Rosetta@home
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Rosetta@home是一個基於伯克利開放式網絡計算平台(BOINC)的分布式計算項目,由華盛頓大學貝克實驗室(英語:David Baker (biochemist))開發和維護,用於蛋白質結構預測、蛋白質-蛋白質對接和新的蛋白質設計(英語:Protein design)的研究。截至2015年2月12日,全球共有5萬多台計算機是這一項目的活躍志願者,平均每秒浮點運算次數達87萬億(87.688 teraFLOPS)。[2]Rosetta@Home還開發了一款電子遊戲Foldit,目的是通過眾包途徑來實現上述研究目標。儘管這個項目很大程度上側重於進行提高蛋白質組學方法的精確性和穩固性的基礎研究,它也進行一些關於艾滋病、瘧疾、癌症、阿茲海默病以及其他疾病的病理學的應用研究。[3]
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原作者 | 大衛·貝克(英語:David Baker (biochemist))團隊 |
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開發 | 華盛頓大學貝克實驗室 |
最初發布時間 | 2005年10月6日(18年前)(2005-10-06) |
開發狀態 | 活躍 |
項目目標 | 蛋白質結構預測 蛋白質設計(英語:Protein design) |
操作系統 | Microsoft Windows 麥金塔操作系統 Linux Android |
平台 | BOINC |
使用語言 | 英語 |
許可 | 學術使用和非營利使用免費 商業使用須簽署商業協議[1] |
截止時間 | 2023-04-02 |
平均表現 | 225,041吉 |
活躍用戶數 | 36,726 |
總用戶數 | 1,363,584 |
活躍主機數 | 249,673 |
總主機數 | 529,112 |
網址 | boinc![]() |
與其他BOINC項目一樣,Rosetta@home使用志願者的計算機中空閒的進程資源來執行單獨的單元計算。計算結果會被發送到項目的中央服務器,經驗證後存入數據庫中。這個項目是跨平台的,支持多種不同的軟件和計算機硬件環境。用戶可通過Rosetta@home的屏幕保護程序觀看正在自己計算機上進行的蛋白質結構預測的情況。
除了疾病相關研究,Rosetta@home網絡還是結構生物信息學中新方法的一個測試框架。這些新方法經Rosetta@home龐大且多樣的用戶群體使用後,若運行效果穩定,將會被用於其他基於Rosetta的應用程序,例如RosettaDock和人類蛋白質組摺疊項目(英語:Human Proteome Folding Project)(HPF)。新方法測試中的兩個重要項目是蛋白質結構預測技術的關鍵測試(CASP)和交互作用預測的關鍵測試(英語:Critical Assessment of Prediction of Interactions)(CAPRI)。這兩項測試實驗分別用於評估蛋白質結構預測和蛋白質-蛋白質對接預測的最前沿技術。Rosetta@home穩居最重要的對接預測器之一,並且是現有最好的蛋白質三級結構預測器之一。[4]