劍菌屬(學名:Ensifer)是根瘤菌目根瘤菌科下的一屬。中華根瘤菌屬(學名:Sinorhizobium)是劍菌屬的同屬異名。中華根瘤菌屬中的草木樨中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)[4][5]與苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium medicae)[6]進行過測序。
劍菌屬/中華根瘤菌屬 | |
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費氏中華根瘤菌USDA257 | |
科學分類 | |
域: | 細菌域 Bacteria |
門: | 假單胞菌門 Pseudomonadota |
綱: | α-變形菌綱 Alphaproteobacteria |
目: | 根瘤菌目 Rhizobiales |
科: | 根瘤菌科 Rhizobiaceae |
屬: | 劍菌屬 Ensifer Casida, 1982 |
模式種 | |
劍菌屬:附着劍菌 Ensifer adhaerens Casida, 1982 中華根瘤菌屬:費氏中華根瘤菌 Sinorhizobium fredii (Scholla and Elkan 1984) Chen et al. 1988 | |
物種[1][2][3] | |
見內文 | |
異名 | |
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名稱
該屬曾先後於1982年與1988年被命名為劍菌屬(Ensifer)與中華根瘤菌屬(Sinorhizobium)。根據國際原核微生物系統學委員會(International Committee on Systematics of Prokaryotes,ISCP)的《細菌學法規》(Bacteriological Code)規定,發表時間更早的名稱有優先命名權。[7]由於有人提議將當時劍菌屬的唯一物種附着劍菌(Ensifer adhaerens)併入中華根瘤菌屬,為此ISCP設立了一個專門分委會對此進行評估。最終劍菌屬保留其名稱,並將所有中華根瘤菌屬的物種併入劍菌屬之中。[8][9]雖然如此,在大多學術著作中還是同時延用了這兩個名稱,而中華根瘤菌屬一名則更為常見。
下屬物種
本屬包括以下物種:[10]
- 附着劍菌 Ensifer adhaerens Casida 1982[11]
- 鹼土劍菌 Ensifer alkalisoli Li et al. 2016
- Ensifer americanus (Toledo et al. 2004) Wang et al. 2015,也拼作:Ensifer americanum
- Ensifer arboris (Nick et al. 1999) Young 2003
- Ensifer aridi Rocha et al. 2020
- Ensifer aridi Le Quere et al. 2017
- 加拿大劍菌 Ensifer canadensis Bromfield et al. 2023
- Ensifer collicola Jang et al. 2017
- Ensifer fredii (Scholla and Elkan 1984) Young 2003
- Ensifer garamanticus Merabet et al. 2010[12]
- Ensifer glycinis Yan et al. 2016
- Ensifer kostiensis (Nick et al. 1999) Young 2003
- Ensifer kummerowiae (Wei et al. 2002) Young 2003
- Ensifer medicae (Rome et al. 1996) Young 2003
- 草木樨中華根瘤菌 Ensifer meliloti (Dangeard 1926) Young 2003
- 墨西哥劍菌 Ensifer mexicanus Lloret et al. 2011[13]
- Ensifer morelensis (Wang et al. 2002) Wang et al. 2015,也拼作:Ensifer morelense
- 努米底亞劍菌 Ensifer numidicus Merabet et al. 2010[12]
- Ensifer oleiphilus Ershov et al. 2023
- Ensifer psoraleae Wang et al. 2015
- Ensifer saheli (De Lajudie et al. 1994) Young 2003
- Ensifer sesbaniae Wang et al. 2015
- Ensifer shofinae Chen et al. 2017
- 菽劍菌 Ensifer sojae Li et al. 2011[14])
- 好客中華根瘤菌 Sinorhizobium terangae corrig. De Lajudie et al. 1994[15]
- Ensifer terangae (De Lajudie et al. 1994) Young 2003
- 新疆劍菌 Ensifer xinjiangensis (Chen et al. 1988) Young 2003
- 歸入本屬的物種:
- Sinorhizobium abri Ogasawara et all. 2003[16][17]
- 美洲中華根瘤菌 Sinorhizobium americanum corrig. Toledo et al. 2003[18]
- 木本樹中華根瘤菌 Sinorhizobium arboris Nick et al. 1999[19]
- Sinorhizobium chiapanecum Rincón-Rosales et al. 2009[20]
- 費氏中華根瘤菌 Sinorhizobium fredii Scholla and Elkan 1984 emend. De Lajudie et al. 1994[21]
- Sinorhizobium indiaense Ogasawara et all. 2003[16][17]
- 柯斯第中華根瘤菌 Sinorhizobium kostiense Nick et al. 1999[19]
- 雞眼草中華根瘤菌 Sinorhizobium kummerowiae Wei et al. 2002[22]
- 苜蓿中華根瘤菌 Sinorhizobium medicae Rome et al. 1996[23]
- 草木樨中華根瘤菌 Sinorhizobium meliloti (Dangeard 1926) De Lajudie et al. 1994[15]
- 薩赫靳中華根瘤菌 Sinorhizobium saheli De Lajudie et al. 1994[15]
- Ensifer sesbaniae Wang et al. 2015
- Ensifer shofinae Chen et al. 2017
- Ensifer sojae Li et al. 2011
- Ensifer terangae (De Lajudie et al. 1994) Young 2003
- 新疆中華根瘤菌 Ensifer xinjiangensis (Chen et al. 1988) Young 2003,為Ensifer fredii (Scholla and Elkan 1984) Young 2003的異名
參考文獻
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