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肌肉组织（Muscle tissue）是组成动物身体肌肉的软组织，肌肉的收缩是透过肌肉组织进行的。这和肌肉中其他的组织（例如腱或肌束膜）相反。肌肉组织是在胚胎发育时借由肌发生（myogenesis）的过程而形成的[1]。
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肌肉组织随着其机能以及在身体内的位置而不同。哺乳类有三种肌肉组织：骨骼肌（skeletal muscle，也称为条纹肌）、平滑肌（smooth muscle）及心肌（cardiac muscle，有时也称为半条纹肌）。平滑肌和心肌都可以在没有意识介入的情形下自发性的收缩。这些肌肉是透过中枢神经系统的互动来所其活动，也会受到周边神经丛或是内分泌系统的控制。骨骼肌只会在有意识下收缩，是受到中枢神经系统的影响。反射是一种骨骼肌的无意识动作，虽然进行时不会有大脑皮质的介入，但仍然是由中枢神经系统使其动作。[1]
三种肌肉组织对神经递质及激素（例如乙酰胆碱、去甲基肾上腺素、肾上腺素及一氧化氮等）的反应是不同的的，依其肌肉形态以及组织在肌肉中的位置而定[1]。
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肌肉（肌细胞）是长型的细胞，其长度从数毫米到十厘米不等，宽度则在10至100微米之间[2]。肌肉细胞相互结合，形成组织，肌肉组织是条纹肌或平滑肌则依称为肌丝的肌原纤维收缩蛋白，是否有规则、周期性的出现在肌肉组织中而定。条纹肌可以再细分为骨骼肌以及心肌[3]。骨骼肌会受意识控制，而平滑肌不会。因此 肌肉组织可以分为以下的三种：
- 骨骼肌在结构上有条纹，会受意识控制，透过腱（有些部位会透过腱膜|）连结到骨骼，配合骨骼系统让动物可以运动并且维持其姿势（虽然姿势控制一般而言是无意识的，参照本体感觉，不过相关肌肉也可以受意识控制）。成人男性的骨骼肌平均约占体重的42%，成人女性的骨骼肌平均约占体重的36%[4]。
- 平滑肌，本身没有条纹，也不受意识控制，会出现在器官或是生理结构（例如食道、胃、小肠及大肠、支气管、尿道、膀胱、血管）的器壁上，也在皮肤中控制毛发竖立的起毛肌中。
脊椎动物有以下这种肌肉：
- 心肌，只存在在心脏中，是类似骨骼肌一样有条纹的肌肉，但不受意识控制。
心肌及骨骼肌有条纹的原因是其中包括肌小节，而且肌肉结合成高度规则的束状结构。平滑肌则不然。骨骼肌会呈规则的、平行的肌肉束，心肌会以分支、不规则的角度相连接（称为肌间盘intercalated disc）。条纹肌会以时间较短、强度较高的方式进行收缩及放松，而平滑肌可以维持时间较长，甚至近乎于永久性的收缩。
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| 平滑肌 | 心肌 | 骨骼肌 | |
| 解剖学 | |||
| 神经肌肉接点 | 无 | 无 | 有 |
| 肌纤维 | 梭形，短（<0.4 mm） | 分支 | 柱形，长（<15 cm） |
| 线粒体 | 少 | 多 | 有多有少，依种类而定 |
| 细胞核 | 1 | 1 | >1 |
| 肌小节 | 无 | 有，最长2.6 µm | 有，最长3.7 µm |
| 合胞体 | 无（独立细胞） | 无（但有类似的功能） | 有 |
| 内质网 | 较短 | 中等 | 较长 |
| ATPase | 少 | 中等 | 丰富 |
| 生理学 | |||
| 自调节 | 自发性调节（慢） | 有（快速） | 无（依神经刺激而反应） |
| 对刺激的反应 | 不反应 | 全有全无律 | 全有全无律 |
| 动作电位 | 是 | 是 | 是 |
| 对刺激的反应 | 
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骨骼肌可以再细分为以下的几类：
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平滑肌是不受意识控制的肌肉，没有条纹平滑肌可以分为两类：单组织平滑肌及多组织平滑肌。单组织平滑肌中，整束肌肉成为合胞体（多核细胞质团，但不细分为细胞）多组织平滑肌就会细分为细胞，因此可以有精细的控制以及渐进的反应，就像骨骼肌中的运动单元反应一样。
平滑肌会在淋巴管、膀胱、子宫（称为子宫平滑肌）、男性及女性的生殖道、消化道、呼吸道、皮肤的立毛肌、眼部的睫状肌以及虹膜。不同器官中的平滑肌细胞结构及机能基本上是相近的，不过因为配合各器官的不同反应时间进行对应动作，其诱导刺激显著的不同。另外，肾脏的肾小球也有类似平滑肌的肾小球系膜细胞。
心肌（Cardiac muscle）是心脏部位不受意识控制的条纹肌组织，出现在心脏壁，也是心脏的基础组织。组成心脏肌肉的细胞称为心肌细胞，多半只有一个细胞核，不过也有二个或四个细胞核的情形[8][9]。心肌（myocardium）是心脏中的肌肉组织，是在外围的心外膜层及内圈的心内膜层之间，较厚的一层组织。
心肌细胞会有协调性的收缩，将心房及心室的血液打到往全身以及肺部的血管中，成为血液循环的一部分。这些精细的机制让心脏可以定时的收缩。
心肌细胞和身体其他细胞不同，需要有效的血液及电子来源来提供氧气及养份，并且移除像二氧化碳之类的代谢后产物。冠状血管就是负责这类机能的血管。
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