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生藥學（Pharmacognosy）指以生藥為主要研究對象，對生藥的名稱、來源（基原）、生產（栽培）、採制（採集、加工、炮製）、鑑定（真偽鑑別和品質評價）、化學成分、醫療用途、組織培養、資源開發與利用和新藥創製等的學問。換句話說，生藥學是利用本草學、植物學、動物學、化學、藥理學、醫學、分子生物學等知識研究天然藥物應用的學科。
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在十九世紀初葉以前，世界上的藥物皆取自自然界的三大自然物——動物、植物與礦物。德國學者卡爾·馮·馬修斯提出了「生藥學」的概念。他認為生藥學是商品學的一部分，是研究從自然界所得到的藥物的來源和品質，試驗其純度，檢查其混雜物或偽品的學問。隨着許多化合物被從植物中分離出純品，藥物的生理作用研究也逐漸深入，進入20世紀後，藥物作用強度的生物測定方法也逐步成熟。1960年以後現代儀器分析技術迅速發展，並很快在生藥鑑定中應用。
生藥學在中國起源於本草學，本草學得名於中國漢代某不知名作者假託上古神農氏之名所做的本草學專著《神農本草經》。《神農本草經》共錄有藥物365種是中國最早的生藥學著作；南北朝的梁醫學家陶弘景總結整理了四卷本《神農本草》著三卷本《神農本草經》並著錄《神農本草經集注》七卷，《集注》包括了各類藥物700餘種。公元659年蘇敬等人著錄《新修本草》20卷，並附圖經7卷，藥圖25卷《新修本草》因其官方性質而成為世界上第一部藥典，《新修本草》亦稱《唐本草》是中國本草學發展的一個里程碑；中國明代著名的醫學家和藥學家李時珍著錄中國本草學中最重要的一部專著《本草綱目》52卷，共錄有藥物1892種，《本草綱目》是中國本草學的集大成者，標誌着中國本草學的發展走向頂峰。
近代生藥學經由日本取經於德國，後經中國學者趙燏黃於1905年留學日本，回國時帶回「生藥學」一詞，並開啟了對中國傳統醫學對所使用的生藥等的現代化研究。
生藥學的研究範疇包含了對世界各國所使用傳統醫學的藥物及民間藥等所進行的研究，而中藥學主要是中國政府為弘揚中國傳統醫學理論所使用的藥物研究近代所提出的稱謂，如同世界衛生組織（WHO）對傳統醫學中的印度醫學及阿拉伯醫學所進行的生藥學研究一般，「中藥學」、「印藥學」、「阿藥學」基本上都屬於生藥學研究的分支。
為使療效確實與發現天然藥物對現代疾病的新應用，生藥學研究在今日顯得更為重要。且生藥學研究因涉及之範圍廣泛，而在研究時更有其一定程序與傳承：即首先要進行歷代諸家本草之本草考察 (包括名稱之考訂，歷代本草文獻中所傳承，每一生藥之性狀、藥效及產地之考察)，其次要進行者為市場品之收集(包括同名異物及市場品來自何地之產地調查)。接着進行生藥學研究以確定市場品之基原（植物性生藥、動物性生藥、必須確定其基原植物和基原動物，礦物性生藥要確定其成分及防範異物之摻入，如石膏中鉛之含量需在20PPM以下），並將市場品就其性狀、臭、味、顯微鏡下之化學反應及構造、粉末及內含物特徵予於繪圖加以記載，以制訂真偽品之鑑別規格，便於品質管制。提交生藥化學家研究其有效成分並決定其構造式，如此一面可提供生藥藥理學家進行具備生理活性成分之篩檢並朝新藥開發之路發展，另一面更可解明該生藥之全部療效及毒性。確定臨床及其他醫療用途並掌握優質生藥後，則可朝生產方向發展，或利用生物科技中組織培養之技術栽培，同時在GMP生產過程中重視重金屬與農藥殘留問題，另一面將優質生藥按照中外漢方成方典籍（如日本厚生省頒佈之二百一十處方）之成方比例在講究溶劑及賦形劑之下製成各種生藥濃縮製劑或其他劑形（如小柴胡湯、葛根湯……）等以提供生藥應用之專家使用。
換言之，生藥學是研究一系列生藥的嚴謹科學。從神農本草經以降之歷代諸家本草中所收載的生藥若非有新增品，便有新療效的發明，這與美國生藥學家H.W.Youngken(1951)說過的名言"The Pharmacognosy is as old and modern as the civilization"意即「生藥學與文明同新舊」不謀而合。這名言足可解釋神農本草經(AD22~250)乃後漢時代文明的代表也是神農本草經時代的生藥學水準，而本草綱目也代表着明萬曆時代的生藥學水準；這也意味着「不分中外的藥學演進史都是生藥學的發展史」，各種族理論論述之天然藥物皆應稱為生藥，而生藥之應用乃與全人類文明之歷史同新舊。
當吾人通過古今中外本草典籍所記載之生藥及其應用並結合現代科學的研究成果時，便能使古老「方、證」與現代醫學「病」的觀點溝通，當融合「方、證、病」三者時即能從容應對新時代中新疾病的挑戰。
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生藥鑑定就是依據國家藥典、有關資料規定或有關專著對生藥作真實性、純度及品質優良度的檢定，以保證生藥品種的真實性、用藥的安全有效及發掘利用新藥源。主要方法有原植物鑑定、性狀特徵、顯微鑑別、理化鑑定等。
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