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PANGOLIN
SARS-CoV-2系的数据库 / 维基百科,自由的 encyclopedia
PANGOLIN(Phylogenetic Assignment of Named Global Outbreak Lineages,中文又翻译为彭高命名系统)是一个由Rambaut Lab成员开发的软件工具,与其相关的网络应用由位于英国南剑桥郡的基因组病原体监测中心(英语:Centre for Genomic Pathogen Surveillance)开发[2]。该工具可以被用来对严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2的基因谱系(英语:Lineage (genetic))进行动态命名(PANGO命名法)[3]。
Quick Facts 首次发布, 当前版本 ...
![]() PANGOLIN logo | |
首次发布 | 2020年4月30日,4年前(2020-04-30) |
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当前版本 |
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源代码库 | github |
编程语言 | Python |
许可协议 | GNU通用公共许可证 |
网站 | pangolin![]() |
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据此命名系统的发起人之一Andrew Rambaut所说,SARS-CoV-2有数以万计的基因体,该基因体数量可是前所未见的,由于截至2020年7月还没有共识去为SARS-CoV-2种系命名,因此就订出这个Pango Lineage系统来为基因体谱系命名。
参考文献
- Release 4.3.1. 2023年7月26日 [2023年8月1日].
- Real-Time Epidemiology for COVID-19. www.pathogensurveillance.net. [22 January 2021]. (原始内容存档于2021-01-17).
- Rambaut, A.; Holmes, E.C.; O’Toole, Á.; et al. A dynamic nomenclature proposal for SARS-CoV-2 lineages to assist genomic epidemiology. Nature Microbiology(英语:Nature Microbiology). 2020, 5 (11): 1403–1407 [2021-05-15]. PMID 32669681. doi:10.1038/s41564-020-0770-5. (原始内容存档于2020-12-24).