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枯草杆菌（学名：Bacillus subtilis）也称枯草芽孢杆菌，是芽孢杆菌属的一种细菌，为革兰氏阳性的好氧性菌，普遍存在于土壤及植物体表，在人体亦可发现在肠道内共生的枯草杆菌。型态上的主要特征是菌体表面生有鞭毛，体内形成的内生孢子可抵抗恶劣的外在环境而存活。最近的研究显示，枯草杆菌其实并不全然是好气性的。枯草杆菌在食品和饲料添加剂上广泛使用，如日本人使用该菌的纳豆亚种（var. natto）将黄豆发酵成为纳豆和韩国料理中的清麹酱，近年来使用在种子保护及生物防治上，也经常被拿来应用。临床医学上是属于安全性的有益微生物。在水产养殖中的应用也相当广泛。
枯草杆菌
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| 以Schaeffer–Fulton 芽孢染色法染色的枯草芽孢杆菌，芽孢由孔雀绿染成绿色，菌体由番红染成红色 | |
科学分类 
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| 域： | 细菌域 Bacteria |
| 门： | 芽孢杆菌门 Bacillota |
| 纲： | 芽孢杆菌纲 Bacilli |
| 目： | 核衣细菌目 Caryophanales |
| 科： | 芽孢杆菌科 Bacillaceae |
| 属： | 芽孢杆菌属 Bacillus |
| 种： | 枯草杆菌 B. subtilis
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| 二名法 | |
| Bacillus subtilis (Ehrenberg 1835) Cohn 1872
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| 模式菌株 | |
| ATCC 6051 = ATCC 6051-U = CCM 2216 = BCRC (formerly CCRC) 10255 = CCUG 163 B = CFBP 4228 = CIP 52.65 = DSM 10 = IAM 12118 = IFO (now NBRC) 13719 = IFO (now NBRC) 16412 = IMET 10758 = JCM 1465 = LMG 7135 = NCAIM B.01095 = NCCB 70064 = NCCB 32009 = NCCB 53016 = NCIMB 3610 (formerly NCDO 1769) = NCTC 3610 = NRRL B-4219 = NRRL NRS-1315 = NRRL NRS-744 = VKM B-501 | |
- 6-羧基四氢蝶呤合酶(CPH4合酶)
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