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De-Bruijn Graph
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Velvet拼接软件
Velvet是处理从头测序(
de
novo)基因组组装及短读长序列比對的一个算法包。这是使用德布鲁因图(英语:
de
Bruijn
graph
)通过消除错误和化简重复区域而来进行基因组序列组装。 Geneious、MacVector(英语:MacVector)、BioNumerics(英语:BioNu
序列組裝
De
-
Bruijn
(英语:
De
-
Bruijn
graph
)(DBG)法:此方法使用數學圖論中
De
-
Bruijn
圖(英语:
De
-
Bruijn
Graph
)的概念,先將每個測序片段拆解成k-mer(英语:k-mer)(一個字串中所有長度為k的可能字串子集合)。接著從這些k-mer重疊的區段建構出
De
图论
中关于具有某一特定性质的图的计数问题。除凯莱的成果外,波利亚也于1935至1937年发表了一些成果,1959年,
De
Bruijn
(英语:Nicolaas Govert
de
Bruijn
)做了一些推广。这些研究成果奠定了图的计数理论的基础。凯莱将他关于树的研究成果与当时有关化合物的研究联系起来,而
哈德維格-納爾遜問題
三維空間:上界15,下界6 限制某種顏色的集的性質。例如要求每種顏色的集都是勒贝格可测的,則下界為5。 四色定理
de
Bruijn
, N.G.; Erdős, P. (1951). "A colour problem for infinite graphs and a problem
狄尔沃斯定理
个颜色类都必须是一条链。假设P的宽度为w ,并且根据迪尔沃斯定理的有限版本, P的每个有限子集S都有一个可使用w色着色的不可比图。因此,根据
De
Bruijn
-Erdős 定理, P本身也有可使用w色着色的不可比图,从而具有所需的链划分(Harzheim 2005) 。