被囊動物亞門

被囊動物亞門（學名：Tunicata），舊稱尾索動物亞門（Urochordata^[1][2]），是脊索動物門的一個亞門，全部是海洋動物。被囊動物的脊索和背神經管僅存於幼體尾部，成體退化消失，身體表面披有一層棕褐色植物性纖維質的囊包，裏面再有一層外套膜包裹。常見種類有各種海鞘和住囊蟲，營自由生活或固着生活，有些種類有世代交替現象。

被囊動物亞門 化石時期：520–0 Ma PreЄ Є O S D C P T J K Pg N
海鞘（Pyura spinifera）
科學分類
界：	動物界 Animalia
門：	脊索動物門 Chordata
演化支：	嗅球類 Olfactores
亞門：	被囊動物亞門 Tunicata
綱
見內文

分類

被囊動物與有頭類（包括盲鰻、七鰓鰻和有下頜的脊椎動物）的相關，比較與諸如文昌魚、棘皮動物、半索動物（hemichordates）、異渦蟲（Xenoturbella）或其他無脊椎動物的相關更密切^[3][4][5]。由於其結構相對簡單，被囊動物曾被認為是脊索動物的早期分支，但近年以分子支序親緣學分析基因組數據，較多研究支持頭索動物才是脊索動物的早期分支，而被囊動物則是脊椎動物的姊妹群。

包括有被囊動物亞門和脊索動物的支序叫做嗅球類（Olfactores）支序^[6][7]。

被囊動物亞門包括約莫三千個已描述的物種^[8]，傳統上分成下列三個綱：

• 海鞘綱（Ascidiacea ：Aplousobranchia、Phlebobranchia及Stolidobranchia）
• 樽海鞘綱（Thaliacea：Pyrosomida、Doliolida及Salpida）
• 尾海鞘綱（Appendicularia：Larvacea）

在2011年，一項有關濾食性海鞘及捕食性海鞘的分子支序親緣學研究將這些海鞘物種的rDNA進行排序，確認這些物種間的關係，原深水海鞘綱（Sorberacea）的成員都被併入到海鞘綱^[9]的Molgulidae（英語：Molgulidae）科中^[10][11]。儘管傳統的分類仍然接受，較新的證據認為海鞘綱其實仍然是一個由並系群組成的人造群組^[12][13]。

以下分支圖基於 Delsuc 及其同事 2018 年的系統基因組學研究^[14]

被囊動物亞門	尾海鞘綱       樽海鞘綱   海樽目     紐鰓樽目         扃鰓目     無管海鞘目          復腮目   皮海鞘科       柄海鞘科      腕海鞘科       海鞘綱

化石物種

有關本分類的化石物種從屬一直以來都有爭議：一來這些化石的年代非常久遠，難以保存；二來化石物種沒有現生種可透過分子生物學手段來分析，並藉以釐清當中爭議。

• 山口海鞘綱（Shankouclava†）：只有化石種的一個綱，得名與中國雲南省昆明市澂江縣山口村的寒武紀早期澄江動物群（日語：澄江動物群）帽天山頁岩地層^[15]。
• Yarnemia（英語：Yarnemia）?

參考文獻

1. Brusca, R. C.; Brusca, G. J. Invertebrates 2nd Ed. Sunderland, MA (USA): Sinauer. 2002 （英語）. 引文格式1維護：冗餘文本 (link)
2. Introduction to the Urochordata. [2017-10-27]. （原始內容存檔於2009-04-21） （英語）.
3. Delsuc, F.; Brinkmann, H.; Chourrout, D.; Philippe, H. Tunicates and not cephalochordates are the closest living relatives of vertebrates. Nature. 2006, 439 (7079): 965–968. PMID 16495997. doi:10.1038/nature04336.
4. Delsuc, F.; Tsagkogeorga, G.; Lartillot, N.; Philippe, H. Additional molecular support for the new chordate phylogeny. Genesis. 2008, 46 (11): 592–604. PMID 19003928. doi:10.1002/dvg.20450.
5. Singh, T. R.; Tsagkogeorga, G.; Delsuc, F.; Blanquart, S.; Shenkar, N.; Loya, Y.; Douzery, E. J.; Huchon, D. Tunicate mitogenomics and phylogenetics: peculiarities of the Herdmania momus mitochondrial genome and support for the new chordate phylogeny. BMC Genomics. 2009, 10: 534. PMC 2785839 . PMID 19922605. doi:10.1186/1471-2164-10-534.
6. Jefferies, R. P. S. (1991) in Biological Asymmetry and Handedness (eds Bock, G. R.; Marsh, J.) pp. 94-127 (Wiley, Chichester).
7. 本頓, MJ. 古脊椎動物學 第四版. 科學出版社. 2017-05. ISBN 9787030524935 （中文（簡體））. 使用|accessdate=需要含有|url= (幫助)
8. Ruppert, Edward E.; Fox, Richard, S.; Barnes, Robert D. Invertebrate Zoology 7th edition. Cengage Learning. 2004: 940–956. ISBN 81-315-0104-3 （英語）. 引文格式1維護：冗餘文本 (link)
9. Tatián, Marcos; Lagger, Cristian; Demarchi, Milagros; Mattoni, Camilo. Molecular phylogeny endorses the relationship between carnivorous and filter-feeding tunicates (Tunicata, Ascidiacea). Zoologica Scripta. 2011, 40 (6): 603–612. doi:10.1111/j.1463-6409.2011.00493.x.
10. Sanamyan, Karen. Database of extant Ascidiacea. 2007-11-02. 引文格式1維護：日期與年 (link)
11. Molgulidae Lacaze-Duthiers, 1877. WoRMS. 2016-02-17 [2017-10-27] –透過WoRMS.
12. Zeng, L.; Swalla, B. J. Molecular phylogeny of the protochordates: chordate evolution. Can. J. Zool. 2005, 83: 24–33. doi:10.1139/z05-010.
13. Tsagkogeorga, G.; Turon, X.; Hopcroft, R. R.; Tilak, M. K.; Feldstein, T.; Shenkar, N.; Loya, Y.; Huchon, D.; Douzery, E. J.; Delsuc, F. An updated 18S rRNA phylogeny of tunicates based on mixture and secondary structure models. BMC Evolutionary Biology. 2009, 9: 187. PMC 2739199 . PMID 19656395. doi:10.1186/1471-2148-9-187.
14. ^ 引用錯誤：沒有為名為Delsuc2018的參考文獻提供內容
15. Chen, Jun-Yuan; Huang, Di-Ying; Peng, Qing-Qing; Chi, Hui-Mei; Wang, Xiu-Qiang; Feng, Man. Michael S. Levine , 編. The first tunicate from the Early Cambrian of South China. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS): 8314–8318. [2017-10-27]. doi:10.1073/pnas.1431177100. （原始內容存檔於2019-06-12） （英語）.