天冬氨酸蛋白酶 (英語:Aspartic protease)是一種催化類型的蛋白酶,它使用一個或多個天冬氨酸殘基結合的活化水分子來催化其肽底物。通常,它們在活性位點具有兩個高度保守的天冬氨酸,在酸性pH條件下具有最佳活性。幾乎所有已知的天冬氨酰蛋白酶都被胃酶抑素抑制。

Quick Facts 真核天冬氨酰蛋白酶, 鑑定 ...
真核天冬氨酰蛋白酶
二聚體天冬氨酸蛋白酶HIV蛋白酶的結構為白色和灰色,肽底物為黑色,活性位點天冬氨酸側鏈為紅色。(蛋白質資料庫:1KJF)
鑑定
標誌Asp
PfamPF00026舊版
InterPro英語InterProIPR001461
PROSITE英語PROSITEPDOC00128
SCOP英語Structural Classification of Proteins1mpp / SUPFAM
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database家族100
OPM英語Orientations of Proteins in Membranes database蛋白1lyb
膜蛋白數據庫英語Membranome315
Close

天冬氨酸內肽酶EC 3.4.23已經表徵了脊椎動物真菌逆轉錄酶病毒的起源。[1]

真核天冬氨酸蛋白酶包括胃蛋白酶組織蛋白酶腎素。它們具有由祖先複製而產生的兩域結構。逆轉錄病毒和反轉錄轉座子蛋白酶(逆轉錄病毒天冬氨酰蛋白酶)比較小,並且似乎與真核天冬氨酰蛋白酶的單個結構域同源。每個結構域都提供一個催化天冬氨酸殘基,在分子的兩個葉之間有一個擴展的活性位點裂隙。很久以前,一個葉可能是通過基因複製從另一個進化而來的。在現代酶中,雖然三維結構非常相似,但除了保守的催化位點基序外,氨基酸序列的差異很大。二硫鍵的存在和位置是天冬氨酸肽酶的其他保守特徵。

催化機制

Thumb
提出的天冬氨酰蛋白酶切割肽的機制。

天冬氨酰蛋白酶是一個高度特異性的蛋白酶家族,它們傾向於切割具有疏水殘基和β-亞甲基二肽鍵。與絲氨酸蛋白酶半胱氨酸蛋白酶不同,這些蛋白酶在切割過程中不形成共價中間體。因此,蛋白水解是一步發生的。

儘管已經提出了許多不同的天冬氨酰蛋白酶機制,但最廣泛接受的是酸鹼機制,其原理是涉及水分子在兩個高度保守的天冬氨酸殘基之間的配位。天冬氨酸通過提取質子來活化水,使水能夠對底物易裂鍵的羰基碳進行親核攻擊,從而產生通過與第二天冬氨酸氫鍵穩定的四面體氧陰離子中間體。該中間體的重排導致易裂酰胺質子化,這導致底物肽分裂成兩個產物肽。

抑制

胃酶抑素是天冬氨酸蛋白酶的抑制劑。

分類

已知有五個天冬氨酸蛋白酶超家族(氏族),每個都代表相同活性位點和機制的獨立進化。每個超家族包含幾個具有相似序列的家族MEROPS分類系統按字母順序命名這些氏族。

  • 氏族AA(例如:胃蛋白酶家族)
  • 氏族AC(例如:信號肽酶II家族)
  • 氏族AD(例如:早老素家族)
  • 氏族AE(例如:GPR內肽酶家族)
  • 氏族AF(例如:Omptin家族)

前肽

Quick Facts A1_前肽, 鑑定 ...
A1_前肽
Thumb
解像度為 1.62 埃的人前胃素的晶體和分子結構
鑑定
標誌A1_Propeptide
PfamPF07966舊版
InterPro英語InterProIPR012848
Close

許多真核天冬氨酸內肽酶(MEROPS肽酶家族A1)是用信號肽前肽合成的。動物胃蛋白酶樣內肽酶前肽形成了一個獨特的前肽家族,其中包含約30個殘基長的保守基序。在胃蛋白酶原A中,成熟胃蛋白酶序列的前11個殘基被前肽的殘基取代。前肽含有兩個螺旋,可阻斷活性位點裂隙,特別是胃蛋白酶中保守的天冬氨酸11殘基,在胃蛋白酶中,氫鍵與前肽中的保守Arg殘基結合。這種氫鍵穩定了前肽構象,並且可能負責在酸性條件下觸發胃蛋白酶原轉化為胃蛋白酶。

例子

人類

含有該結構域的人類蛋白質

BACE1BACE2組織蛋白酶D組織蛋白酶ENAPSAPGA5;PGC;腎素

其他生物

參考

Wikiwand in your browser!

Seamless Wikipedia browsing. On steroids.

Every time you click a link to Wikipedia, Wiktionary or Wikiquote in your browser's search results, it will show the modern Wikiwand interface.

Wikiwand extension is a five stars, simple, with minimum permission required to keep your browsing private, safe and transparent.