信号识别颗粒RNA
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信号识别颗粒RNA(Signal recognition particle RNA,简称SRP RNA,又称7SL RNA)是生物细胞信号识别颗粒中的RNA,在三域生物中皆有,信号识别颗粒(SRP)由RNA与蛋白质組成,可与核糖体翻译中多肽上的信号肽结合,暂停翻译,并与细胞内质网(真核生物)或细胞膜(原核生物)的信号识别颗粒受体(英语:Signal recognition particle receptor)结合,将核糖体转移至这些膜结构上[3][4],过去认为SRP RNA在SRP中仅有维持结构的功能,后续研究发现SRP RNA可协助SRP和受体的结合,并在结合后催化两个三磷酸鸟苷(GTP)分子的水解,促使SRP自信号识别颗粒受体与核糖体脱离,使核糖体继续多肽的翻译[5][6]。
信号识别颗粒RNA | |||||||||||||||||||||||||
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识别号 | |||||||||||||||||||||||||
别名 | RN7SL1;, 7L1a, 7SL, RN7SL, RNSRP1, Signal recognition particle RNA, RNA, 7SL, cytoplasmic 1, RNA component of signal recognition particle 7SL1 | ||||||||||||||||||||||||
外部ID | OMIM:612177 GeneCards:RN7SL1 | ||||||||||||||||||||||||
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直系同源 | |||||||||||||||||||||||||
物种 | 人类 | 小鼠 | |||||||||||||||||||||||
Entrez |
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Ensembl |
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UniProt |
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mRNA序列 |
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蛋白序列 |
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基因位置(UCSC) | Chr 14: 49.59 – 49.59 Mb | 无数据 | |||||||||||||||||||||||
PubMed查找 | [2] | 无数据 | |||||||||||||||||||||||
维基数据 | |||||||||||||||||||||||||
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真核生物的SRP由长约300nt的7SL RNA和6个蛋白质(SRP9、SRP14、SRP19、SRP54、SRP68与SRP72)组成,古菌的SRP由7SL RNA和2个蛋白质組成[7],真细菌的SRP则由4.5S RNA和Fth蛋白组成[8]。SRP RNA最早在1970年在病毒中被发现[9]。真核生物的SRP RNA与tRNA与5S 核糖体RNA一样是由RNA聚合酶III转录[10]。
除组成SRP之外,有研究发现许多逆转录病毒颗粒中含有未与SRP蛋白结合的SRP RNA等宿主细胞的RNA,惟其功能尚不明[6]。另外也有研究在成纤维细胞与癌细胞互动后释放的外排体中[11],以及人类和小鼠的红细胞细胞中发现未与SRP蛋白结合的SRP RNA[12]。
人类基因组中占比超过10%、最常见的短散在核元件(SINE)Alu元件可能是自SRP RNA中间一段序列删除后衍生而来[13]。
参考文献
- Human PubMed Reference:. National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- Ulbrandt ND, Newitt JA, Bernstein HD. The E. coli signal recognition particle is required for the insertion of a subset of inner membrane proteins. Cell. 1997, 88 (2): 187–196. PMID 9008159. doi:10.1016/S0092-8674(00)81839-5.
- Zwieb C, Eichler J. Getting on target: the archaeal signal recognition particle. Archaea. 2002, 1 (1): 27–34. PMC 2685543 . PMID 15803656. doi:10.1155/2002/729649.
- Shan SO, Walter P. Co-translational protein targeting by the signal recognition particle. FEBS Letters. February 2005, 579 (4): 921–926. PMID 15680975. doi:10.1016/j.febslet.2004.11.049.
- Telesnitsky A, Wolin SL. The Host RNAs in Retroviral Particles.. Viruses. 2016, 8 (8). PMC 4997597 . PMID 27548206. doi:10.3390/v8080235.
- Rosenblad MA, Larsen N, Samuelsson T, Zwieb C. Kinship in the SRP RNA family. RNA Biology. 2009, 6 (5): 508–516. PMID 19838050. doi:10.4161/rna.6.5.9753.
- Regalia M, Rosenblad MA, Samuelsson T. Prediction of signal recognition particle RNA genes. Nucleic Acids Research. 2002, 30 (15): 3368–3377. PMC 137091 . PMID 12140321. doi:10.1093/nar/gkf468.
- Bishop JM, Levinson WE, Sullivan D, Fanshier L, Quintrell N, Jackson J. The low molecular weight RNAs of Rous sarcoma virus. II. The 7 S RNA. Virology. 1970, 42 (4): 927–937. PMID 4321311. doi:10.1016/0042-6822(70)90341-7.
- Dieci G, Fiorino G, Castelnuovo M, Teichmann M, Pagano A. The expanding RNA polymerase III transcriptome.. Trends in Genetics. 2007, 23 (12): 614–622. PMID 17977614. doi:10.1016/j.tig.2007.09.001. hdl:11381/1706964.
- Nabet BY, Qiu Y, Shabason JE, Wu TJ, Yoon T, Kim BC; et al. Exosome RNA Unshielding Couples Stromal Activation to Pattern Recognition Receptor Signaling in Cancer.. Cell. 2017, 170 (2): 352–366.e13. PMC 6611169 . PMID 28709002. doi:10.1016/j.cell.2017.06.031.
- Talhouarne GJS, Gall JG. 7SL RNA in vertebrate red blood cells.. RNA. 2018, 24 (7): 908–914. PMC 6004055 . PMID 29686135. doi:10.1261/rna.065474.117.
- Ullu E, Tschudi C. Alu sequences are processed 7SL RNA genes. Nature. 1984, 312 (5990): 171–172. PMID 6209580. doi:10.1038/312171a0.