本頁面列出了病毒 的分類 ,包含病毒 以及類病毒 、普利昂蛋白 、衛星病毒 等亞病毒因子 。
由於病毒並不像其他生物能藉由交配產生後代,因此在種別的定義上與一般生物有所不同。
國際病毒分類委員會 (英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,簡稱 ICTV)是國際微生物學聯合會 (英文:International Union of microgical Societies)發展、改進和維護通用病毒分類的唯一機構,在1966年建立起了一個病毒分類的通用系統和統一的命名法則。第七屆 ICTV 會議首次規範化了病毒物種 的概念,即病毒分類的分支層次中的最低分類單元 [ 1] 。分類的主要依據是病毒顆粒的特性、抗原特性與生物特性。
到目前為止只有一小部分的病毒得到了研究,從來自人體的病毒樣品中發現有20%的序列是未曾發現過的,而來自環境中(如海水、大洋沉積物等)的病毒樣品則大部分的序列都是全新的[ 2] 。
病毒分類從域開始,結構如下,分類後綴在括號中:[ 3]
域 Realm(-viria )
亞域 Subrealm(-vira )
界 Kingdom(-viriae )
亞界 Subkingdom(-virites )
門 Phylum(-viricota )
亞門 Subphylum(-viricotina )
綱 Class(-viricetes )
亞綱 Subclass(-viricetidae )
目 Order(-virales )
亞目 Suborder(-virineae )
科 Family(-viridae )
亞科 Subfamily(-virinae )
屬 Genus(-virus )
亞屬 Subgenus(-virus )
種 Species
物種名稱通常以[疾病]病毒的形式出現,尤其是高等動植物。
ICTV 2023版分類表中總共有6個域、10個界、18個門、2個亞門、41個綱、81個目、11個亞目、314個科、200個亞科、3522個屬、84個亞屬與14690個種。除亞域、亞界和亞綱外,其他級別的分類單元都被使用。共有6個域、1個地位未定綱、22個地位未定科及2個地位未定屬被承認[ 4] 。
巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的合成方式
諾貝爾獎獲得者生物學家戴維·巴爾的摩 在1970年代提出了巴爾的摩分類系統[ 5] 。巴爾的摩分類法與ICTV分類法一起用於現代病毒的分類[ 6] [ 7] [ 8] 。
巴爾的摩分類法是基於病毒 mRNA 的生成機制。在從病毒基因組到蛋白質的過程中,必須要生成mRNA來完成蛋白質合成和基因組的複製,但每一個病毒家族都採用不同的機制來完成這一過程。病毒基因組可以是單鏈或雙鏈的 RNA 或 DNA ,可以有也可以沒有反轉錄酶 。而且,單鏈RNA病毒可以是正義 (+)或反義(-)。這一分類法將病毒分為7類:
舉一個病毒分類的例子:水痘 病毒,即帶狀疱疹病毒 ,屬於疱疹病毒目 ,疱疹病毒科 ,甲型疱疹病毒亞科 ,水疱病毒屬 ;同時,帶狀疱疹病毒是巴爾的摩分類法中的第一類,因為它是雙鏈 DNA 病毒,且不含有反轉錄酶。
此套分類系統與細胞生物 分類系統有許多共同特徵,如分類單元 結構,但也存在一些差異,比如所有分類名稱都使用斜體,這與國際藻類、真菌和植物命名法 及國際動物命名法 不同。
齊利希病毒界 Zilligvirae 1門
杆狀病毒門 Taleaviricota 1綱
線狀病毒綱 Tokiviricetes 3目
細帶病毒目 Ligamenvirales 2科
墨洗門病毒目 Maximonvirales
第一病毒目 Primavirales 1科
香港病毒界 Heunggongvirae 2門
衣殼病毒門 Peploviricota 1綱
疱疹病毒綱 Herviviricetes 1目
皰疹病毒目 Herpesvirales 4科
異疱疹病毒科 Alloherpesviridae
疱疹病毒科 Herpesviridae 3亞科
軟體動物疱疹病毒科 Malacoherpesviridae
正疱疹病毒科 Orthoherpesviridae
尾噬菌體門 Uroviricota 1綱
有尾噬菌體綱 Caudoviricetes 1目
有尾噬菌體目 Caudovirales
crAss噬菌體目 Crassvirales
腸道噬菌體科 Crevaviridae
腸子噬菌體科 Intestiviridae
腸管噬菌體科 Steigviridae
腸噬菌體科 Suoliviridae
海港噬菌體目 Juravirales
鹽港噬菌體科 Yangangviridae
鹽滷卡噬菌體科 Yanlukaviridae
千面噬菌體目 Kirjokansivirales
變殖噬菌體科 Graaviviridae
泛鹽噬菌體科 Haloferuviridae
魚尾噬菌體科 Pyrstoviridae
短尾鹽噬菌體科 Shortaselviridae
海洋組噬菌體目 Magrovirales
甲烷杆噬菌體目 Methanobavirales
厭氧噬菌體科 Anaerodiviridae
具刺噬菌體科 Armatusviridae
開羅噬菌體科 Kairosviridae
萊氏噬菌體科 Leisingerviridae
科 Pigerviridae
納孔噬菌體目 Nakonvirales
阿·普切噬菌體科 Ahpuchviridae
艾克·曲瓦噬菌體科 Ekchuahviridae
蘇雷瑪噬菌體目 Thumleimavirales
鹽噬菌體科 Druskaviridae
富鹽噬菌體科 Hafunaviridae
嗜鹽大噬菌體科 Halomagnusviridae
鹽場噬菌體科 Soleiviridae
埃凱曼病毒科 Ackermannviridae
集聚噬菌體科 Aggregaviridae
艾莉絲·埃文斯噬菌體科 Aliceevansviridae
阿倫伯格噬菌體科 Arenbergviridae
規範噬菌體科 Assiduviridae
自複製短尾噬菌體科 Autographiviridae
卡斯金斯噬菌體科 Casjensviridae
蔡斯噬菌體科 Chaseviridae
科 Chimalliviridae
科 Clermontviridae
德默萊茲噬菌體科 Demerecviridae
德雷克斯勒噬菌體科 Drexlerviridae
杜恩噬菌體科 Duneviridae
熱噬菌體科 Fervensviridae
凡賽提噬菌體科 Forsetiviridae
弗雷德·法斯蒂爾噬菌體科 Fredfastierviridae
格里蒙噬菌體科 Grimontviridae
格蘭噬菌體科 Guelinviridae
赫爾戈蘭噬菌體科 Helgolandviridae
赫萊爾噬菌體科 Herelleviridae
克列茲考斯卡噬菌體科 Kleczkowskaviridae
科 Konodaiviridae
藍綠噬藻體科 Kyanoviridae
科 Lutetiaviridae
瑪薩噬菌體科 Madisaviridae
馬德里噬菌體科 Madridviridae
梅西揚日諾夫噬菌體科 Mesyanzhinovviridae
莫利可噬菌體科 Molycolviridae
友好噬菌體科 Naomviridae
奧拉-詹森噬菌體科 Orlajensenviridae
厚噬菌體科 Pachyviridae
P2噬菌體科 Peduoviridae
漫遊噬菌體科 Pervagoviridae
普切斯噬菌體科 Pootjesviridae
刺噬菌體科 Pungoviridae
朗特里噬菌體科 Rountreeviridae
薩弗曼噬菌體科 Saffermanviridae
薩拉瑪噬菌體科 Salasmaviridae
豬尾噬菌體科 Saparoviridae
斯基托噬菌體科 Schitoviridae
希望噬菌體科 Speroviridae
斯坦·威廉噬菌體科 Stanwilliamsviridae
斯特拉波噬菌體科 Straboviridae
鹽菌噬菌體科 Suolaviridae
富山噬菌體科 Toyamaviridae
梅園噬菌體科 Umezonoviridae
維爾丹尼噬菌體科 Verdandiviridae
翻轉噬菌體科 Vertoviridae
VLM群噬菌體科 Vilmaviridae
維諾噬菌體科 Winoviridae
科 Zierdtviridae
佐貝爾噬菌體科 Zobellviridae
包含4界
洛布病毒界 Loebvirae 1門
桑格病毒界 Sangervirae 1門
稱徳病毒界 Shotokuvirae 2門
科薩特病毒門 Cossaviricota 3綱
單環編碼病毒門 Cressdnaviricota 2綱:編碼複製相關蛋白的環狀單鏈 DNA 病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses,CRESS DNA viruses)
精氨酸指針病毒綱 Arfiviricetes 5目
硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
圓環病毒目 Cirlivirales 3科
圓環病毒科 Circoviridae
內蜒病毒科 Endolinaviridae
維雅病毒科 Vilyaviridae
CRESS亞基因組目 Cremevirales 1科
連環病毒目 Gredzevirales
長蛇病毒科 Gandrviridae
銜尾病毒科 Ouroboviridae
耶夢病毒目 Jormunvirales
多分體基因病毒目 Mulpavirales 3科
動物CRESS病毒科 Anicreviridae
中介病毒科 Metaxyviridae
矮縮病毒科 Nanoviridae
圓形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
戒環病毒目 Ringavirales
幽谷病毒目 Rivendellvirales
洛汗病毒目 Rohanvirales
白石病毒科 Adamaviridae
異圓環病毒科 Kirkoviridae
能雅病毒科 Nenyaviridae
鎮星病毒目 Saturnivirales
豐茂病毒科 Kanorauviridae
多源病毒科 Mahapunaviridae
Rep 單鏈編碼病毒綱 Repensiviricetes 1目
雙生基因植物真菌病毒目 Geplafuvirales 3科
雙生病毒科 Geminiviridae
類雙生病毒科 Genomoviridae
雙關病毒科 Geplanaviridae
特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1門
嗜鹽病毒門 Saleviricota 1綱
凌亂病毒綱 Huolimaviricetes 1目
包含2界
班福病毒界 Bamfordvirae 2門
核質病毒門 Nucleocytoviricota 2綱
巨病毒綱 Megaviricetes 3目
藻類病毒目 Algavirales 1科
模擬病毒目 Imitervirales
異擬菌病毒科 Allomimiviridae
中擬病毒科 Mesomimiviridae
擬菌病毒科 Mimiviridae
次擬菌病毒亞科 Aliimimivirinae
克堡病毒亞科 Klosneuvirinae
巨大擬菌病毒亞科 Megamimivirinae
分擬菌病毒科 Schizomimiviridae
闊虹馬囊病毒目 Pimascovirales 3科
囊泡病毒科 Ascoviridae
雪松病毒科 Cedratviridae
虹彩病毒科 Iridoviridae 2亞科
馬賽病毒科 Marseilleviridae
變形病毒科 Orpheoviridae
闊口罐病毒科 Pithoviridae
魔物病毒科 Mamonoviridae
痘疹病毒綱 Pokkesviricetes 2目
非浮病毒目 Asfuvirales 1科
束衣病毒目 Chitovirales 1科
質粒前體病毒門 Preplasmiviricota 3綱
單體病毒綱 Ainoaviricetes
獨特病毒綱 Maveriviricetes
多變五鄰體病毒目 Divpevirales
大病毒依賴病毒目 Lavidavirales
擬菌依賴病毒目 Mividavirales
依賴病毒目 Priklausovirales 1科
勃爾頓噬病毒體科 Burtonviroviridae
滴水湖噬病毒體科 Dishuiviroviridae
格列佛噬病毒體科 Gulliviroviridae
彌澤噬病毒體科 Omnilimnoviroviridae
聚整合轉座子病毒綱 Polintoviricetes 1目
正聚整合轉座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
保護病毒綱 Tectiliviricetes
阿特洛波斯病毒目 Atroposvirales
塔鍾病毒目 Belfryvirales 1科
可優帕病毒目]] Coyopavirales
卡拉馬病毒目 Kalamavirales 1科
羅韋病毒目 Rowavirales 1科
比尼亞病毒目 Vinavirales 1科
奧托呂科斯病毒科 Autolykiviridae
雅拉病毒科 Yaraviridae
海爾維蒂病毒界 Helvetiavirae (瑞士病毒)1門
分隔病毒門 Dividoviricota 1綱
萊塞病毒綱 Laserviricetes 1目
西班牙鹽盒菌病毒目 Halopanivirales 3科
松下病毒科 Matshushitaviridae
偽裝病毒科 Simuloviridae
球脂狀病毒科 Sphaerolipoviridae
地位未定綱:
節肢動物核大DNA病毒綱 Naldaviricetes 1目、1科
晚期因子病毒目 Lefavirales 3科
杆狀病毒科 Baculoviridae 4屬
肥大唾腺炎病毒科 Hytrosaviridae (線頭病毒科)2屬
裸杆狀病毒科 Nudiviridae 4屬
線極病毒科 Nimaviridae 1屬
地位未定科:
阿爾法衛星病毒科 Alphasatellitidae 3亞科
瓶狀病毒科 Ampullaviridae 1屬
指環病毒科 Anelloviridae 31屬
鱷梨日斑類病毒科 Avsunviroidae 3屬
巴通體GTA組病毒科 Bartogtaviriformidae
雙尾病毒科 Bicaudaviridae 1屬
短螺旋體GTA組病毒科 Brachygtaviriformidae
棒狀病毒科 Clavaviridae 1屬
微小紡錘形噬菌體科 Fuselloviridae 2屬
球狀病毒科 Globuloviridae 1屬
滴狀病毒科 Guttaviridae 2屬
嗜鹽紡錘形噬菌體科 Halspiviridae 1屬
伊察姆納病毒科 Itzamnaviridae
卵形病毒科 Ovaliviridae 1屬
芽生噬菌體科 Plasmaviridae 1屬
多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2屬
帶球病毒科 Portogloboviridae 1屬
馬鈴薯紡錘形塊莖類病毒科 Pospiviroidae 5屬
紅細菌目GTA組病毒科 Rhodogtaviriformidae
螺旋病毒科 Spiraviridae 1屬
奇古菌紡錘形噬菌體科 Thaspiviridae 1屬
番茄曲葉衛星病毒科 Tolecusatellitidae 2屬
地位未定屬:
溝鞭藻 DNA 病毒屬 Dinodnavirus 1種
壺菌病毒屬 Rhizidiovirus 1種
衛星病毒 Satellite virus
單鏈核糖核酸衛星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
雙鏈 DNA 衛星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
未定屬
Satellite nucleic acid
Single-stranded satellite DNA
Double-stranded satellite RNA
Single-stranded satellite RNA
RNA satellite
未定屬
Pospiviroidae
Pospiviroid
Hostuviroid
Cocadviroid
Apscaviroid
Coleviroid
未定屬
Avsunviroidae
Avsunviroid
Pelamoviroid
Elaviroid
未定科
缺損干擾 RNA Defective Interfering RNA
Defective interfering particle
Fields p. 27
As defined therein, "a virus species is a polythetic class of viruses that constitute a replicating lineage and occupy a particular ecological niche". A「polythetic" class is one whose members have several properties in common, although they do not necessarily all share a single common defining one. Members of a virus species are defined collectively by a consensus group of properties. Virus species thus differ from the higher viral taxa, which are「universal」classes and as such are defined by properties that are necessary for membership.
Baltimore, D. The strategy of RNA viruses. Harvey Lect. . 1974,. 70 Series: 57–74. PMID 4377923 .
van Regenmortel, M.H.; Mahy, B.W. Emerging issues in virus taxonomy. Emerging Infect. Dis. . 2004, 10 (1): 8–13. PMID 15078590 .
Mayo, M.A. Developments in plant virus taxonomy since the publication of the 6th ICTV Report. International Committee on Taxonomy of Viruses. Arch. Virol. . 1999, 144 (8): 1659–1666. PMID 10486120 . doi:10.1007/s007050050620 .