鄰近連接法

鄰近連接法（英文：neighbor-joining method；又稱 NJ 法），生物資訊學術語，是一種用於構建系統發生樹（演化樹）的快速聚類方法，由日本遺傳學家齋藤成也（平文式羅馬字：Saitou Naruya）和日裔美國生物學家根井正利（Nei Masatoshi）二人在1987年創立^[2]。使用鄰近連接法構建演化樹時，通常需要基於 DNA 序列或蛋白質數據，以此了解每對分類單元之間的距離，通過確定距離最近（或相鄰）的成對分類單元使演化樹的總距離達到最小，循環地將相鄰點合併成新的點，最終形成完整的樹型^[3][4]。

2002年日本國立遺傳學研究所學者齋藤成也根據世界上18個人類族群的23種遺傳訊息，以鄰近連接法估算而成的遺傳距離分支圖。^[1]

鄰近連接法不需要關於分子鐘的假設，不考慮任何優化標準，基本思想是進行類的合併時，不僅要求待合併的類是相近的，而且要求待合併的類遠離其他的類，從而通過對完全沒有解析出的星型演化樹進行分解，來不斷改善星型演化樹^[5]。

參閱

• 最鄰近搜索

參考文獻

• 生物學主題

1. モンゴロイドの形成. 九州大學総合研究博物館（日語：九州大学総合研究博物館）.（日語）
2. Saitou, N. & Nei, M. The neighbor-joining method: a new method for reconstructing phylogenetic trees. Molecular Biology and Evolution（英語：Molecular Biology and Evolution）. 1987-07-01, 4 (4): 406–425 [2020-09-19]. PMID 3447015. doi:10.1093/oxfordjournals.molbev.a040454 . 原始內容存檔於2014-12-25.
3. Didelot, Xavier. "Sequence-Based Analysis of Bacterial Population Structures". Robinson, D. Ashley; Falush, Daniel & Feil, Edward J (編). Bacterial Population Genetics in Infectious Disease. Hoboken, NJ: John Wiley and Sons. 2010: 46–47 [2021-07-02]. ISBN 978-0-470-42474-2. （原始內容存檔於2021-07-25）.
4. 第二屆植物學名詞審定委員會 (編). 植物学名词 (2版). 北京: 科學出版社. 2019 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-062178-8. （原始內容存檔於2021-10-23）.（簡體中文）
5. 古生物學名詞審定委員會 (編). 古生物学名词 (2版). 北京: 科學出版社. 2009 [2021-10-23]. ISBN 978-7-03-025433-7. （原始內容存檔於2021-10-23）.（簡體中文）

外部連結

• 鄰近連接法運用教程 （頁面存檔備份，存於互聯網檔案館）