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陈垣崇（1948年9月24日—），台湾医学家和发明家，中央研究院院士及生物医学科学研究所第三任所长（2001-2010）。他的许多医学创新研究，已运用在临床上，改善病人照护。
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出身医生世家的陈垣崇，父亲是台大医院小儿科权威陈炯霖医师（1917-2015），从小就天资聪颖并喜好研究，高中时的陈垣崇就非常热爱化学，一心想做研究，目标则是台大化学系，但身为台大医学院教授的父亲却委婉地告诉他，学医不一定要行医，也可以做研究，这才让他改填台大医科。当年他以第一名保送进台大医学系。台大医科到大四、大五时，大都到医院实习，陈垣崇却选择进入老师的实验室。但这样的他，却对当医生兴趣不大，在医学院六年级时，受到全球第一个人类定序基因影响，对人类基因解码感到兴趣，因而投入可做研究亦可帮助他人的基因工程研究领域[1][2]。
一般人认识陈垣崇，起于他找到第一型肝糖贮积症的治疗方法，但真正让他在医界发光发热的是庞贝氏症治疗药物阿糖苷酶α（商品名：美而赞/Myozyme）的发明及药物不良反应基因的发现。
- 早期的研究生涯，是利用鉴定基因的基础开发出以DNA为基础的诊断技术，来诊断代谢性疾病，包括肝糖储积症（glycogen storage diseases）及中链酰基辅酶缺乏症（medium chain acyl Co-A dehydrogenase deficiency）。
- 发展出二种严重的遗传代谢性疾病疗法，成为目前该疾病的标准治疗方法，其一是有效的使用玉米淀粉疗法治疗遗传性第一型糖类储存疾病所发生的严重低肝糖血症；其二是以酵素置换法发展出有效新药Myozyme治疗罕见疾病庞贝氏症。
- 发现VKORC1基因对于广泛被使用的抗凝血剂华法林（Warfarin）的使用计量扮演重要的角色，研究团队并进一步参与国际华法林联盟，利用基因与临床的数据演算出一个计算公式，能够预测个人最理想的华法林用药剂量，避免不正常出血的发生。
- 发现治疗癫痫用药卡马西平（Carbamazepine）引起药物不良反应的基因标记HLA-B*1502，以及治疗痛风用药别嘌醇（Allopurinol），引起药物不良反应的基因标记HLA-B*5801。
- 几项药物基因体学研究成果促使药物食品检验局重新标示常用医师处方药华法林、卡巴氮平及别嘌醇，建议医师在用药前应先检测基因，提供医师开立处方时在选择用药及剂量的参考，以预防病人发生药物不良反应[3]。
陈垣崇是庞贝氏症上市解药阿糖苷酶α（商品名：美而赞/Myozyme）的发明人[4][5]。这个药物拯救了许多原本无药可救的生命，由哈里逊·福特和布兰登·费雪主演的好莱坞电影《爱的代价》（Extraordinary Measures）就是描述一个父亲为了替二个患有庞贝氏症的孩子寻找救命解药，以及这个新药研发的故事[6]。
陈垣崇于2010年6月被检调侦查其涉嫌违反贪污治罪条例及政府采购法[7]。2011年3月检方以陈垣崇为顺利落实科技移转，达成“促进研究发展，增进社会、国家、世界福祉”目的，未违反政府采购法而不起诉。在此事件之后，立法院于2011年11月25日三读通过“科学技术基本法部分条文修正案”；由政府补助、委托或出资的科学技术研发所获得的知识产权及成果，得归属于公立学校、机关或公营事业，不受国有财产法相关条文的限制，可依公平效益原则做合适的收益分配。此外，并加入利益冲突回避及资讯揭露的规定。这个修正案的通过，对于台湾科技发展是一个重要的里程碑[8][9]。
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