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疏水效应(英语:Hydrophobic effect)又称疏水性效应,属于非极性分子的一种性质,会使这些分子在水溶液中具有自我聚集(self-associate)的特性。例如油在水中会呈现与水分离的现象。
此外这种现象对于蛋白质的型态、不同蛋白质之间的交互作用,以及核酸结构等生化分子也有所影响。例如某些拥有疏水核心(hydrophobic core)的蛋白质,会以疏水轴为中心形成卷曲螺旋(coiled-coil)结构。在水中蛋白质折叠时总是倾向于将疏水基团埋藏在分子内部,将亲水基团暴露在外部的现象。蛋白质溶液系统熵值的增加是疏水作用的主要动力,因此,疏水作用又被称作熵效应。
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