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基因重配[1] (英文:Reassortment)是指某個物種的遺傳材料之間相互混合,在物種的不同個體中形成新的組合的現象。基因重配的過程包括染色體重組、染色體互換等,也可能是兩個相似病毒在感染同一個細胞的時候進行了遺傳材料交換。[2][3]
基因重配常發生於流感病毒中。甲型、乙型流感病毒擁有8個不同的RNA片段、丙型擁有7個RNA片段,有如小型的染色體。[4] 當病毒進行組裝時,每個片段都會被複製一段。當某個宿主(人,雞,或其他動物)同時感染了兩種或以上不同流感病毒時,新組裝的病毒顆粒就可能同時包含之前不同病毒的RNA片段。新的重排毒株會體現出原始毒株的部分特性。
歷史上一些重大的流感大流行就與流感病毒的基因重配有關。比如1968-69年的「香港流感」H3N2病毒就是來自於1957-58年的「亞洲流感」H2N2病毒的基因重配(抗原轉變)[5][6],而2009年流感大流行中的H1N1流感病毒同時包含有豬、禽類和人類流感病毒的基因序列。[7] 感染蛇的沙粒病毒科中,由於基因重配,也出現了高度的基因多樣性。[8]
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