根瘤菌目

根瘤菌目（学名：Rhizobiales）是革兰氏阴性变形菌门中的一个目。

根瘤菌目
科学分类
域：	细菌域 Bacteria
门：	假单胞菌门 Pseudomonadota
纲：	α-变形菌纲 Alphaproteobacteria
目：	根瘤菌目 Rhizobiales Kuykendall, 2006
科
参见正文
异名
Hyphomicrobiales 生丝微菌目

具有会固氮作用和与植物根系共生的根瘤菌出现在几个不同的科中。 四个科中的慢生根瘤菌科，生毛霉菌科（英语：Hyphomicrobiaceae），Phyllobacteriaceae，和根瘤菌科至少含有6个固氮的，豆类结瘤的微生物共生菌。 例子是慢生根瘤菌属和根瘤菌属。 Methylocystaceae的种属是甲烷氧化菌（英语：甲烷营养生物）; 它们使用甲醇（CH₃OH）或甲烷（CH₄）作为唯一的能源和碳源。 其他重要属是人类病原体巴尔通体科和布鲁氏菌科，以及农杆菌属（遗传工程）。

下级分类

本科包括以下属：

• 河口短杆菌科 Aestuariivirgaceae Li et al. 2019
• 阿菲夫氏菌科 Afifellaceae Hördt et al. 2020
• 阿伦斯氏菌科 Ahrensiaceae Hördt et al. 2020
• 林杆菌科 Alsobacteraceae Sun et al. 2018
• 无形杆菌科 Amorphaceae Hördt et al. 2020
• 臂微菌科 Ancalomicrobiaceae Dahal et al. 2018
• 橙单胞菌科 Aurantimonadaceae Hördt et al. 2020
• 巴通体科 Bartonellaceae Gieszczykiewicz 1939
• 拜叶林克氏菌科 Beijerinckiaceae Garrity et al. 2006
• 芽生绿菌科 Blastochloridaceae Hördt et al. 2020
• 博斯氏菌科 Boseaceae Hördt et al. 2020
• 布罗汉菌科 Breoghaniaceae Hördt et al. 2020
• 布鲁氏菌科 Brucellaceae Breed et al. 1957
• 螯合球菌科 Chelatococcaceae Dedysh et al. 2016
• 黏着杆菌科 Cohaesibacteraceae Hwang and Cho 2008
• 德沃斯氏菌科 Devosiaceae Hördt et al. 2020
• 生丝微菌科 Hyphomicrobiaceae Babudieri 1950
• 凯斯特亚菌科 Kaistiaceae Hördt et al. 2020
• 地衣杆菌科 Lichenibacteriaceae Pankratov et al. 2020
  • 地衣杆菌属 Lichenibacterium Pankratov et al. 2020
    • 鼎湖地衣杆菌 Lichenibacterium dinghuense Guo et al. 2024^[1]
    • 小地衣杆菌 Lichenibacterium minus Pankratov et al. 2020，也拼作：Lichenibacterium minor
    • Lichenibacterium ramalinae Pankratov et al. 2020
• 栖地衣菌科 Lichenihabitantaceae Noh et al. 2019
  • Lichenifustis Pankratov et al. 2024
    • Lichenifustis flavocetrariae Pankratov et al. 2024 ^[2]
  • 栖地衣菌属 Lichenihabitans Noh et al. 2019
• Metallogeniaceae Zavarzin 1961
• 甲基杆菌科 Methylobacteriaceae Garrity et al. 2006
• 甲基孢囊菌科 Methylocystaceae Bowman 2006
• 硝化杆菌科 Nitrobacteraceae Buchanan 1917，也拼作：Nitrobacteriaceae
• 背尖贝杆菌科 Notoacmeibacteraceae Huang et al. 2017
• 细小棒菌科 Parvibaculaceae Hördt et al. 2020
• 水箱杆菌科 Phreatobacteraceae Hördt et al. 2020
• 叶杆菌科 Phyllobacteriaceae Mergaert and Swings 2006
• 多形单胞菌科 Pleomorphomonadaceae Hördt et al. 2020
• 假黄杆菌科 Pseudoxanthobacteraceae Hördt et al. 2020
  • 假黄杆菌属 Pseudoxanthobacter Arun et al. 2008
    • Pseudoxanthobacter liyangensis Liu et al. 2014
    • Pseudoxanthobacter soli Arun et al. 2008
• 好气杆菌科 Rhabdaerophilaceae Ming et al. 2020
• 根瘤菌科 Rhizobiaceae Conn 1938
• 红菌科 Rhodobiaceae Garrity et al. 2006
• 粉色弓形菌科 Roseiarcaceae Kulichevskaya et al. 2014
• 盐矿单胞科 Salinarimonadaceae Cole et al. 2018
• 慢生苍白杆菌科 Segnochrobactraceae Akter et al. 2020
• 斯塔普氏菌科 Stappiaceae Hördt et al. 2020
• 温暖无形杆菌科 Tepidamorphaceae Hördt et al. 2020
• 黄色杆菌科 Xanthobacteraceae Lee et al. 2005

参考资料

1. Guo XY, Zhang QM, Fu JC, Qiu LH. Terrirubrum flagellatum gen. nov., sp. nov. of Terrirubraceae fam. nov. and Lichenibacterium dinghuense sp. nov. from forest soil and proposal of Rhodoblastaceae fam. nov. Int J Syst Evol Microbiol 2024; 74:6348.
2. Pankratov TA, Samylina OS, Tikhonova EN, Ianutsevich EA, Avtukh AN, Lee YM. A novel bacteriobiont of the Arctic lichen Flavocetraria nivalis, Lichenifustis flavocetrariae gen. nov, sp. nov. demonstrating hydrolytic properties and containing a full set of the Calvin-Benson-Bassham cycle genes. Arch Microbiol 2023; 205:232.

延伸阅读

• Kuykendall, L. D. and Dazzo, F.B. 2005. Allorhizobium. In Brenner, Krieg, Staley and Garrity (Editors), The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, Part C, Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, 2nd. Ed., Vol. 2, Springer, New York, NY, pp. 345–346.
• Kuykendall, L. D. 2005 Genus Azorhizobium. In Brenner, Krieg, Staley and Garrity (Editors), The Alpha-, Beta-, Delta- and Epsilonproteobacteria, The Proteobacteria, Part C, Bergey’s Manual of Systematic Bacteriology, 2nd. Ed.,Vol. 2, Springer, New York, NY, pp. 505–506.
• Kuykendall, L.D. 2005. Genus Bradyrhizobium, family Bradyrhizobiaceae. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edition, 2nd Volume. George Garrity, (Ed.) Springer–Verlag, New York, NY, pp. 438–443.
• Chen, W. X., E.T. Wang, and L.D. Kuykendall. 2005. Genus Mesorhizobium, Family Photobacteriaceae. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edition, 2nd Volume. George Garrity, (Ed.) Springer–Verlag, New York, NY, pp. 403–408.,
• Kuykendall, L.D., J.M. Young, E. Martínez-Romero, A. Kerr, and H. Sawada. 2005. Genus Rhizobium, a highly divergent genus in a revised family, the Rhizobiaceae. In: Bergey's Manual of Systematic Bacteriology, 2nd Edition, 2nd Volume. George Garrity, (Ed.) Springer–Verlag, New York, NY, pp. 324–340.