翻译后修饰 (英语:Post-translational modification ,缩写PTM ;又称后翻译修饰 )是指蛋白质 在翻译 后的化学 修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成 的较后步骤。PTM是细胞信号传导 中的重要组成部分。
胰岛素 的翻译后修饰。 At the top, the ribosome translates a mRNA sequence into a protein, insulin, and passes the protein through the endoplasmic reticulum, where it is cut, folded, and held in shape by disulfide (-S-S-) bonds. Then the protein passes through the golgi apparatus , where it is packaged into a vesicle. In the vesicle, more parts are cut off, and it turns into mature insulin.
蛋白质 ,或是多肽 ,是多条或一条氨基酸 的链。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会合并成为蛋白质。氨基酸的转译后修饰会附在蛋白质其他的生物化学 官能团 (如醋酸盐 、磷酸盐 、不同的脂类 及碳水化合物 )、改变氨基酸的化学性质,或是造成结构的改变(如建立双硫键 ),来扩阔蛋白质的功能。
再者,酶 可以从蛋白质的N末端 移除氨基酸,或从中间将肽 链剪开。举例来说,胰岛素 是肽的激素 ,它会在建立双硫键后被剪开两次,并在链的中间移走多肽前体 ,而形成的蛋白质包含了两条以双硫键连接的多肽链。
其他修饰,就像磷酸化 ,是控制蛋白质活动机制的一部分。蛋白质活动可以是令酶活性化或钝化。
干扰素激活基因化 ——与干扰素激活基因15 (ISG15)蛋白质 建立共价键 。[ 1]
小泛素相关修饰化 ——与小泛素相关修饰子蛋白 建立共价键。[ 2]
泛素化 ——与泛素 建立共价键。
Flowchart of the process and the data sources to predict PTMs.[ 3]
蛋白质序列包含通过修饰酶识别的序列基序,并且可以在 PTM 数据库中记录或预测。 随着发现大量不同的修改,需要在数据库中记录此类信息。 PTM 信息可以通过实验手段收集,也可以从高质量、手动整理的数据中预测。 已经创建了许多数据库,通常侧重于某些分类群(例如人类蛋白质)或其他特征。
PhosphoSitePlus (页面存档备份 ,存于互联网档案馆 )[ 4] – 用于研究哺乳动物蛋白质翻译后修饰的综合信息和工具数据库
ProteomeScout [ 5] – 实验性蛋白质和翻译后修饰数据库
Human Protein Reference Database [ 5] – 用于不同修饰和了解不同蛋白质、它们的类别以及与致病蛋白质相关的功能/过程的数据库
PROSITE [ 6] – 包括网站在内的多种类型 PTM 的共识模式数据库
蛋白质及其 PTM 可视化软件列表
PyMOL [ 7] ——将一组常见的 PTM 引入蛋白质模型
AWESOME [ 8] – 查看单核苷酸多态性对 PTM 的作用的交互式工具
Chimera [ 9] – 可视化分子的交互式数据库
Yang Y, Peng X, Ying P, Tian J, Li J, Ke J, Zhu Y, Gong Y, Zou D, Yang N, Wang X, Mei S, Zhong R, Gong J, Chang J, Miao X. AWESOME: a database of SNPs that affect protein post-translational modifications . Nucleic Acids Research. January 2019, 47 (D1): D874–D880. PMC 6324025 . PMID 30215764 . doi:10.1093/nar/gky821 .