日本寺院列表是日本的佛教寺院之列表。
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以ISO 3166-2:JP訂定之日本都道府縣地圖
1855年日本行政區域
本列表之寺院列出標準為近代以前所成立的佛教各宗派之總本山、大本山級之寺院，且在日本的佛教史、文化史、美術史上佔有重要地位、及擁有國寶級等之重要的文化財，並擁有廣大信仰、與對日本文化上有重大影響之一系列寺院。
本列表以日本都道府縣排列。
- 萬滿寺（千葉縣松戶市）
- 本土寺（千葉縣松戶市）
- 東漸寺（千葉縣松戶市）
- 新勝寺（千葉縣成田市）→ 成田山新勝寺
- 本遠寺（山梨縣南巨摩郡身延町）
- 久遠寺（山梨縣南巨摩郡身延町）
- 放光寺（長野縣松本市）
- 長谷寺（長野縣長野市）
- 善光寺（長野縣長野市）
- 牛伏寺（長野縣松本市）
- 長興寺（愛知縣豐田市）
- 興正寺（尾張高野、名古屋市昭和區）
- 初馬寺（三重縣津市）→ 蓮光院初馬寺
- 專修寺（三重縣津市、栃木縣芳賀郡二宮町）
- 青蓮寺（地藏院、三重縣名張市）
- 金剛證寺（三重縣伊勢市）
- 三井寺（滋賀縣大津市）→ 園城寺
- 寶嚴寺（竹生島、滋賀縣東淺井郡びわ町）
- 百濟寺（滋賀縣東近江市）
- 長命寺（滋賀縣近江八幡市）
- 金剛輪寺（滋賀縣愛知郡秦莊町）
- 延曆寺（滋賀縣大津市）
- 園城寺（三井寺、滋賀縣大津市）
- 石山寺（滋賀縣大津市）
- 永源寺（滋賀縣東近江市）
- 林昌寺（大阪府泉南市）
- 野中寺（大阪府羽曳野市）
- 葛井寺（大阪府藤井寺市）
- 南宗寺（大阪府堺市）
- 道明寺（大阪府藤井寺市）
- 長慶寺（大阪府泉南市）
- 太融寺（大阪市北區）
- 大聖觀音寺（大阪市住吉區）
- 大聖勝軍寺（大阪府八尾市）
- 大念佛寺（大阪市平野區）
- 施福寺（大阪府和泉市）
- 四天王寺（大阪市）
- 西琳寺（大阪府羽曳野市）
- 孝恩寺（大阪府貝塚市）
- 觀心寺（大阪府河內長野市）
- 勝尾寺（大阪府箕面市）
- 西江寺（大阪府箕面市）
- 叡福寺（大阪府南河內郡太子町）
- 本興寺（兵庫縣尼崎市）
- 斑鳩寺（兵庫縣揖保郡太子町）
- 中山寺（兵庫縣寶塚市）
- 如意寺（兵庫縣神戶市西區）
- 能福寺（兵庫縣神戶市兵庫區）
- 朝光寺（兵庫縣加東郡社町）
- 大龍寺（兵庫縣神戶市中央區）
- 太山寺（兵庫縣神戶市西區）
- 須磨寺（福祥寺、兵庫縣神戶市須磨區）
- 淨土寺（兵庫縣小野市）
- 清荒神清澄寺（兵庫縣寶塚市）
- 清水寺（兵庫縣加東郡社町）
- 神呪寺（兵庫縣西宮市）
- 伽耶院（兵庫縣三木市）
- 鶴林寺（兵庫縣加古川市）
- 溫泉寺（兵庫縣豐岡市）
- 圓教寺（兵庫縣姫路市）
- 一乘寺（兵庫縣加西市）
- 大安寺（奈良縣奈良市）
- 靈山寺（奈良市）
- 藥師寺（奈良縣奈良市）
- 室生寺（奈良縣宇陀郡室生村）
- 南法華寺（壺阪寺、奈良縣高市郡高取町）
- 寶山寺（奈良縣生駒市）
- 法隆寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
- 法輪寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
- 法華寺（奈良縣奈良市）
- 法起寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
- 不退寺（奈良縣奈良市）
- 長谷寺（奈良縣櫻井市）
- 唐招提寺（奈良縣奈良市）
- 東大寺（正倉院）（奈良縣奈良市）
- 中宮寺（奈良縣生駒郡斑鳩町）
- 當麻寺（奈良縣葛城市）
- 橘寺（奈良縣高市郡明日香村）
- 新藥師寺（奈良縣奈良市）
- 西大寺（奈良市）
- 興福寺（奈良縣奈良市）
- 元興寺（奈良縣奈良市）
- 岡寺（奈良縣高市郡明日香村）→龍蓋寺
- 帶解寺（奈良縣奈良市）
- 秋篠寺（奈良縣奈良市）
- 飛鳥寺（安居院、奈良縣高市郡明日香村）
- 大峰山寺（奈良県吉野郡天川村）
- 大峯山龍泉寺（奈良県吉野郡天川村）
- 補陀洛山寺（和歌山縣東牟婁郡那智勝浦町）
- 根來寺（和歌山縣岩出市）
- 道成寺（和歌山縣日高郡日高川町）
- 長保寺（和歌山縣海南市）
- 善福院（和歌山縣海南市）
- 青岸渡寺（和歌山縣東牟婁郡那智勝浦町）
- 淨妙寺（和歌山縣有田市）
- 金剛三昧院（和歌山縣伊都郡高野町）
- 金剛峰寺（和歌山縣伊都郡高野町）
- 粉河寺（和歌山縣那賀郡粉河町）
- 紀三井寺（和歌山縣和歌山市）
- 明王院（廣島縣福山市）
- 福禪寺（對潮樓、廣島縣福山市）
- 承天寺（福岡縣福岡市）
- 觀世音寺（福岡縣太宰府市）
