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Lycopodiaceae
Marattiaceae
Hymenophyllaceae
Dicksoniaceae
- 金狗毛蕨属Cibotium
- 台湾金狗毛蕨Cibotium taiwanense Kuo
Plagiogyriaeae
- 瘤足蕨属Plagiogyri
- 台湾瘤足蕨 Plagiogyria formosana Na
Polypodiaceae
- 瓦苇属Lepisorus
- 拟笈瓦苇 Lepisorus monilisorus (Hayata) Tagawa
Dryopteridaceae
- 拟鳞毛蕨属Dryopsis
- 霍氏鳞毛蕨 Dryopteris holttumii
- 川上氏拟鳞毛蕨 Dryopsis kawakamii
- 玉山拟鳞毛蕨 Dryopsis transmorrisonensis
Blechnaceae
- 乌毛蕨属Blechnum
- 韩氏乌毛蕨 Blechnum hancockii Hance
- 水韭属Isoetes
- 台湾水韭 Isoetes taiwanensis DeVol
- 台东苏铁 Cycas taitungensis
- 台湾穗花杉 Amentotaxus formosana
- 台湾粗榧 Cephalotaxus wilsoniana
杨柳科 壳斗科 榆科 桑科 桑寄生科 石竹科 藜科 苋科 木兰科 五味子科 八角科 樟科 毛茛科 小蘗科 防已科 胡椒科 马兜铃科 大花草科 猕猴桃科 茶科 金丝桃科 山柑科 十字花科 金镂梅科 景天科 蔷薇科 豆科 牻牛儿苗科 大戟科 芸香科 槭树科 冬青科 卫矛科 鼠李科 葡萄科 杜英科 瑞香科 胡颓子科 堇菜科 秋海棠科 桃金娘科 野牡丹科 五加科 伞形科 杜鹃花科 紫金牛科 灰木科 木犀科 夹桃科 茜草科 紫草科 马鞭草科 唇形科 玄参科 爵床科 忍冬科 败酱科 菊科 报春花科 龙胆科 车前科
- 柳属 Salix 台湾有5种和4变种，全为特有种
- 薄叶柳 Salix fulvopubescens var.doii (Hayata) Yang & Huang 特有变种
- 褐毛柳 Salix fulvopubescens var. fulvopubescens
- 白毛柳 Salix fulvopubescens Hayata var. tagawana Koidz. 特有变种
- 水社柳 Salix kusanoi (Hayata) Schneider
- 关山岭柳 Salix okamotoana Koidz.
- 玉山柳 Salix taiwanalpina var. morrisonicola (Kimura) Yang & Huang 特有变种
- 台湾山柳 Salix taiwanalpina var. taiwanalpina
- 高山柳 Salix taiwanalpina var. takasagoalpina (Koidz.) Ying 特有变种
- 水柳 Salix warburgii O. Seemen
FAGACEAE
- 石栎属 Pasania
- 柳叶石栎 Pasania dodoniifolius Hayata
- 台湾石栎 Pasania formosana (Skan ex Forbes et. Hemsl.) Schottky
- 三斗石栎 Pasania hancei (Benth.) var. ternaticupula (Hayata) J.C. Liao
- 细叶三斗石栎 Pasania hancei (Benth.) var. ternaticupula (Hayata) Liao f. subreticulata (Hayata) Liao
- 大叶石栎 Pasania kawakamii (Hayata) Schottky
- 油叶石栎 Pasania konishii (Hayata) Schottky
- 南投石栎 Pasania nantoensis (Hayata) Schottky
- 浸水营石栎 Pasania shinsuiensis (Hayata & Kanehira) Nakai
- 青刚栎属 Cyclobalanopsis
- 谷园青刚栎 Cyclobalanopsis glauca (Thunb. ex Murray) Oerst. var. kuyuensis (Liao) Liao
- 圆果青刚栎 Cyclobalanopsis globosa (Lin & Liu) Liao
- 佳保台圆果青刚栎 Cyclobalanopsis globosa Lin & Liu f. chiapautaiensis (Liao) Liao
- 灰背栎 Cyclobalanopsis hypophaea (Hayata) Kudo
- 锥果栎 Cyclobalanopsis longinux (Hayata) Schottky
- 郭氏锥果栎 Cyclobalanopsis longinux (Hayata) Schottky var. kuoi Liao
- 紫背锥果栎 Cyclobalanopsis longinux (Hayata) Schottky var. lativiolaciifolia Liao
- 森氏栎 Cyclobalanopsis morii (Hayata) Schottky
- 波叶栎 Cyclobalanopsis rapandifolia Liao
- 狭叶栎 Cyclobalanopsis stenophylloides Hayata
- 山毛榉属 Fagus
- 台湾山毛榉 Fagus hayatae Hayata
ULMACEAE
MORACEAE
- 榕树属 FICUS
- 越橘叶蔓榕 Ficus vaccinioides Hemsl.
LORANTHACEAE
- 大叶枫寄生属 SCURRULA
- 松寄生属 TAXILLUS
- 松寄生 Taxillus matsudae (Hayata) Danser
CARYOPHYLLACEAE
- 阿里山卷耳 Cerastium arisanensis Hayata
- 小瓣卷耳 Cerastium parvipetalum Hosokawa
- 玉山卷耳 Cerastium trigynum Vill. var. morrisonense (Hayata) Hayata
- 蝇子草属SILENE
CHENOPODIACEAE
AMARANTHACEAE
- 青箱属 CELOSIA
- 台东青箱 Celosia taitoensis Hayata
MAGNOLIACEAE
SCHISANDRACEAE
ILLICIACEAE
LAURACEAE
- 樟属 CINNAMOMUM
- 桢楠属 MACHILUS
- 新木姜子属NEOLITSEA
RANUNCULACEAE
- 铁线莲属 CLEMATIS
- 毛茛属 RANUNCULUS
- 唐松草属 THALICTRUM
BERBERIDACEAE
MENISPERMACEAE
PIPERACEAE
- 椒草属PEPEROMIA
- 山椒草Peperomia nakaharai Hayata
- 胡椒属 PIPER
- 恒春风藤 Piper kawakamii Hayata
- 薄叶风藤 Piper sintenense Hatusima
- 台湾荖藤 Piper taiwanense Lin & Lu
- 马兜铃属ARISTOLOCHIA
- 瓜叶马兜铃 Aristolochia cucurbitifolia Hayata
- 细辛属 ASARUM
- 鸳鸯湖细辛 Asarum crassusepalum S. F. Huang, T. H. Hsieh & T. C. Huang
- 下花细辛 Asarum hypogynum Hayata
- 大花细辛 Asarum macranthum Hook. f.
- 太平山细辛 Asarum taipingshanianum S. F. Huang, T. H. Hsieh & T. C. Huang
RAFFLESIACEAE
- 奴草属MITRASTEMON
- 菱形奴草 Mitrastemon kanehirai Yamamoto
- 台湾奴草 Mitrastemon kawasasakii Hayata
ACTINIDIACEAE
- 猕猴桃属ACTINIDIA
- 台湾羊桃 Actinidia chinensis Planch. var. setosa Li
THEACEAE
- 杨桐属 ADINANDRA
- 台湾杨桐 Adinandra formosana Hayata
- 钝叶杨桐 Adinandra formosana Hayata var. obtusissima (Hayata) H. Keng
- 毛柱杨桐 Adinandra lasiostyla Hayata
- 茶梨属ANNESLEA
- 细叶茶梨Anneslea lanceolata (Hayata) Kanehira
- 山茶属CAMELLIA
- 恒春山茶Camellia hengchunensis Chang
- 能高山茶Camellia nokoensis Hayata
- 台湾山茶Camellia sinensis (L.) Kuntze f. formosensis Kitam.
- 细叶山茶Camellia tenuifolia (Hayata) Coh.-Stuart
- 阿里山茶Camellia transarisanensis (Hayata) Coh.-Stuart
- 泛能高山茶Camellia transnokoensis Hayata
- 红淡比属CLEYERA
- 长果红淡比 Cleyera japonica Thunb. var. longicarpa (Yamamoto) Ling & Hsieh
- 森氏红淡比 Cleyera japonica Thunb. var. morii (Yamamoto) Masam.
- 太平红淡比 Cleyera japonica Thunb. var. taipinensis H. Keng
- 柃木属EURYA
- 假柃木 Eurya crenatifolia (Yamamoto) Kobuski
- 厚叶柃木 Eurya glaberrima Hayata var. glaberrima
- 薄叶柃木 Eurya leptophylla Hayata
- 南仁山柃木 Eurya nanjenshanensis C. F. Fsieh, L. K. Ling and Sheng Z. Yang
- 莲华池柃木 Eurya rengechiensis Yamamoto
- 粗毛柃木 Eurya strigillosa Hayata
- 清水山柃木 Eurya taitungensis C. E> Chang
- 乌皮茶属Pyrenaria
- 乌皮茶 Pyrenaria shinkoensis (Hayata) H. Keng
- 武威山乌皮茶 Pyrenaria buisanensis (Sasaki) C.F.Hsieh, S.Z.Yang and M.H.Su
GUTTIFERAE
CAPPARACEAE
- 鱼木属CRATEVA
- 台湾鱼木 Crateva adansonii DC. subsp. formosensis Jacobs
CRUCIFERAE (BRASSICACEAE)
- 筷子芥属 ARABIS
- 台湾筷子芥 Arabis formosana (Masamune ex S. F. Huang) S. S. Ying
- 山芥属 BARBAREA
- 山芥菜Barbarea orthocera Ledeb. var. formosana Kitamura
- 台湾山芥菜Barbarea taiwaniana Ohwi
- 碎米荠属CARDAMINE
- 阿玉碎米荠 Cardamine agyokumontana Hayata
- 肾叶碎米荠 Cardamine reniformis Hayata
- 假山葵属COCHLEARIA
- 台湾假山葵 Cochlearia formosana Hayata
- 山荠属DRABA
- 台湾山荠 Draba sekiyana Ohwi
HAMAMELIDACEAE
- 蜡瓣花属CORYLOPSIS
- 台湾瑞木Corylopsis stenopetala Hayata
- 枫香 Liquidambar formosana Hance
CRASSULACEAE
- 灯笼草属KALANCHOE
- 佛甲草属 SEDUM
ROSACEAE
- 蔷薇属ROSA
- 铺地蜈蚣属COTONEASTER
- 枇杷属ERIOBOTRYA
- 武威山枇杷 Eriobotrya deflexa forma buisanensis (Hayata) Nakai
- 台湾枇杷 Eriobotrya deflexa forma deflexa
- 蚊子草属FILIPENDULA
- 台湾蚊子草 Filipendula kiraishiensis Hayata
- 草莓属FRAGARIA
- 台湾草莓 Fragaria hayatai Makino
- 石楠属PHOTINIA
- 台东石楠 Photinia ardisiifolia Hayata
- 毛瓣石楠 Photinia lasiopetala Hayata
- 玉山假沙梨 Photinia niitakayamensis Hayata
- 翻白草属POTENTILLA
- 雪山翻白草 Potentilla tugitakensis Masamune
- 老叶儿树属POURTHIAEA
- 清水石楠 Pourthiaea chingshuiensis T. Shimizu
- 台湾石楠 Pourthiaea lucida Decaisne
- 假皂荚属 PRINSEPIA
- 假皂荚 Prinsepia scandens Hayata
- 梅属PRUNUS
- 火刺木属PYRACANTHA
- 台湾火刺木 Pyracantha koidzumii (Hayata) Rehd.
- 梨属PYRUS
- 台湾野梨 Pyrus taiwanensis Iketani & Ohashi
- 悬钩子属RUBUS
- 梣叶悬钩子Rubus fraxinifoliolus Hayata
- 桑叶悬钩子Rubus kawakamii Hayata
- 兰屿悬钩子Rubus lanyuensis Chang
- 雾社悬钩子Rubus linearifoliolus Hayata
- 尾叶悬钩子Rubus morii Hayata
- 粗毛悬钩子Rubus nagasawanus Koidz.
- 小梣叶悬钩子Rubus parviaraliifolius Hayata
- 李栋山悬钩子Rubus ritozanensis Sasaki
- 刺花悬钩子Rubus taitoensis var. aculeatiflorus (Hayata) Ohashi & Hsieh
- 台东刺花悬钩子Rubus taitoensis var. taitoensis 特有变种
- 台湾莓 Rubus taiwanicolus Koidz. & Ohwi
- 长尾叶悬钩子Rubus urophyllus Y. C. Liu & F. Y. Lu ex F. Y. Lu
- 玉里悬钩子Rubus yuliensis Liu & Lu
- 花楸属SORBUS
- 峦大花楸Sorbus randaiensis (Hayata) Koidz.
- 绣线菊属SPIRAEA
LEGUMINOSAE ( FABACEAE)
- 土𪢮儿属APIOS
- 台湾土𪢮儿Apios taiwanianus Hosokawa
- 紫云英属ASTRAGALUS
- 南湖大山紫云英Astragalus nankotaizanensis Sasaki
- 能高大山紫云英Astragalus nokoensis Sasaki
- 假含羞草属CHAMAECRISTA
- 鹅銮鼻决明Chamaecrista garambiensis (Hosokawa) Ohashi
- 野百合属CROTALARIA
- 红花假地蓝Crotalaria chiayiana Liu & Lu
- 鹅銮鼻野百合Crotalaria similis Hemsl.
- 木山蚂蝗属DENDROLOBIUM
- 变节山蚂蝗Dendrolobium dispermum (Hayata) Schindl.
- 鱼藤属DERRIS
- 疏花鱼藤Derris laxiflora Benth.
- 山蚂蝗属DESMODIUM
- 细叶山蚂蝗Desmodium gracilium Hemsl.
- 扁豆属DOLICHOS
- 二裂叶扁豆Dolichos trilobus L. var. kosyuensis (Hosokawa) Ohashi
- 山黑扁豆属DUMASIA
- 苗栗野豇豆Dumasia miaoliensis Liu & Lu
- 大豆属GLYCINE
- 扁豆荚大豆Glycine dolichocarpa Tateishi & Ohashi
- 木蓝属INDIGOFERA
- 猫鼻头木蓝Indigofera byobiensis Hosokawa
- 腺叶木蓝Indigofera glandulifera Hayata
- 太鲁阁木蓝Indigofera ramulosissima Hosokawa
- 台湾木蓝Indigofera taiwaniana Huang & Wu
- 马鞍树属MAACKIA
- 台湾马鞍树Maackia taiwanensis Hoshi & Ohashi
GERANIACEAE
- 牻牛儿苗属GERANIUM
- 单花牻牛儿苗Geranium hayatanum Ohwi
- 山牻牛儿苗Geranium suzukii Masamune
EUPHORBIACEAE
- 五月茶属 ANTIDESMA
- 南仁五月茶 Antidesma hiiranense Hayata
- 地锦草属CHAMAESYCE
- 新竹地锦Chamaesyce hsinchuensis Lin & Chaw
- 田代氏大戟 Chamaesyce tashiroi (Hayata) Hara
- 铁色属DRYPETES
- 交力坪铁色 Drypetes karapinensis (Hayata) Pax
- 大戟属 EUPHORBIA
- 台湾大戟 Euphorbia formosana Hayata
- 霞山大戟 Euphorbia shouanensis Keng
- 太鲁阁大戟 Euphorbia tarokoensis Hayata
- 土沉香属 EXCOECARIA
- 兰屿土沉香 Excoecaria kawakamii Hayata
- 白树属GELONIUM
- 白树仔 Gelonium aequoreum Hance
- 假黄杨属 LIODENDRON
- 台湾假黄杨 Liodendron formosanum (Kanehira & Sasaki) Keng
- 油柑属PHYLLANTHUS
- 新竹油柑 Phyllanthus oligospermus Hayata
RUTACEAE
- 月橘属 MURRAYA
- 山黄皮 Murraya euchrestifolia Hayata
- 花椒属 ZANTHOXYLUM
- 屏东花椒 Zanthoxylum wutaiense Chen
ACERACEAE
AQUIFOLIACEAE
CELASTRACEAE
- 卫矛属 EUONYMUS
- 厚叶卫矛 Euonymus carnosus Hemsl.
- 淡绿叶卫矛 Euonymus pallidifolius Hayata
- 卵叶刺果卫矛 Euonymus trichocarpus Hayata
- 假卫矛属MICROTROPIS
- 恒春假卫矛 Microtropis matsudai (Hayata) Koidz.
- 核子木属PERROTTETIA
- 佩罗特木 Perrottetia arisanensis Hayata
RHAMNACEAE
- 鼠李属RHAMNUS
- 清水鼠李 Rhamnus chingshuiensis var. chingshuiensis
- 中原氏鼠李 Rhamnus nakaharai (Hayata) Hayata
- 毕禄山鼠李 Rhamnus pilushanensis Liu & Wang
- 雀梅藤属SAGERETIA
- 峦大雀梅藤Sageretia randaiensis Hayata
- 翼核木属 VENTILAGO
- 翼核木Ventilago elegans Hemsl.
VITACEAE
- CISSUS 粉藤属
- 兰屿粉藤 Cissus lanyuensis (Chang) Lu
- 翼茎粉藤 Cissus pteroclada Hayata
- 崖爬藤属TETRASTIGMA
- 翼柄崖爬藤 Tetrastigma alatum Li
- 三叶崖爬藤 Tetrastigma formosanum (Hemsl.) Gagnep.
- 台湾崖爬藤 Tetrastigma umbellatum (Hemsl.) Nakai
ELAEOCARPACEAE
- 猴欢喜属 SLOANEA
- 猴欢喜 Sloanea formosana Li
THYMELAEACEAE
- 瑞香属 DAPHNE
- 阿里山瑞香 Daphne arisanensis Hayata
- 白花瑞香 Daphne kiusiana Miq. var. atrocaulis (Rehder) Maekawa
- 玉山瑞香 Daphne nana Tagawa
- 荛花属WIKSTROEMIA
- 红荛花 Wikstroemia mononectaria Hayata
ELAEAGNACEAE
- 胡颓子属 ELAEAGNUS
- 台湾胡颓子Elaeagnus formosana Nakai
- 蓬莱胡颓子Elaeagnus formosensis Hatusima
- 慈恩胡颓子Elaeagnus grandifolia Hayata
- 太鲁阁胡颓子Elaeagnus tarokoensis S. Y. Lu & Y. P. Yang
- 邓氏胡颓子Elaeagnus thunbergii Serv.
VIOLACEAE
- 喜岩堇菜Viola adenothrix Hayata
- 台湾堇菜Viola formosana var. formosana
- 尖山堇菜 Viola senzanensis Hayata
BEGONIACEAE
- 秋海棠属BEGONIA
- 南台湾秋海棠Begonia austrotaiwanensis Chen & Peng
- 九九峰秋海棠Begonia boufordii
- 武威山秋海棠Begonia buimontana Yamamoto
- 溪头秋海棠Begonia chitoensis Liu & Lai
- 出云山秋海棠Begonia chuyunshanensis
- 鹿谷秋海棠Begonia lukuana Liu & Ou
- 南投秋海棠Begonia nantoensis Lai & Chung
- 坪林秋海棠Begonia pinlingensis
- 岩生秋海棠Begonia ravenii Peng & Chen
- 台湾秋海棠Begonia taiwaniana Hayata
- 太鲁阁秋海棠Begonia tarokoensis Lai已被合并至水鸭脚 B. formosana
- 藤枝秋海棠Begonia tenchiana
- 雾台秋海棠Begonia wutaiana
MYRTACEAE
- 赤楠属SYZYGIUM
- 细脉赤楠Syzygium euphlebium (Hayata) Mori
- 台湾赤楠Syzygium formosanum (Hayata) Mori
- 高士佛赤楠Syzygium kusukusense (Hayata) Mori
MELASTOMATACEAE
- 金石榴属 BREDIA
- 小金石榴Bredia gibba Ohwi
- 金石榴Bredia oldhamii Hooker f.
- 圆叶布勒德藤Bredia rotundifolia Y. C. Liu & C. H.Ou
- 野牡丹藤属MEDINILLA
- 兰屿野牡丹藤Medinilla hayataina Keng
- 耳药花属 OTANTHERA
- 糙叶耳药花Otanthera scaberrima (Hayata) Ohwi
- 厚距花属PACHYCENTRIA
- 台湾厚距花Pachycentria formosana Hayata
ARALIACEAE
UMBELLIFERAE (APIACEAE)
- 当归属ANGELICA
- 野当归Angelica dahurica (Fisch.) Benth. & Hook. var. formosana (Boiss.) Yen
- 森氏当归Angelica morii Hayata
- 玉山当归Angelica morrisonicola Hayata var. morrisonicola
- 太鲁阁当归Angelica tarokoensis Hayata
- 柴胡属BUPLEURUM
- 高氏柴胡Bupleurum kaoi Liu, Chao & Chuang
- 弯柱芎属Conioselinum
- 玉山弯柱芎Conioselinum morrisonense Hayata
- 天胡荽属HYDROCOTYLE
- 基隆天胡荽Hydrocotyle keelungensis Liu, Chao & Chuang
- 水芹菜属OENANTHE
- 翼茎水芹菜Oenanthe pterocaulon Liu, Chao & Chuang
- 山熏香属OREOMYRRHIS
- 前胡属 PEUCEDANUM
- 台湾前胡Peucedanum formosanum Hayata
- 茴香属PIMPINELLA
- 玉山茴香Pimpinella niitakayamensis Hayata
- 山芹菜属SANICULA
- 五叶山芹菜Sanicula petagioides Hayata
ERICACEAE
- 杜鹃花属RHODODENDRON
- 南奥社鹃Rhododendron breviperulatum Hayata
- 台湾杜鹃Rhododendron formosanum Hemsl.
- 南湖杜鹃Rhododendron hyperythrum Hayata
- 乌来杜鹃Rhododendron kanehirai Wilson
- 着生杜鹃Rhododendron kawakamii Hayata
- 细叶杜鹃Rhododendron noriakianum T. Suzuki
- 金毛杜鹃Rhododendron oldhamii Maxim.
- 玉山杜鹃Rhododendron pseudochrysanthum Hayata
- 红毛杜鹃Rhododendron rubropilosum Hayata var. rubropilosum
- 台湾高山杜鹃Rhododendron rubropilosumvar. taiwanalpinum (Ohwi) S. Y. Lu, Y. P. Yang & Y. H. Tseng (特有变种)
- 越橘属VACCINIUM
- 凹叶越橘Vaccinium emarginatum Hayata
- 鞍马山越橘Vaccinium kengii C. E. Chang
- 高山越橘Vaccinium merrillianum Hayata
MYRSINACEAE
- 紫金牛属ARDISIA
- 高士佛紫金牛Ardisia kusukuensis Hayata
SYMPLOCACEAE
- 灰木属 SYMPLOCOS
- 薄叶灰木Symplocos eriostroma Hayata
- 恒春灰木Symplocos koshunensis Kanehira
- 拟日本灰木 Symplocos migoi Nagamasu
- 玉山灰木Symplocos morrisonicola Hayata
- 小泉氏灰木Symplocos koitzumiana
- 能高山灰木Symplocos nokoensis (Hayata) Kanehira
- 佐佐木氏灰木 Symplocos sasakii Hayata
- 希兰灰木Symplocos shilanensis Y. C. Liu & F. Y. Lu
OLEACEAE
- 女贞属LIGUSTRUM
- 玉山女贞 Ligustrum morrisonense Kanehira & Sasaki
- 木犀属OSMANTHUS
- 无脉木犀Osmanthus enervis Masamune & Mori
- 高氏木犀Osmanthus kaoi (Liu & Liao) S. Y. Lu
- 锐叶木犀 Osmanthus lanceolatus Hayata
APOCYNACEAE
- 念珠藤属ALYXIA
- 兰屿念珠藤Alyxia insularis Kanehira & Sasaki
- 锦兰属ANODENDRON
- 大锦兰 Anodendron benthamiana Hemsl.
- 牛皮消属CYNANCHUM
- 兰屿牛皮消Cynanchum lanhsuense Yamazaki
- 布朗藤属HETEROSTEMMA
- 布朗藤 Heterostemma brownii Hayata
- 山橙属 MELODINUS
- 山橙 Melodinus angustifolius Hayata
- 络石属 TRACHELOSPERMUM
- 台湾络石 Trachelospermum formosanum Y. C. Liu & C. H. Ou
RUBIACEAE
- 伏牛花属 DAMNACANTHUS
- 无刺伏牛花 Damnacanthus angustifolius Hayata
- 猪殃殃属 GALIUM
- 耳草属HEDYOTIS
- 臭凉喉茶 Hedyotis butensis Masam.
- 鸡屎树属LASIANTHUS
- 密毛鸡屎树 Lasianthus appressihirtus Simizu var. appressihirtus
- 薄叶鸡屎树 Lasianthus microstachys Hayata
- 蛇根草属 OPHIORRHIZA
- 早田氏蛇根草 Ophiorrhiza hayatana Ohwi.
- 茜草属 RUBIA
- 林氏茜草 Rubia linii Chao
- 玉心花属 TARENNA
- 薄叶玉心花 Tarenna gracilipes （Hayata）Ohwi
BORAGINACEAE
- 琉璃草属 CYNOGLOSSUM
- 高山倒提壶 Cynoglossum alpestre Ohwi
- 天芹菜属 HELIOTROPIUM
- 山豆根 Heliotropium formosanum I. M. Johnst.
- 附地草属 TRIGONOTIS
- 台北附地草 Trigonotis elevatovenosa Hayata
- 台湾附地草 Trigonotis formosana Hayata
- 南湖附地草 Trigonotis nankotaizanensis (Sasaki) Masam. & Ohwi ex Masam.
VERBENACEAE
LABIATAE
- 绵穗苏属COMANTHOSPHACE
- 台湾白木草 Comanthosphace formosana Ohwi
- 锥花属GOMPHOSTEMMA
- 台湾锥花 Gomphostemma calliucarpoides （Yamamoto）Masamune
- 偏穗花属 KEISKEA
- 大苞偏穗花 Keiskea macrobracteata Masam.
- 假糙苏属 PARAPHLOMIS
- 绒萼舞子草 Paraphlomis tomentoso-capitata Yamamoto
- 刺蕊草属 POGOSTEMON
- 台湾刺蕊草 Pogostemon formosanus Oliv.
- 鼠尾草属 SALVIA
- 阿里山紫花鼠尾草 Salvia arisanensis Hayata
- 红花鼠尾草 Salvia coccinea Juss. ex Murr.
- 台湾紫花鼠尾草 Salvia formosana （Murata）Tamazaki var. formosana
- 蕨叶紫花鼠尾草 Salvia formosana （Murata）Tamazaki var. matsudae （Kudo）Huang & Wu
- 早田氏鼠尾草 Salvia hayatana Makino ex Hayata
- 隐药鼠尾草 Salvia keitaoensis Hayata
- 黄花鼠尾草 Salvia nipponica Miq. var. formosana（Hayata）Kudo
- 黄芩属 SCUTELLARIA
- 南台湾黄芩 Scutellaria austrotaiwanensis Hsieh & Huang
- 布烈氏黄芩 Scutellaria playfairi Kudo
- 台湾黄芩 Scutellaria taiwanensis Wu
- 田代氏黄芩 Scutellaria tashiroi Hayata
- 铃木草属 SUZUKIA
- 铃木草 Suzukia shikikunensis Kudo
- 香科科属 TEUCRIUM
- 台湾香科科 Teucrium taiwanianum Hsieh & Huang
SCROPHULARIACEAE
- 碎雪草属 EUPHRASIA
- 南湖碎雪草 Euphrasia nankotaizanensis Yamamoto
- 太鲁阁小米草 Euphrasia tarokoana Ohwi
- 玉山小米草 Euphrasia transmorrisonensis Hayata
- 石龙尾属LIMNOPHILA
- 桃园石龙尾 Limnophila taoyuanensis Yang & Yen
- 母草属 LINDERNIA
- 台南见风红 Lindernia scutellariiformis Yamazaki
- 通泉草属MAZUS
- 高山通泉草 Mazus alpinus Masam.
- 马先蒿属 PEDICULARIS
- 高山马先蒿 Pedicularis ikomai Sasaki
- 玄参属 SCROPHULARIA
- 双锯齿玄参 Scrophularia yoshimurae Yamazaki
- 婆婆纳属VERONICA
- 玉山水苦荬 Veronica morrisonicola Hayata
- 贫子水苦荬 Veronica oligosperma Hayata
- 台湾水苦荬 Veronica taiwanica Yamazaki
- 腹水草属 VERONICASTRUM
- 台湾腹水草 Veronicastrum formosanum (Masam.) Yamazaki
- 高山腹水草 Veronicastrum kitamurae (Ohwi) Yamazaki
ACANTHACEAE
- 针刺草属 CODONACANTHUS
- 银脉爵床 Codonacanthus albo-nervosa (Hosok.) Yang, comb. nov.
- 鳞球花属LEPIDAGATHIS
- 柳叶鳞球花 Lepidagathis stenophylla Clarke ex Hayata
- 马蓝属STROBILANTHES
- 曲茎马蓝 Strobilanthes flexicaulis Hayata
- 台湾马蓝 Strobilanthes formosanus Moore
- 长穗马蓝 Strobilanthes longespicatus Hayata
- 兰嵌马蓝 Strobilanthes rankanensis Hayata
CAPRIFOLIACEAE
- 忍冬属LONICERA
- 无梗忍冬 Lonicera apodantha Ohwi
- 川上氏忍冬 Lonicera kawakamii (Hayata) Masamune
- 追分忍冬 Lonicera oiwakensis Hayata
- 荚属VIBURNUM
- 着生珊瑚树 Viburnum arboricolum Hayata
- 玉山糯米树 Viburnum integrifolium Hayata
- 小叶荚迷 Viburnum parvifolium Hayata
- 台东荚迷 Viburnum taitoense Hayata
VALERIANACEAE
- 败酱属 PATRINIA
- 秃败酱 Patrinia glabrifolia Yamamoto & Sasaki
COMPOSITAE (ASTERACEAE )
- 鬼督邮属 AINSLIAEA
- 中原氏鬼督邮 Ainsliaea secundiflora Hayata
- 籁箫属ANAPHALIS
- 蓬莱籁箫 Anaphalis horaimontana Masam.
- 蒿属ARTEMISIA
- 山艾 Artemisia kawakamii Hayata
- 细叶山艾 Artemisia morrisonensis Hayata
- 玉山艾 Artemisia niitakayamensis Hayata
- 高山艾 Artemisia oligocarpa Hayata
- 相马氏艾（台湾狭叶艾） Artemisia somai Hayata var. somai
- 太鲁阁艾 Artemisia somai Hayata var. batakensis (Hayata) Kitam. 特有变种
- 雪山艾 Artemisia tsugitakaensis (Kitam.) Ling & Y. R. Ling
- 紫菀属ASTER
- 清水马兰 Aster chingshuiensis Y. C. Liu & C. H. Ou
- 台湾山白兰 Aster formosanus Hayata
- 大武山紫菀 Aster itsunboshi Kitam.
- 玉山铁杆蒿 Aster morrisonensis Hayata
- 台湾狗娃花 Aster oldhamii Hemsl.
- 台湾绀菊 Aster ovalifolius Kitam.
- 台湾马兰 Aster taiwanensis Kitam.
- 雪山马兰 Aster takasagomontanus Sasaki
- 桃园马兰 Aster taoyuenensis S. S. Ying
- 艾纳香属BLUMEA
- 狭叶艾纳香 Blumea linearis C.-I Peng & W. P. Leu
- 蓟属CIRSIUM
- 阿里山蓟 Cirsium arisanense Kitam.
- 鳞毛蓟 Cirsium ferum Kitam.
- 细川氏蓟 Cirsium hosokawae Kitam.
- 玉山蓟（川上氏蓟）Cirsium kawakamii Hayata
- 森氏蓟 Cirsium morii Hayata
- 铃木氏蓟 Cirsium suzukii Kitam.
- 假黄鹌菜属Crepidiastrum
- 台湾假黄鹌菜 Crepidiastrum taiwanianum Nakai
- 菊属 DENDRANTHEMA
- 阿里山油菊 Dendranthema arisanense (Hayata) Y. Ling & C. Shih
- 蓬莱油菊 Dendranthema horaimontana (Masam.) S. S. Ying
- 森氏菊 Dendranthema morii (Hayata) Kitam.
- 飞蓬属Erigeron
- 玉山飞蓬 Erigeron morrisonensis Hayata var. morrisonensis
- 福山氏飞蓬 Erigeron morrisonensis Hayata var. fukuyamae (Kitam.) Kitam. 特有变种
- 泽兰属 Eupatorium
- 腺叶泽兰 Eupatorium amabile Kitm.
- 花莲泽兰 Eupatorium hualienense C. H. Ou, S. W. Chung & C.-I Peng
- 岛田氏泽兰 Eupatorium shimadai Kitam.
- 三七草属Gynura
- 兰屿木耳菜 Gynura elliptica Yabe & Hayata
- 白凤菜Gynura formosana
- 山柳菊属Hieracium
- 森氏山柳菊 Hieracium morii Hayata
- 小苦贾属 IXERIDIUM
- 能高刀伤草 Ixeridium transnokoense (Sasaki) J. H. Pak &Kawano
- 稻槎菜属 LAPSANASTRUM
- 台湾稻槎菜 Lapsanastrum takasei (Sasaki) J. H. Pak & K. Bremer
- 薄雪草属 LEONTOPODIUM
- 玉山薄雪草 Leontopodium microphyllum Hayata
- 橐吾属 LIGULARIA
- 高山橐吾 Ligularia kojimae Kitam.
- 羽叶千里光属Nemosenecio
- 台湾刘寄奴 Nemosenecio formosanus (Kitam.) B. Nord.
- 紫菊属 NOTOSERIS
- 台湾福王草（台湾紫菊）Notoseris formosana (Kitam.) C. Shih
- 蟹甲草属Parasenecio
- 玉山蟹甲草 Parasenecio monantha (Diels) C.-I Peng & S. W. Chung
- 能高蟹甲草 Parasenecio nokoensis (Masam. & Suzuki) C.-I Peng & S. W. Chung
- 高野帚属Pertya
- 半高野帚 Pertya simozawai Masam.
- 款冬属 PETASITES
- 台湾款冬 Petasites formosanus Kitam.
- 毛莲菜属Picris
- 玉山毛莲菜 Picris hieracioides L.
- 青木香属Saussurea
- 高山青木香 Saussurea glandulosa Kitam.
- 关山青木香 Saussurea kanzanensis Kitam.
- 奇莱青木香 Saussurea kiraisanensis Masam.
- 黄菀属（千里光属）Senecio
- 小蔓黄菀 Senecio crataegifolius Hayata
- 玉山黄菀 Senecio morrisonensis Hayata
- 台东黄菀 Senecio taitungensis S. S. Ying
- 太鲁阁千里光 Senecio tarokoensis C.-I Peng
- 破伞菊属 SYNEILESIS
- 台湾破伞菊 Syneilesis intermedia (Hayata) Kitam.
- 高山破伞菊 Syneilesis subglabrata (Yamam. & Sasaki) Kitam.
- 狗舌草属 TEPHROSERIS
- 台湾狗舌草 (台东黄菀) Tephroseris taitoensis (Hayata) Holub
LILIACEAE
- 粉条儿属 ALETRIS
- 台湾粉条儿 Aletris formosana (Hayata) H.-Y. Liu comb. nov.
- 葱属 ALLIUM
- 玉山蒜 Allium morrisonense Hayata
- 蜘蛛抱蛋属 ASPIDISTRA
- 薄叶蜘蛛抱蛋 Aspidistra attenuata Hayata
- 大武蜘蛛抱蛋 Aspidistra daibuensis Hayata
- 假宝铎花属 DISPOROPSIS
- 阿里山假宝铎花 Disporopsis arisanensis Hayata
- 宝铎花属（万寿竹属） DISPORUM
- 台湾宝铎花 Disporum cantoniense (Lour.) Merr. var. kawakamii (Hayata) Hara
- 山宝铎花 Disporum sessile D. Don ex Schultes var. shimadai (Hayata) Hara
- 胡麻花属 HELONIOPSIS
- 台湾胡麻花 Heloniopsis umbellata Baker
- 百合属 LILIUM
- 鹿药属 MAIANTHEMUM
- 鹿药 Maianthemum formosanum (Hayata) LaFrankie
- 球子草属 PELIOSANTHES
- 高氏球子草 Peliosanthes kaoi Ohwi
- 油点草属 TRICYRTIS
- 台湾油点草 Tricyrtis formosana Baker
- 毛果油点草 Tricyrtis lasiocarpa Matsumura
- 卵叶油点草 Tricyrtis ovatifolia S. S. Ying
- 铃木油点草 Tricytis suzukii Masamune
SMILACACEAE
- 土茯苓属 HETEROSMILAX
- 台中假土茯苓 Heterosmilax seisuiensis (Hayata) Wang＆Tang
- 菝葜属 SMILAX
- 细叶菝葜 Smilax elongato-umbellata Hayata
- 早田氏菝葜 Smilax hayatae T. Koyama
- 南投菝葜 Smilax nantoensis T. Koyama
IRIDACEAE
- 鸢尾属 IRIS
- 台湾鸢尾 Iris formosana Ohwi
JUNCACEAE
- 灯心草属 JUNCUS
- 玉山灯心草 Juncus triflorus Ohwi
- 地杨梅属 LUZULA
- 台湾地杨梅 Luzula taiwaniana Satake
COMMELINACEAE
- 假紫万年青属 BELOSYNAPSIS
- 川上氏鸭舌疝 Belosynapsis kawakamii（Hayata）C. I.Peng＆Y.J.Chen
XYRIDACEAE
- 茐草属 XYRIS
- 桃园草 Xyris formosana Hayata
ERIOCAULACEAE
- 谷精草属 Eriocaulon
- 连萼谷精草 Eriocaulon buergerianum Koern.
CYPERACEAE
- 薹属 CAREX
- 长梗扁果薹 Carex longistipes Hayata
- 森氏薹 Carex morii Hayata
- 直蕊宿柱薹 Carex orthostemon Hayata
- 太鲁阁薹 Carex purpureotincta Ohwi
- 台北薹（锐果薹）Carex taihokuensis Hayata
- 台湾疏花薹 Carex taiwanensis (Ohwi) Akiyama
- 大武宿柱薹 Carex transalpine Hayata
- 扁果薹 Carex urelytra Ohwi
- 飘拂草属 FIMBRISTYLIS
- 白穗飘拂草 Fimbristylis shimadana Ohwi
- 知本飘拂草 Fimbristylis subinclinata T. Koyama
GRAMINEAE（POACEAE）
- 鹅观草属 AGROPYRON
- 台湾鹅观草 Agropyron formosanum Honda
- 剪股颖属 AGROSTIS
- 阿里山剪股颖 Agrostis clavata Trin var. arisan-montana Miq.
- 伯明剪股颖 Agrostis clavata Trin var. fukuyamae (Ohwi) Veldkemp
- 芦竹属 ARUNDO
- 台湾芦竹 Arundo formosana Hack.
- 马唐属 DIGITARIA
- 佛欧里马唐 Digitaria fauriei Ohwi
- 大绒马唐 Digitaria magna (Honda) Tsuyama
- 绒马唐 Digitaria mollicoma (Kunth) Henrard
- 绢毛马唐 Digitaria sericea (Honda) Honda
- 油芒属 ECCOILOPUS
- 台湾油芒 Eccoilopus formosanus (Rendle) A. Camus
- 画眉草属 ERAGROSTIS
- 毛叶知风草 Eragrostis pilosiuscula Ohwi
- 蔗茅属 ERIANTHUS
- 紫台蔗茅 Erianthus formosanus Stapf
- 羊茅属 FESTUCA
- 台湾羊茅 Festuca formosana Honda
- 莠竹属 MICROSTEGIUM
- 法利莠竹 Microstegium fauriei (Hayata) Honda
- 短轴莠竹 Microstegium glaberrimum (Honda) Koidz.
- 相马莠竹 Microstegium somai (Hayata) Ohwi
- 茅根草属 PEROTIS
- 大穗茅根 Perotis macrantha Honda
- 裂稃草属 SCHIZACHYRIUM
- 尖叶裂稃草 Schizachyrium fragile (R.Br.) A. Camus var. shimadae (Ohwi) C. Hsu
- 大油芒属 SPODIOPOGON
- 台南大油芒 Spodiopogon tainanensis Hayata
- 假蛇尾草属 THAUMASTOCHLOA
- 其昌假蛇尾草 Thaumastochloa chenii C. Hsu
BAMBOOS
- 青篱竹属 ARUNDINARIA
- 蓬莱竹属 BAMBUSA
- 孟宗竹属 PHYLLOSTACHYS
ARACEAE
- 蒟蒻属 AMORPHOPHALLUS
- 台湾魔芋 Amorphophallus henryi N. E. Br.
- 密毛魔芋 Amorphophallus hirtus N. E. Br.
- 天南星属 Arisaema
- 台湾天南星 Arisaema formosanum（Hayata）Hayata
- 毛笔天南星 Arisaema grapsospadix Hayata
- 宜兰天南星 Arisaema ilanense J. C. Wang
- 线花天南星 Arisaema matsudae Hayata
- 南仁山天南星 Arisaema nanjenense T. C. Huang ＆M. J. Wu
- 蓬莱天南星 Arisaema taiwanense J. Murata
- 东台天南星 Arisaema thunbergii Bl. subsp. autumnale J. C. Wang, J. Murata ＆ H. Ohashi特有变种
- 芋属 COLOCASIA
- 山芋 Colocasia konishii Hayata
- 扁叶芋属 HOMALOMENA
- 基隆扁叶芋 Homalomena kelungensis Hayata
- 柚叶藤属 POTHOS
- 台湾柚叶藤 疑问种 Pothos warburgii Eng
- 落檐属 SCHISMATOGLOTTIS
- 兰屿芋 Schismatoglottis kotoensis（Hayata）T. C. Huang, A. Hsiao ＆ H. Y. Yeh
ZINGIBERACEAE
- 法氏姜属 VANOVERBERGHIA
- 兰屿法氏姜 Vanoverberghia sasakiana H. Funak. ＆ H. Ohashi
- 姜属 ZINGIBER
- 少叶姜 Zingiber oligophyllum K. Schumann
ORCHIDACEAE
- 鹿角兰属 ASCOCENTRUM
- 小鹿角兰 Ascocentrum pumilum（Hayata）Schltr.
- 豆兰（石豆兰、株柄兰）属 BULBOPHYLLUM
- 根节兰属 CALANTHE (大陆称为‘虾脊兰’)
- 指柱兰属 CHEIROSTYLIS
- 斑叶指柱兰 Cheirostylis hungyehensis T. P. Lin
- 大蜘蛛兰属 CHILOSCHISTA
- 大蜘蛛兰 Chiloschista segawai（Masamune）Masamune＆Fukuyama
- 喜普鞋兰属 Cypripedium
- 石斛属 DENDROBIUM
- 红鹂石斛 Dendrobium falconeri Hayata
- 细茎石斛 Dendrobium leptocladum Hayata
- 小双花石斛 Dendrobium somai Hayata
- 著颏兰属 EPIGENEIUM
- 腊石斛 Epigeneium nakaharai（Schltr.）Surnmerh.
- 铃兰属 EPIPACTIS
- 台湾铃兰 Epipactis ohwii Fukuyama
- 斑叶兰属 GOODYERA
- 长叶斑叶兰 Goodyera bilamellata Hayata
- 南湖斑叶兰 Goodyera nankoensis Fukuyama
- 歌绿怀兰 Goodyera seikomontana Yamamoto
- 香兰属 HARAELLA
- 香兰 Haraella retrocalla（Hayata）Kudo
- 玉山一叶兰属 HEMIPILIA
- 玉山一叶兰 Hemipilia cordifolia Lindl.
- 撬唇兰属 HOLCOGLOSSUM
- 撬唇兰 Holcoglossum quasipinifolium（Hayata）Schltr.
- 双叶兰（对叶兰）属 LISTERA
- 梅峰双叶兰 Listera meifongensis Su H. J. ＆ C. Y. Hu
- 钗子股属 LUISIA
- 安朔金钗兰 Luisia cordata Fukuyama
- 齿唇兰（假金线莲）属 ODONTOCHILUS
- 二囊齿唇兰 Odontochilus bisaccatus（Hayata）Hayata ex T. P. Lin
- 石山桃属 PHOLIDOTA
- 乌来石山桃 Pholidota uraiensis Hayata
- 绣球兰属 POMATOCALPA
- 黄绣球兰 Pomatocalpa acuminata（Rolfe.）Schltr.
MELANTHIACEAE
- 中华民国行政院农委会特有生物研究保育中心（页面存档备份，存于互联网档案馆）（中文）（英文）
- 台湾生物多样性资讯入口网 （页面存档备份，存于互联网档案馆）（中文）（英文）
- 台湾特有植物 （页面存档备份，存于互联网档案馆） 数位典藏相关
- 台湾原生的坪林秋海棠 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
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