三域系統（three-domain system）是由美國微生物學家和生物物理學家卡爾·烏斯等人在1990年提出的生物分類系統[1][2]，將所有細胞生命都歸分於三大域的分類階元之下，即古菌域（Archaea）、細菌域（Bacteria）和真核域（Eukarya）。
烏斯依據16S 核糖體RNA序列上的差別，將原核生物分成兩大類，起初稱為真細菌和古細菌，認為這兩類生物和真核生物一起從一個具有原始遺傳機製的最後共同祖先分別演化而來，因此將三者各置為一域，作為比「界」高一級的分類系統。古菌域下有古細菌界 (Kingdom Archaea)，細菌域下有細菌界 (Kingdom Bacteria)，真核生物域下有六個界：囊泡藻界 (Chromalveolata)、古蟲界（Excavata）、有孔蟲界（Rhizaria）、真菌界 (Fungi)、植物界（Plantae）和動物界 (Animalia)。加上其他未專屬域下有病毒，和亞病毒因子兩個界，總共有十界。
然而，rRNA樹有可能將演化太快的類群放錯位置（比如微孢子蟲）。有人認為生物的根源應該在真細菌之內，很多真細菌的類群在古細菌之前分支出來，很晚古細菌和真核生物才彼此分開。
三域特徵比較[3]
參見
參考文獻
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