基質蛋白（matrix protein，viral matrix protein）在病毒學中是一種連接病毒包膜與病毒核心的結構蛋白。許多帶有病毒包膜的病毒類型如副黏液病毒科、正黏液病毒科、疱疹病毒科、逆轉錄病毒科、絲狀病毒科等都帶有基質蛋白[1]。
常見的有流感的M1蛋白。它對宿主細胞膜的糖蛋白有親和力，而另一面對於各種的核糖核酸都有親和力，導致它能夠在細胞膜下形成一層病毒的核蛋白結構。這個結構有助於病毒成熟時能夠封裝核糖核酸並萌芽新的病毒。
當病毒進入一個細胞，病毒的基質蛋白負責驅趕其他基因物質。
參考文獻
參見
外部連結
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