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鼠海豚科（學名：Phocoenidae）是齒鯨的一個演化支，與獨角鯨科為姊妹群，現存約 3 屬 7 種，外形類似海豚但體型較小且吻部不突出。
鼠海豚科 Phocoenidae
- †原鼠海豚屬 Archaeophocaena
- †南方鼠海豚屬 Australithax
- †Brabocetus
- †羽幌鼠海豚屬 Haborophocoena
- †洛馬鼠海豚屬 Lomacetus
- †中新鼠海豚屬 Miophocaena
- †沼津鼠海豚屬 Numataphocoena
- †皮斯科鼠海豚屬 Piscolithax
- †翼鼠海豚屬 Pterophocaena
- †沙利曼鼠海豚屬 Salumiphocaena
- †半喙鼠海豚屬 Semirostrum
- †玫巧豚屬 Septemtriocetus
- 露脊鼠海豚屬 Neophocaena
- 白腰鼠海豚屬 Phocoenoides
- 白腰鼠海豚 P. dalli
- 鼠海豚屬 Phocoena
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