4月起訴央視和北京市公安局，要求其致歉並恢復名譽[74]。
爭議
方舟子常常對打假的對象進行激烈的人身攻擊，例如對打假的對象起「外號」：稱劉維忠為「豬蹄廳長」[75]，賀衛方為「賀不群」[76]，羅永浩為「羅裝剽」[77]，科學松鼠會為「老鼠會」[78]等。類似的言論被多方指責，如法律學者蕭瀚稱之為「語言暴力」[79]。雜文家鄢烈山稱方舟子「一點就炸」，行文用語粗暴，有「文革」紅衛兵、紅小兵的遺風[80]。
針對鄢烈山的指責，方舟子回應稱[81]「犀利只是文章風格」。此外在2005年，方舟子參照魯迅的話，認為：「如果說良家婦女是妓女，那是罵人，但如果說妓女是妓女，那就不是罵人[82]。」
2011年2月6日20時13分，王菲在微博上轉了網友「我執難破」的一條微博，並對微博中的木製佛像在大火中竟然絲毫無恙地屹立在夕陽中表示「無以言表 不可思議 頂禮遍知佛尊~」。經過網友轉發，方舟子迅速發表了一條充滿火藥味兒的評論：「還有無數尊葬身火海的佛像你也別忘了頂禮。誰要覺得這尊佛像不可思議的，拿來點把火試試？」王菲當即不甘示弱，反問方舟子：「你想試什麼？能不能點著麼？」方舟子應戰稱：「實驗檢驗傳奇。」
7日上午9時49分，王菲再寫了一條微博請方舟子「方老師 不要科學地不講理~ 我們討論的是木頭能否被燒著的事麼？事實上我們認為萬物都有生滅 就算是真金佛像也有消散的那天 我們相信的是某種內在的力量 這個你不懂 我懂的~ 我們體會的是內因 你注重的是外緣~ 如果真想做這個實驗 恐怕也得找個相當大的樓 點一把差不多的火 才是本著科學的嚴謹態度吧~」。7日15時14分，方舟子不甘示弱，參照王菲的句式寫道：「你不要信仰地不講理。」50分鐘後，方舟子再度在微博中稱：「誰說宗教信仰能提高人的教養的，到網上看仔細了。」
2011年2月7日19時，王菲發博回應方舟子「能跟你對話就挺不可思議的 不聊了 過年好~」，主動退讓意圖息事寧人，然而方舟子咄咄逼人，將罵戰升級到攻擊王菲粉絲，引起網友廣泛譴責。
在百度「王菲大戰方舟子」的貼吧中，有網友認為，「王菲怎麼看都是在禮讓。倒是某博士咄咄逼人，最後還硬要發篇某寺廟大火一切燒盡的微博，姿態太不自信。」網友原配瑞兒則認為：「王菲的行為是一種常人可以理解的行為，一種微妙的習俗和信仰的感情，並不是說發大火時，她就一定會找個佛像躲著。而方舟子卻用科學的標準去評斷這種感性的行為顯然用錯了標準。」[85]
方舟子被指從不對自己的某些被人認為錯誤的言行道歉，其「決不認輸、決不認錯是科學圈內公認的特點」[4]。在韓寒訴方舟子一案中，方舟子稱「如果法院判我敗訴，賠償不能不交，不然法院會強制執行，但我不會道歉，沒做錯事，怎能道歉」[86]、「我不會道歉。包括以前十幾起官司判我輸了的，我從來都不道歉……你必須要承認自己錯了才去道歉。但目前來說，我看不出我錯在哪」[87]，此番言論遭到《法制晚報》評論的批評[88]。
雖然受到如上指責，但對於事實清楚的失誤，方舟子也曾承認錯誤，向當事人道歉。例如方舟子因為混淆了兩個在匹茲堡大學的名叫「李勇」的教授，而兩次發微博向當事人道歉[89][90]。
有人認為，方舟子有時在打假中對不同的人或事物使用了不同的標準，如北京大學教授劉華傑曾說：「方舟子批評別人採用的是一套標準，自己做事採用的是另一套標準」；中國社科院學者易華認為方「反差很大，雙重標準明顯———看別人的毛病很清楚，自己的缺陷不覺察[4]。」 在方舟子的妻子劉菊花的碩士論文被多人討論研究判定為存在抄襲的事即時[91]，方舟子作為打假鬥士，卻不再打假，還表示舉報抄襲的理由可笑[92]
對此，方舟子曾回應稱[93]：「本來就是應該選擇性的打假，那麼多我怎麼可能什麼事都管？我當然指的是找那些我認為比較嚴重，或者我覺得有意思的、感興趣的」。
方舟子被批評為在新語絲網站上既是老闆，又是編輯，又是辯論對手[94]。清華大學科技史教授劉兵認為，方舟子在學術打假時集「偵查、控告、審判」於一身；其對「假」的認定，並非由學術共同體以集體的方式來認定。另外，在不同觀點並存的情況下，闡述自己的觀點，並理解他人觀點的合理性，這是學者最基本的態度，方舟子沒有做到這一點[94]。北京大學教授劉華傑等人亦指責方舟子用科學的帽子打壓人[94]。
對此，方舟子在2010年接受南方都市報採訪時，稱所謂「話語霸權」是沒有依據的[95]。他強調自己的話語權和普通人一樣，自己只是提供一個平台，手上並沒有做法官的權力，打假只是個人見解，不會使造假者受到什麼懲罰[95]。
2011年3月30日，《法治周末》用四個整版的篇幅刊登了《方舟子涉嫌抄襲總調查》[96]，文中指出：方舟子發表於2006年12月11日《經濟觀察報》上的《現代藥物是怎麼開發出來的》一文，系抄襲自網友「穎河」的九篇系列文章《認識藥物》，連原文的筆誤都照抄不誤。
對此，方舟子辯稱「科普文章和論文的標準是不一樣的」，因此「稱不上抄襲」。。密西根州立大學教授魯特-伯恩斯坦稱方舟子在1995年發表在網上的一篇文章《科學是什麼》中剽竊了他的著作：《科學是什麼》全文1600字，其中約有900字幾乎原文引自他的《神創論是科學的理論嗎》一文，但並未註明出處[96]。該文被收錄在2007年出版的《方舟子破解世界之謎》中時，亦未提到伯恩斯坦。
據此，網名「亦明」的學者葛莘於2010年10月17日向密西根州立大學發出舉報信。19日，方舟子改動了新語絲網站的網頁，在原文加上了「根據美國學者Root-Bernstein的歸納」的字樣。此後，密大誠信負責人吉姆斯·皮瓦尼克回信稱該文章雖滿足「學術不端行為」的定義，但無可信證據證明是方舟子於1995年所寫。
在葛莘提供了相關證據後，大學以「方舟子的文章與他在該校學業無關」為由，拒絕進行進一步調查。對此，原作者魯特-伯恩斯坦教授在確認方舟子抄襲他的文章的情況下，對校方的處理意見表示不滿，並向校方舉報方舟子抄襲他的文章[96]。
方舟子在參加北京電視台《第七日》節目時，該節目下方的捲動字幕中介紹方舟子是「麻省理工學院生物學博士」，受到一些人的質疑[97]，事後方舟子以稱是該節目單方面的失誤。
2012年初，羅永浩發表微博質疑由方舟子的律師發起，並以方舟子為主要受益人的「打假基金」和「安保基金」涉嫌詐捐和漏稅的行為，並向公安局經偵科和民政局舉報。
央視記者王志安因為其好友、中國農業大學副教授朱毅的論文造假被方舟子等網友質疑，而與方舟子結下私仇。2015年12月22日開始，王志安連續在新浪微博發文質疑安保資金涉嫌詐騙。
2015年8月19日，方舟子向北京市海淀區人民法院起訴王志安名譽侵權。
2019年，由於安保資金事件，以方舟子為主要受益人的安保資金管理者彭劍在國內兩起官司終審均敗訴。其判決書都已經可以查詢到，法院判決安保資金退還310萬捐款和利息。[98]
榮譽
2010年12月，獲得2010知識中國盛典年度人物[99]。
2012年11月，獲得首屆「約翰·馬多克斯捍衛科學獎」[1]。
2013年6月，獲得「註冊舞弊稽核師協會」頒發的「克里夫·羅伯森哨兵獎」[100]。
著作
方舟子在獲得生物化學博士學位後不久即轉行從事科普工作，有相對較少的學術著作，大量科普著作，還有一些文史散文、詩歌等。
方舟子有第一作者（與Burton教授合著）的生物化學方面的英文論文一篇[101]，非第一作者生化專業論文三篇[102][103][104]。
- Cyclin T, A New HIV Target Inventors: Katherine Jones, Ping Wei, Mitchell Garber, Shi-Min Fang
- PATENT STATUS: U.S. Patent No. 6,270,956 issued August 7, 2001, U.S. Patent No. 6,284,456 issued September 4, 2001, Published PCT application WO99/29730
- 《進化新解說》跨世紀科學叢書，香港天地圖書有限公司，1997年，ISBN 962-950-245-3
- 《法輪功解剖──一位海外學子的立場》德先生茶館叢書，湖南人民出版社，1999年8月，ISBN 7-5438-2065-X
- 《網路新語絲》（主編）網路文化叢書，河北人民出版社，2000年1月，ISBN 7-202-02682-1
- 《方舟線上》北京理工大學出版社，2000年6月，ISBN 7-81045-702-0
- 《進化新篇章》中國科普佳作精選，湖南教育出版社，2000年12月，ISBN 7-5355-3354-X
- 《叩問生命──基金時代的爭論》天津教育出版社，2001年1月，ISBN 7-5309-3278-0
- 《潰瘍──直面中國學術腐敗》海南出版社，2001年6月，ISBN 7-5443-0048-X
- 《長生的幻滅──衰老之謎》看世界叢書，上海科學技術出版社，2002年11月，ISBN 7-5323-6718-5
- 《江山無限──方舟子歷史隨筆》春秋文叢，福建人民出版社，2004年5月，ISBN 7-211-04722-4
- 《餐桌上的基因》科學的眼睛叢書，少年兒童出版社，2005年4月，ISBN 7-5324-6503-9 （2007年8月第二版更名為《食品轉基因》，ISBN 9787532472956）
- 《基因時代的恐慌與真相》廣西師範大學出版社，2005年8月，ISBN 7-5633-5436-0
- 《尋找生命的邏輯──生物學觀念的發展》上海交通大學出版社，2005年9月第一版，ISBN 7-313-04005-9，2007年第二版
- 《科學成就健康》賽先生科學與生活系列叢書，新華出版社，2007年1月出版，ISBN 978-7-5011-7777-6
- 《批評中醫》「中醫新世紀大論戰」叢書，中國協和醫科大學出版社，2007年3月第一版，ISBN 978-7-81072-876-8[105]
- 《方舟子破解世界之謎》陝西師範大學出版社，2007年8月第一版，ISBN 978-7-5613-3703-5
- 《方舟子帶你走近科學》陝西師範大學出版社，2007年11月第一版，ISBN 978-7-5613-3805-6
- 《愛因斯坦信上帝嗎？──方舟子解讀科學史著名謎團》廣西科學技術出版社，2009年8月第一版，ISBN 978-7-80763-312-9
- 《大象為什麼不長毛：方舟子破解科學謎題》海豚出版社，ISBN 978-7-51100-327-0
- 《我的兩個世界》，百花洲文藝出版社，2012年，ISBN 978-7-55000-324-8
- 《方舟子自選集》，人民郵電出版社，2013年，ISBN 978-7-115-31253-2
- 《科舟求健──方舟子談健康》，同心出版社，2014年，ISBN 978-7-5477-1227-6
- 審譯《HOW & WHY美國經典少兒百科知識全書》，廣西科學技術出版社，2014年，ISBN 978-7-80763-778-3
注釋
參見
參考文獻
外部連結
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