活化石，是指任何生物其类似种只存在于化石中，而没有其他现存的近似种。这些种类曾经从主要的灭绝事件中存活下来。一般先发现化石再发现活体，或活体与确认的化石属同一种且同时存在。物种起源久远，在新生代第三纪或更早有广泛的分布，而目前大部分物种已经因地质、气候的改变而灭绝，有些现存植物的形状和在化石中发现的植物基本相同，保留了其远古祖先的原始形状。且其近缘类群多数已灭绝，比较孤立，演化缓慢的植物便可称为孑遗植物或活化石，并不是单从植物年龄而决定。[1][2]
腔棘鱼原本被认为已经于6500万年前完全灭绝，直到1938年在南非发现非洲矛尾鱼（Latimeria chalumnae）后，这个想法才被打破，此外其“活化石”基因也成为研究陆生动物演化的重要对象。
银杏不但已经存在了很长的时期, 也有很长的寿命，有些已超过2,500年。有6个标本甚至已知在广岛原子弹爆炸的原爆点1-2公里处生存下来；它们今天仍然生活在那里。
- 无油樟（Amborella trichopoda）
- 智利南洋杉（Araucaria araucana）
- 苏铁属（Cycas）
- 银杏（Ginkgo biloba）
- 木贼属（Equisetum）
- 水杉（Metasequoia glyptostroboides）
- 加州红木（Sequoia sempervirens）
- 巨杉（Sequoiadendron giganteum）
- 水松（Glyptostrobus pensilis）
- 松叶蕨（Psilotum）
- 百岁兰（Welwitschia mirabilis）
- 瓦勒迈杉（Wollemia nobilis）
- 日本金松（Sciadopitys）
- 水韭属（Isoetes）
- 珙桐（Davidia involucrata）
- 台湾杉（Taiwania cryptomerioides）
- 桫椤（Cyathea spinulosa）
- 土豚（Orycteropus afer）
- 塞浦路斯鼠（Mus cypriacus）
- 大熊猫（Ailuropoda melanoleuca）[3]
- 小熊猫（Ailurus fulgens）
- 霍加狓（Okapia johnstoni）
- 无尾熊（Phascolarctos cinereus）
- 袋熊（Vombatidae）
- 负鼠（Didelphimorphia）
- 寮国岩鼠（Laonastes aenigmamus）
- 火山兔（Romerolagus diazi）
- 琉球兔（Pentalagus furnessi）
- 西表山猫（Prionailurus iriomotensis）
- 南猊 （Dromiciops gliroides）
- 山河狸（Aplodontia rufa）
- 普氏野马（Equus ferus przewalskii）
- 鸭嘴兽（Ornithorhynchus anatinus）
- 针鼹（Tachyglossidae）
- 水豚（Hydrochoerus hydrochaeris）
- 貘（Tapirus）
- 灰鲸（Eschrichtius robustus）
- 小露脊鲸 （Caperea marginata）
- 鹈鹕 (Pelecanidae)
- 纽西兰鹩（Acanthisittidae）
- 麝雉（Opisthocomus hoazin）
- 阔嘴霸鹟（Sapayoa aenigma）
- 文须雀（Panurus biarmicus）
- 鼠鸟目（Coliiformes）
- 鹊鹅（Anseranas semipalmata）
- 叫鹤目（Cariamiformes）
- 猪鼻龟（Carettochelys insculpta）
- 鳄目（Crocodilia）
- 喙头蜥（Sphenodon）
- 塞舌蛙科（Nasikabatrachus sahyadrensis）
- 山椒鱼（Cryptobranchoidea）
- 钝口螈科（Ambystomatidae）
- 中国大鲵（Andrias davidianus）
- 肺鱼亚纲（Dipnomorpha）
- 腔棘鱼目 （Coelacanthiformes）
- 多鳍鱼目（Polypteriformes）
- 鲟形目（Acipenseriformes）
- 雀鳝目（Lepisosteiformes）
- 弓鳍鱼目（Amiiformes）
- 骨舌鱼群（Osteoglossomorpha）
- 皱鳃鲨（Chlamydoselachus anguineus）
- 哥布林鲨（Mitsukurinidae owstoni）
- 虎鲨目（Heterodontiformes）
- 瓦氏长须鲨（Brachaelurus waddi）
- 大白鲨（carcharias）
- 鲸鲨（Rhincodon typus）
- 螳䗛目（Mantophasmatidae）
- 异卵蜂科（Mymarommatidae）
- 泽蛉科（Nevrorthidae）
- Notiothauma reedi
- 寄生树蜂科（Orussidae）
- 鞘喙蝽科（Peloridiidae）
- Sikhotealinia zhiltzovae
- 北美有雪松香杉蜂（Syntexis libocedrii）
- 木鼻白蚁科（Stylotermitidae）
- 蜻蜓（Anisoptera）
- 蟑螂
- 鹦鹉螺科（Nautilidae）
- 翁戎螺总科（Pleurotomarioidea Swainson）
- 吸血乌贼（Vampyroteuthis infernalis）
