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小抹香鯨科（學名：Kogiidae），是哺乳綱鯨偶蹄目的一科，也有資料將其視為抹香鯨科（Physeteridae）的一個亞科－小抹香鯨亞科（學名：Kogiinae），僅包含1個現生屬：小抹香鯨屬（Kogia）。
鯨偶蹄目 Cetartiodactyla
- 鯨下目 Cetacea
- 齒鯨小目 Odontoceti
- 抹香鯨總科 Physeteroidea
- 小抹香鯨科 Kogiidae
- 小抹香鯨屬 Kogia[1]
- 阿普里斯小抹香鯨屬 Aprixokogia †[1]
- 克氏阿普里斯小抹香鯨 Aprixokogia kelloggi
- 似小抹香鯨屬 Kogiopsis†[2]
- 佛州似小抹香鯨 Kogiopsis floridana
- 冠小抹香鯨屬 Koristocetus†
- 佩氏冠小抹香鯨 Koristocetus pescei†[3]
- 倭小抹香鯨屬 Nanokogia†[1]
- 地峽倭小抹香鯨 Nanokogia isthmia
- 上新小抹香鯨屬 Pliokogia †[4]
- 亞平寧上新小抹香鯨 Pliokogia apenninica
- 柏加小抹香鯨屬 Praekogia†[1]
- 雪松柏加小抹香鯨 Praekogia cedrosensis
- 舟小抹香鯨屬 Scaphokogia†[1]
- 蝸狀舟小抹香鯨 Scaphokogia cochlearis
- 洋抹香鯨屬 Thalassocetus†[1]
- 安衛普塔洋抹香鯨 Thalassocetus antwerpiensis
- 小抹香鯨科 Kogiidae
- 抹香鯨總科 Physeteroidea
- 齒鯨小目 Odontoceti
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