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鰕虎科（学名：Gobiidae）物种按Larson & Murdy (2001)的分类，可分为以下的5个亚科24个属[1]：
- 近盲虾虎鱼亚科（Amblyopinae）：如鳗虾虎类（Taenioides）、狼牙虾虎鱼类（Odontamblyopus）。俗称“奶鱼”。背鳍和臀鳍与尾鳍相连，前后背鳍有鳍膜相连；穴居，体长呈鳗形，体色粉红至紫色，眼退化或消失。
- 虾虎鱼亚科（Gobiinae）
- 拟虾虎鱼亚科（Gobionellinae）
- 背眼虾虎鱼亚科（Oxudercinae）：如弹涂鱼类。中国过去称此亚科为“弹涂鱼科（Periophthalmidae）”，与虾虎鱼科并列归入虾虎鱼亚目当中。现已并入虾虎鱼科作为一亚科。 胸鳍基底发达成臂状，在陆上充当行动器官。眼背位，靠近，突出，下眼睑发达。下颌牙仅一排。
- 双盘虾虎鱼亚科（Sicydiinae）
有些文献会采用瘤鰕虎亚科（Benthophilinae），包括瘤鰕虎族、新鰕虎族、Ponticolini族。但Catalog of Fishes之类的主流分类仍然只承认鰕虎科传统的五个亚科，依然把本亚科的物种归入鰕虎亚科。
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- 繁口阿匍鰕虎鱼 Aboma etheostoma
- 白条钝鰕虎鱼 Amblygobius albimaculatus
- 菲律宾钝鰕虎鱼 Amblygobius buanensis
- 百瑙钝鰕虎鱼 Amblygobius bynoensis
- 华丽钝鰕虎鱼 Amblygobius decussatus
- 伊氏钝鰕虎鱼 Amblygobius esakiae
- 林克钝鰕虎鱼 Amblygobius linki
- 马氏钝鰕虎鱼 Amblygobius magnusi
- 短唇钝鰕虎鱼 Amblygobius nocturnus ：又称短唇钝鲨。
- 尾斑钝鰕虎鱼 Amblygobius phalaena ：又称尾斑钝鲨。
- 半带钝鰕虎鱼 Amblygobius semicinctus
- 西沃氏钝鰕虎鱼 Amblygobius sewardii
- 蛾钝鰕虎鱼 Amblygobius sphynx
- 胸眼钝鰕虎鱼 Amblygobius stethophthalmus
- 泰氏钝鰕虎鱼 Amblygobius tekomaji
- 钝孔鰕虎鱼 Amblyotrypauchen arctocephalus
- 微体玻璃鰕虎鱼 Aphia minuta
- 棘平牙鰕虎鱼 Apocryptes bato
- 网鰕虎鱼 Arcygobius baliurus
- 双砂栖鰕虎鱼 Arenigobius bifrenatus
- 砂栖鰕虎鱼 Arenigobius frenatus
- 莱氏砂栖鰕虎鱼 Arenigobius leftwichi
- 阿萨鰕虎鱼 Aruma histrio
- 黑带鞍鰕虎鱼 Astrabe fasciata
- 黄斑鞍鰕虎鱼 Astrabe flavimaculata
- 乳斑鞍鰕虎鱼 Astrabe lactisella
- 锡拉鞍鰕虎鱼 Astrabe sirahamaensis
- 泰国颊沟鰕虎鱼 Aulopareia janetae
- 绿斑颊沟鰕虎鱼 Aulopareia unicolor
- 沃氏软塘鳢 Austrolethops wardi ：又称华氏软塘鳢。
- 长须胡鰕虎鱼 Barbulifer antennatus
- 短须胡鰕虎鱼 Barbulifer ceuthoecus
- 墨西哥胡鰕虎鱼 Barbulifer mexicanus
- 豹纹胡鰕虎鱼 Barbulifer pantherinus
- 髯毛鰕虎鱼 Barbuligobius boehlkei ：又称须鰕虎。
- 布氏似深蜥鰕虎鱼 Benthophiloides brauneri Beling & Iljin, 1927
- 贝氏瘤鰕虎 Benthophilus baeri
- 颗粒瘤鰕虎 Benthophilus granulosus
- 格氏瘤鰕虎 Benthophilus grimmi
- 小头瘤鰕虎 Benthophilus leptocephalus
- 细吻瘤鰕虎 Benthophilus leptorhynchus
- 大头瘤鰕虎 Benthophilus macrocephalus
- 马氏瘤鰕虎 Benthophilus magistri
- 深瘤鰕虎 Benthophilus profundorum
- 棘瘤鰕虎 Benthophilus spinosus
- 星瘤鰕虎 Benthophilus stellatus
- 北澳洲大弹涂鱼 Boleophthalmus birdsongi
- 薄氏大弹涂鱼 Boleophthalmus boddarti
- 绿斑大弹涂鱼 Boleophthalmus caeruleomaculatus
- 杜氏大弹涂鱼 Boleophthalmus dussumieri
- 细斑大弹涂鱼 Boleophthalmus maculatus
- 大弹涂鱼 Boleophthalmus pectinirostris
- 波克白睛鰕虎鱼 Bollmannia boqueronensis
- 栉孔白睛鰕虎鱼 Bollmannia chlamydes
- 裸吻白睛鰕虎鱼 Bollmannia communis
- 艾氏白睛鰕虎鱼 Bollmannia eigenmanni
- 戈氏白睛鰕虎鱼 Bollmannia gomezi
- 白睛鰕虎鱼 Bollmannia jeannae
- 长鳍白睛鰕虎鱼 Bollmannia longipinnis
- 大盖白睛鰕虎鱼 Bollmannia macropoma
- 贪婪白睛鰕鱼 Bollmannia marginalis
- 睛斑白睛鰕虎鱼 Bollmannia ocellata
- 巴拿马白睛鰕虎鱼 Bollmannia pawneea
- 眼点白睛鰕虎鱼 Bollmannia stigmatura
- 荫白睛鰕虎鱼 Bollmannia umbrosa
- 短体盲鰕虎鱼 Brachyamblyopus brachysoma
- 红线盲鰕虎鱼 Brachyamblyopus rubrilineatus
- 群栖短鰕虎鱼 Brachygobius aggregatus
- 阿氏短鰕虎鱼 Brachygobius alcocki
- 道氏短鰕虎鱼 Brachygobius doriae
- 卡比伦短鰕虎鱼 Brachygobius kabiliensis
- 印度短鰕虎鱼 Brachygobius nunus
- 马来短鰕虎鱼 Brachygobius sabanus
- 休阿短鰕虎鱼 Brachygobius sua
- 黄黑短鰕虎鱼 Brachygobius xanthomelas
- 黄带短鰕虎鱼 （Brachygobius xanthozonus]]
- 狭鳃珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops amplus
- 戴安娜珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops dianneae
- 腹盘珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops discus
- 厄尔珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops earlei
- 红眼珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops erythrops
- 等鳞珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops isis
- 宽鳃珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops loki
- 漂游珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops natans ：又称红眼珊瑚鰕虎。
- 单鼻珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops nexus
- 裸头珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops ridens
- 虎纹珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops tigris
- 勇氏珊瑚鰕虎鱼 Bryaninops yongei ：又称颏突珊瑚鰕虎鱼。
- 安芬冰岛鰕虎鱼 Buenia affinis
- 冰岛鰕虎鱼 Buenia jeffreysii
- 腹鳞大眼鰕虎鱼 Cabillus lacertops
- 大眼鰕虎鱼 Cabillus tongarevae
- 隐眼鰕虎鱼 Caecogobius cryptophthalmus Berti & Ercolini, 1991
- 斑鳍卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius agulhensis
- 横带卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius caffer
- 钝头卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius dubius
- 好望角卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius gilchristi
- 点纹卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius natalensis
- 裸头卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius nudiceps
- 点鳍卡佛鰕虎鱼 Caffrogobius saldanha
- 头鰕虎鱼 Caragobius typhlops
- 无鳞鳗鰕虎 Caragobius urolepis
- 里海鰕虎鱼 Caspiosoma caspium (Kessler, 1877)，基异名：Gobiosoma caspium Kessler, 1877
- 长颌大口鰕虎鱼 Chaenogobius annularis ：又称长颌鰕虎。
- 栗色裸头鰕虎鱼 Chaenogobius castaneus
- 圆裸头鰕虎鱼 Chaenogobius cylindricus
- 七棘裸头鰕虎鱼 Chaenogobius heptacanthus
- 疣舌裸头鰕虎鱼 Chaenogobius isaza
- 黄带裸头鰕虎鱼 Chaenogobius laevis
- 大颌裸头鰕虎鱼 Chaenogobius macrognathus
- 网纹裸头鰕虎鱼 Chaenogobius mororanus
- 沟裸头鰕虎鱼 Chaenogobius scrobiculatus
- 塔氏裸头鰕虎鱼 Chaenogobius taranetzi
- 横带裸头鰕虎鱼 Chaenogobius transversefasciatus
- 颐突裸头鰕虎鱼 Chaenogobius uchidai
- 条尾裸头鰕虎鱼 Chaenogobius urotaenia
- 斑鳍矛尾鰕虎鱼 Chaeturichthys sciistius
- 矛尾鰕虎鱼 Chaeturichthys stigmatias
- 大口鰕虎鱼 Chasmichthys gulosus
- 蹼鰕虎鱼 Chiramenu fluviatilis
- 皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius eremius
- 葛氏皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius gloveri
- 芬河皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius japalpa
- 小鳍皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius micropterus
- 蝌蚪皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius ranunculus
- 颊麟皱鳃鰕虎鱼 Chlamydogobius squamigenus
- 巴氏厚唇鰕虎鱼 Chonophorus bustamantei
- 大吻厚唇鰕虎鱼 Chonophorus macrorhynchus
- 苍白厚唇鰕虎鱼 Chonophorus pallidus
- 纤厚唇鰕虎鱼 Chonophorus stamineus
- 楔形双鳞塘鳢 Chriolepis cuneata
- 穹苍双鳞塘鳢 Chriolepis dialepta
- 透明双鳞塘鳢 Chriolepis fisheri
- 美丽双鳞塘鳢 Chriolepis lepidota
- 微双鳞塘鳢 Chriolepis minutillus
- 矶双鳞塘鳢 Chriolepis tagus
- 条纹双鳞塘鳢 Chriolepis zebra
- 四带柔鰕虎鱼 Chromogobius quadrivittatus
- 斑带柔鰕虎鱼 Chromogobius zebratus
- 花斑翼棘鰕虎鱼 Clariger chionomaculatus
- 翼棘鰕虎鱼 Clariger cosmurus
- 细翼棘鰕虎鱼 Clariger exilis
- 无鳞翼棘鰕虎鱼 Clariger papillosus
- 箭鰕虎鱼 Clevelandia ios
- 利氏瞳鰕虎鱼 Corcyrogobius liechtensteini
- 卢氏瞳鰕虎鱼 Corcyrogobius lubbocki
- 阿氏真盔鰕虎鱼 Coryogalops adamsoni
- 真盔鰕虎鱼 Coryogalops anomolus
- 布氏真盔鰕虎鱼 Coryogalops bretti
- 巴基斯坦真盔鰕虎鱼 Coryogalops bulejiensis
- 单斑真盔鰕虎鱼 Coryogalops monospilus
- 沟真盔鰕虎鱼 Coryogalops ochetica
- 鳞鳍真盔鰕虎鱼 Coryogalops sordida
- 方斑真盔鰕虎鱼 Coryogalops tessellatus
- 威廉氏真盔鰕虎鱼 Coryogalops william
也称植鰕虎属。
- 带胸鲯塘鳢 Coryphopterus alloides
- 双点鲯塘鳢 Coryphopterus dicrus
- 澳洲鲯塘鳢 Coryphopterus duospilus
- 斑柄鲯塘鳢 Coryphopterus eidolon
- 纹鲯塘鳢 Coryphopterus glaucofraenum
- 臂斑植鰕虎 Coryphopterus humeralis
- 巨目鲯塘鳢 Coryphopterus hyalinus
- 黄斑鲯塘鳢 Coryphopterus inframaculatus
- 脂鲯塘鳢 Coryphopterus lipernes
- 新鲯塘鳢 Coryphopterus neophytus
- 沟鲯塘鳢 Coryphopterus ocheticus
- 环肛鲯塘鳢 Coryphopterus personatus
- 斑点鲯塘鳢 Coryphopterus punctipectophorus
- 圣鲯塘鳢 Coryphopterus signipinnis
- 条鳍鲯塘鳢 Coryphopterus thrix
- 尾斑鲯塘鳢 Coryphopterus urospilus
- 尖鳍杯鰕虎鱼 Cotylopus acutipinnis
- 绿斑纵颊鰕虎鱼 Creisson chlorostigmatoides
- 浅色项冠鰕虎鱼的异名 Cristatogobius albius
- 项冠鰕虎鱼 Cristatogobius lophius
- 浅色项冠鰕虎鱼 Cristatogobius nonatoae ：又称浅色项冠鰕虎。
- 裸头宽鳃鰕虎鱼 Croilia mossambica
- 阿拉伯拟丝鰕虎鱼 Cryptocentroides arabicus
- 凤头拟丝鰕虎鱼 Cryptocentroides gobioides
- 拟丝鰕虎鱼 Cryptocentroides insignis
- 线纹晶鰕虎鱼 Crystallogobius linearis
- 尼氏晶鰕虎鱼 Crystallogobius nilssonii
- 斜带栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops aurocingulus ：又称黄斑栉鰕虎。
- 褐斑栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops crocineus ：又称西昔尔栉鰕虎。
- 丝棘栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops feroculus
- 台湾栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops formosa
- 克氏栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops klausewitzi
- 班栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops maculosus
- 丝鳍栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops mitodes
- 点斑栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops pomastictus
- 长棘栉眼鰕虎鱼 Ctenogobiops tangaroai
- 条纹栉鰕虎鱼 Ctenogobius fasciatus
- 小尾栉鰕虎鱼 Ctenogobius lepturus
- 墨西哥栉鰕虎鱼 Ctenogobius manglicola
- 拟纹栉鰕虎鱼 Ctenogobius pseudofasciatus
- 箭栉鰕虎鱼 Ctenogobius sagittula
- 裸项栉鰕虎鱼 ctenogobius gymnauchen
- 中华栉孔鰕虎鱼 Ctenotrypauchen chinensis
- 若江栉孔鰕虎鱼 Ctenotrypauchen wakae
- 地中海三角鰕虎鱼 Deltentosteus colonianus
- 四斑三角鰕虎鱼 Deltentosteus quadrimaculatus
- 地中海皇后鰕虎鱼 Didogobius bentuvii
- 高知皇后鰕虎鱼 Didogobius kochi
- 施氏皇后鰕虎鱼 Didogobius schlieweni
- 斯氏皇后鰕虎鱼 Didogobius splechtnai
- 格氏异翼鰕虎鱼 Discordipinna griessingeri
- 圆头捷鰕虎鱼 Drombus globiceps
- 哈氏捷鰕虎鱼 Drombus halei
- 高体捷鰕虎鱼 Drombus key
- 鳞胸捷鰕虎鱼 Drombus lepidothorax
- 速泳捷鰕虎鱼 Drombus ocyurus
- 长身捷鰕虎鱼 Drombus simulus
- 三角捷鰕虎鱼 Drombus triangularis
- 埃博鰕虎鱼 Ebomegobius goodi
- 林氏荆鰕虎鱼 Echinogobius hayashii
- 侏儒依柯鰕虎鱼 Economidichthys pygmaeus
- 依柯鰕虎鱼 Economidichthys trichonis
- 黄蜂伊氏鰕虎鱼 Egglestonichthys bombylios
- 黑鳍伊氏鰕虎鱼 Egglestonichthys malenoptera
- 南海伊氏鰕虎鱼 Egglestonichthys patriciae
- 横带大头鰕虎鱼 Ego zebra
- 黑鼻霓虹鰕虎鱼 Elacatinus atronasus
- Elacatinus cayman
- 迪氏霓虹鰕虎鱼 Elacatinus digueti
- 金头霓虹鰕虎鱼 Elacatinus evelynae 又名黄头霓虹鰕虎鱼、美国霓虹鰕虎鱼、加勒比清洁鰕虎
- 菲格罗霓虹鰕虎鱼 Elacatinus figaro
- 格尼氏霓虹鰕虎鱼 Elacatinus genie 又名清洁鰕虎
- 霍氏霓虹鰕虎鱼 Elacatinus horsti 又名金灯鰕虎鱼
- 丑霓虹鰕虎鱼 Elacatinus inornatus
- 詹氏霓虹鰕虎鱼 Elacatinus janssi
- 岛栖霓虹鰕虎鱼 Elacatinus nesiotes
- 霓虹鰕虎鱼 Elacatinus oceanops 又名蓝灯鰕虎鱼
- Elacatinus phthirophagus
- 前唇霓虹鰕虎鱼 Elacatinus prochilos
- 墨西哥霓虹鰕虎鱼 Elacatinus puncticulatus
- 兰德尔霓虹鰕虎鱼 Elacatinus randalli
- 黄吻霓虹鰕虎鱼 Elacatinus xanthiprora
- 凯氏鳢鰕虎鱼 Eleotrica cableae
- 野懒鰕虎鱼 Enypnias aceras
- 寡鳞懒鰕虎鱼 Enypnias oligolepis
- 半裸懒鰕虎鱼 Enypnias seminudus
- 斜口圆鰕虎鱼 Eucyclogobius microps
- 真圆鰕虎鱼 Eucyclogobius newberryi
- 带鰕虎鱼 Eutaeniichthys gilli
- 伊氏埃弗曼鰕虎鱼 Evermannia erici
- 长鳍埃弗曼鰕虎鱼 Evermannia longipinnis
- 巴拿马埃弗曼鰕虎鱼 Evermannia panamensis
- 尾纹埃弗曼鰕虎鱼 Evermannia zosterura
- 粗尾艾鰕虎鱼 Evermannichthys metzelaari
- 仰鼻艾鰕虎鱼 Evermannichthys silus
- 琴鰕虎鱼 Evorthodus lyricus
- 微琴鰕虎鱼 Evorthodus minutus
- 无腹竿鰕虎鱼 Expedio parvulus
- 艾丽西亚蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius aliciae
- 裸项蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius gymnauchen ：又称裸颈鲨。
- 白条蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius lateralis
- 雀斑蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius lentiginosus
- 赖氏蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius reichei ：又称雷氏鲨。
- 圣蜂巢鰕虎鱼 Favonigobius suppositus
- 神女费尔鰕虎鱼 Feia nympha
- 福氏角吻鰕虎鱼 Flabelligobius fourmanoiri
- 西奈半岛角吻鰕虎鱼 Flabelligobius latruncularius
也称纺锤鰕虎鱼属。
- 斯氏配鰕虎鱼 Gammogobius steinitzi
- 虎鰕虎鱼 Garmannia macrodon
- 长颌姬鰕虎鱼 Gillichthys mirabilis
- 刺毛姬鰕虎鱼 Gillichthys seta
- 八纹金氏鰕虎鱼 Ginsburgellus novemlineatus
- 剑盖棘鰕虎鱼 Gladiogobius ensifer
- 马达加斯加叉舌鰕虎鱼 Glossogobius ankaranensis
- 金黄叉舌鰕虎鱼 Glossogobius aureus ：又称金叉舌鰕虎。
- 贝利叉舌鰕虎鱼 Glossogobius bellendenensis
- 双须舌鰕虎 Glossogobius bicirrhosus ：又称双须叉舌鰕虎。
- 拟背斑舌鰕虎鱼 Glossogobius brunnoides ：又称拟背斑叉舌鰕虎。
- 布氏叉舌鰕虎鱼 Glossogobius bulmeri
- 美丽叉舌鰕虎鱼 Glossogobius callidus
- 盘鳍叉舌鰕虎鱼 Glossogobius celebius ：又称盘鳍叉舌鰕虎。
- 钝吻舌鰕虎鱼 Glossogobius circumspectus ：又称横列叉舌鰕虎。
- 科特氏舌鰕虎鱼 Glossogobius coatesi
- 锥舌鰕虎鱼 Glossogobius concavifrons
- 黄鳍舌鰕虎鱼 Glossogobius flavipinnis
- 叉舌鰕虎鱼 Glossogobius giuris ：又称叉舌鰕虎。
- 霍氏舌鰕虎鱼 Glossogobius hoesei
- 中间舌鰕虎鱼 Glossogobius intermedius
- 科克舌鰕虎鱼 Glossogobius kokius
- 库拉高舌鰕虎鱼 Glossogobius koragensis
- 马坦舌鰕虎鱼 Glossogobius matanensis
- 暗鳍舌鰕虎鱼 Glossogobius obscuripinnis ：又称无斑叉舌鰕虎。
- 点带叉舌鰕虎鱼 Glossogobius olivaceus ：又称点带叉舌鰕虎。
- 少乳突舌鰕虎鱼 Glossogobius sparsipapillus
- 新畿内亚舌鰕虎鱼 Glossogobius torrentis
- 颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis anjerensis ：又称臀斑颌鳞鰕虎。
- 捷泳颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis baliurus
- 美尾颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis calliurus
- 高伦颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis cauerensis ：又称高伦颌鳞鰕虎。
- 肩斑颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis cauerensis cauerensis ：又称肩斑颔鳞鰕虎。
- 达澳颌鳞鰕虎 Gnatholepis davaoensis
- 臀斑颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis deltoides ：又称臀斑颌鳞鰕虎。
- 黄点颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis inconsequens
- 乃氏颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis knighti
- 汤氏颌鳞鰕虎鱼 Gnatholepis thompsoni
- 巴布亚犁突鰕虎鱼 Myersina papuanus
- 非洲似鰕虎鱼 Gobioides africanus
- 短似鰕虎鱼 Gobioides brevis
- 勃氏似鰕虎鱼 Gobioides broussonnetii
- 格氏似鰕虎鱼 Gobioides grahamae
- 秘鲁似鰕虎鱼 Gobioides peruanus
- 箭状似鰕虎鱼 Gobioides sagitta
- 黑鳍小鰕虎鱼 Gobionellus atripinnis
- 梭体小鰕虎鱼 Gobionellus boleosoma
- 克氏小鰕虎鱼 Gobionellus claytoni
- 普通小鰕虎鱼 Gobionellus comma
- 细齿小鰕虎鱼 Gobionellus daguae
- 纤小鰕虎鱼 Gobionellus gracillimus
- 滑鳞小鰕虎鱼 Gobionellus liolepis
- 点鳍小鰕虎鱼 Gobionellus manglicola
- 细齿小鰕虎鱼 Gobionellus microdon
- 西方小鰕虎鱼 Gobionellus occidentalis
- 大洋小鰕虎鱼 Gobionellus oceanicus
- 拟纹小鰕虎鱼 Gobionellus pseudofasciatus
- 眼带小鰕虎鱼 Gobionellus saepepallens
- 箭小鰕虎鱼 Gobionellus sagittula
- 舒氏小鰕虎鱼 Gobionellus shufeldti
- 宝石小鰕虎鱼 Gobionellus smaragdus
- 斑鳍小鰕虎鱼 Gobionellus stigmalophius
- 柱头小鰕虎鱼 Gobionellus stigmaticus
- 斑尾小鰕虎鱼 Gobionellus stigmaturus
- 大口小鰕虎鱼 Gobionellus stomatus
- 窄体髯鰕虎鱼 Gobiopsis angustifrons
- 短须髯鰕虎鱼 Gobiopsis aporia
- 砂髯鰕虎鱼 Gobiopsis arenaria ：又称砂鰕虎。
- 勃氏髯鰕虎鱼 Gobiopsis bravoi
- 大口髯鰕虎鱼 Gobiopsis macrostoma
- 蛇首髯鰕虎鱼 Gobiopsis pinto
- 五带髯鰕虎鱼 Gobiopsis quinquecincta
- 短鳍鳍鰕虎鱼 Gobiopterus brachypterus
- 鳍鰕虎鱼 Gobiopterus chuno
- 大鳞鳍鰕虎鱼 Gobiopterus macrolepis
- 明达鳍鰕虎鱼 Gobiopterus mindanensis
- 半饰鳍鰕虎鱼 Gobiopterus semivestita
- 薄氏𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma bosc
- 钱氏𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma chancei
- 墨西哥𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma chiquita
- 双鳞𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma dilepis
- 紧口𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma etheostoma
- 伊夫林𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma evelynae
- 八带𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma gemmatum
- 格尼𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma genie
- 金氏𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma ginsburgi
- 格氏𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma grosvenori
- 希氏𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma hildebrandi
- 同色𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma homochroma
- 白线𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma horsti
- 诱惑𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma illecebrosum
- 长身𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma longipala
- 路易莎𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma louisae
- 大牙𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma macrodon
- 多带𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma multifasciatum
- 裸𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma nudum
- 虹𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma oceanops
- 柄鳞𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma pallens
- 副荣𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma paradoxum
- 壮体𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma robustum
- 北美𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma yucatanum
- 细纹𬶋鰕虎鱼 Gobiosoma zebrella
- 阿蒂鰕虎鱼 Gobius ater
- 黄鰕虎鱼 Gobius auratus
- 扁头鰕虎鱼 Gobius batrachocephalus
- 布氏鰕虎鱼 Gobius bucchichi
- 似鳅鰕虎鱼 Gobius cobitis
- 康氏鰕虎鱼 Gobius commersonii
- 库氏鰕虎鱼 Gobius couchi
- 红嘴鰕虎鱼 Gobius cruentatus
- 静𬶋鰕虎鱼 Gobius eremius
- 仿鰕虎鱼 Gobius fallax
- 河鰕虎鱼 Gobius fluviatilis
- 加氏鰕虎鱼 Gobius gasteveni
- 细鰕虎鱼 Gobius geniporus
- 赫氏鰕虎鱼 Gobius haackei
- 高体鰕虎鱼 Gobius hypselosoma
- 红海鰕虎鱼 Gobius koseirensis
- 印度鰕虎鱼 Gobius kurpah
- 黑白鰕虎鱼 Gobius leucomelas
- 泥栖鰕虎鱼 Gobius luteus
- 黑鰕虎鱼 Gobius niger
- 蛇头鰕虎鱼 Gobius ophiocephalus
- 石鰕虎鱼 Gobius paganellus
- 朗氏鰕虎鱼 Gobius roulei
- 红斑鰕虎鱼 Gobius rubropunctatus
- 二点鰕虎鱼 Gobius ruthenspari
- 斯氏鰕虎鱼 Gobius scorteccii
- 塞内加尔鰕虎鱼 Gobius senegambiensis
- 真鰕虎鱼 Gobius similis
- 缚鰕虎鱼 Gobius strictus
- 似虎鰕虎鱼 Gobius tigrellus
- 热带鰕虎鱼 Gobius tropicus
- 黑鳍鰕虎鱼 Gobius villosus
- 条纹鰕虎鱼 Gobius vittatus
- 黄头鰕虎鱼 Gobius xanthocephalus
- 黄体尻鰕虎鱼 Gobiusculus flavescens
- 暗背鰕虎鱼 Gobulus crescentalis
- 汉氏暗背鰕虎鱼 Gobulus hancocki
- 迈氏暗背鰕虎鱼 Gobulus myersi
- 黑带戈罗鰕虎鱼 Gorogobius nigricinctus
- 半裸身塘鳢 Gymneleotris seminudus
- 邦奇氏裸身鰕虎鱼 Gymnogobius bungei
- 黑皮裸身鰕虎鱼 Gymnogobius nigrimembranis
- 黑翅裸身鰕虎鱼 Gymnogobius nigripinnis
- 蛙裸身鰕虎鱼 Gymnogobius raninus
- 大泷粗棘鰕虎鱼 Hazeus otakii
- 单鳞粗棘鰕虎鱼 Hazeus unisquamus
- 厚半鰕虎鱼 Hemigobius crassa
- 斜纹半鰕虎鱼 Hemigobius hoevenii）：又称霍氏间鰕虎。
- 无孔异塘鳢 Hetereleotris apora
- 双斑异塘鳢 Hetereleotris bipunctata
- 半带异塘鳢 Hetereleotris caminata
- 红海异塘鳢 Hetereleotris diademata
- 凯尼异塘鳢 Hetereleotris kenyae
- 光鳞异塘鳢 Hetereleotris margaretae
- 云纹异塘鳢 Hetereleotris nebulofasciata
- 杂色异塘鳢 Hetereleotris poecila
- 触手异塘鳢 Hetereleotris tentaculata
- 文森氏异塘鳢 Hetereleotris vinsoni
- 普异塘鳢 Hetereleotris vulgaris
- 桑给巴尔异塘鳢 Hetereleotris zanzibarensis
- 眼带异塘鳢 Hetereleotris zonata
- 细须异刺盖鰕虎鱼 Heteroplopomus barbatus
- 伯氏豚鰕虎鱼 Hyrcanogobius bergi
- 斑颊泞鰕虎鱼 Ilypnus gilberti
- 灿泞鰕虎鱼 Ilypnus luculentus
- 大头犬竿鰕虎鱼 Inu ama
- 康培氏衔鰕虎鱼 Istigobius campbelli ：又称康培氏衔鰕虎。
- 华丽衔鰕虎鱼 Istigobius decoratus
- 印度衔鰕虎鱼 Istigobius diadema
- 戈氏衔鰕虎 Istigobius goldmanni
- 豪氏衔鰕虎鱼 Istigobius hoesei
- 和歌衔鰕虎 Istigobius hoshinonis
- 黑点衔鰕虎鱼 Istigobius nigroocellatus
- 妆饰衔鰕虎鱼 Istigobius ornatus
- 桔黄衔鰕虎 Istigobius perspicillatus
- 线斑衔鰕虎 Istigobius rigilius
- 珠点衔鰕虎鱼 Istigobius spence
- 萨摩阿黏鰕虎鱼 Kelloggella cardinalis
- 多斑黏鰕虎鱼 Kelloggella centralis
- 寡鳞黏鰕虎鱼 Kelloggella oligolepis
- 多带黏鰕虎鱼 Kelloggella quindecimfasciata
- 叉牙黏鰕虎鱼 Kelloggella tricuspidata
- 高加索奈波鰕虎鱼 Knipowitschia caucasica
- 埃氏奈波鰕虎鱼 Knipowitschia ephesi
- 戈氏奈波鰕虎鱼 Knipowitschia goerneri
- 伊氏奈波鰕虎鱼 Knipowitschia iljini
- 长尾奈波鰕虎鱼 Knipowitschia longecaudata
- 马尔马拉湖奈波鰕虎鱼 Knipowitschia mermere
- 米氏奈波鰕虎鱼 Knipowitschia milleri
- 帕氏奈波鰕虎鱼 Knipowitschia panizzae
- 斑点奈波鰕虎鱼 Knipowitschia punctatissimus
- 萨沙奈波鰕虎鱼 Knipowitschia thessala
- 赫氏库曼鰕虎鱼 Koumansetta hectori ：又称海氏钝鲨。
- 雷氏库曼鰕虎鱼 Koumansetta rainfordi ：又称雷氏钝鲨。
- 吉氏壶鰕虎鱼 Lebetus guilleti
- 似鲉壶鰕虎鱼 Lebetus scorpioides
- 韧鰕虎鱼 Lentipes armatus
- 巴氏韧鰕虎鱼 Lentipes bustamantaei
- 同色韧鰕虎鱼 Lentipes concolor
- 马贵斯群岛韧鰕虎鱼 Lentipes rubrofasciatus
- 沃森氏韧鰕虎鱼 Lentipes watsoni
- 惠氏韧鰕虎鱼 Lentipes whittenorum
- 美鳞鰕虎鱼 Lepidogobius lepidus
- 东大西洋莱苏尔鰕虎鱼 Lesueurigobius friesii
- 异带莱苏尔鰕虎鱼 Lesueurigobius heterofasciatus
- 孔氏莱苏鰕虎鱼 Lesueurigobius kuomansi
- 桑氏莱苏尔鰕虎鱼 Lesueurigobius sanzoi
- 地中海莱苏尔鰕虎鱼 Lesueurigobius suerii
- 遗鰕虎鱼 Lethops connectens
- 彼氏冰鰕虎鱼 Leucopsarion petersii
- 高氏梭鰕虎鱼 Lizagobius galwayi
- 侧扁裂鰕虎鱼 Lobulogobius morrigu
- 阿曼裂鰕虎鱼 Lobulogobius omanensis
- 布氏蝌蚪鰕虎鱼 Lophiogobius bleekeri
- 睛尾蝌蚪鰕虎鱼 Lophiogobius ocellicauda
- 冠鰕虎鱼 Lophogobius cristulatus
- 鲤形冠鰕虎鱼 Lophogobius cyprinoides
- 白头鰕虎鱼 Lotilia graciliosa
- 日本竿鰕虎鱼 Luciogobius adapel
- 白竿鰕虎鱼 Luciogobius albus
- 长头竿鰕虎鱼 Luciogobius dormitoris
- 长竿鰕虎鱼 Luciogobius elongatus
- 鳍丝竿鰕虎鱼 Luciogobius grandis
- 斑点竿鰕虎鱼 Luciogobius guttatus ：又称斑点竿鲨。
- 鳞竿鰕虎鱼 Luciogobius koma
- 浅色竿鰕虎鱼 Luciogobius pallidus
- 小竿鰕虎鱼 Luciogobius parvulus
- 平头竿鰕虎鱼 Luciogobius platycephalus
- 西海竿鰕虎鱼 Luciogobius saikaiensis ：又称西海竿鲨。
- 狼牙双盘鰕虎鱼 Luposicya lupus
- 高体血鰕虎鱼 Lythrypnus alphigena
- 哥斯达黎加血鰕虎鱼 Lythrypnus cobalus
- 大鳄血鰕虎鱼 Lythrypnus crocodilus
- 蓝带血鰕虎鱼 Lythrypnus dalli
- 侏儒血鰕虎鱼 Lythrypnus elasson
- 吉氏血鰕虎鱼 Lythrypnus gilberti
- 橙带血鰕虎鱼 Lythrypnus heterochroma
- 岛栖血鰕虎鱼 Lythrypnus insularis
- 拉氏血鰕虎鱼 Lythrypnus lavenbergi
- 莫氏血鰕虎鱼 Lythrypnus mowbrayi
- 横带血鰕虎鱼 Lythrypnus nesiotes
- 五带血鰕虎鱼 Lythrypnus okapia
- 斑血鰕虎鱼 Lythrypnus phorellus
- 美丽血鰕虎鱼 Lythrypnus pulchellus
- 闪光血鰕虎鱼 Lythrypnus rhizophora
- 哥伦比亚血鰕虎鱼 Lythrypnus solanensis
- 胸斑血鰕虎鱼 Lythrypnus spilus
- 斑马血鰕虎鱼 Lythrypnus zebra
- 威氏壮牙鰕虎鱼 Macrodontogobius wilburi
- 大口巨颌鰕虎鱼 Mahidolia mystacina ：又称帆鳍鰕虎。
- 芒鰕虎鱼 Mangarinus waterousi
Marcelogobius Schliewen, 2023：[4]
- Peter helenae
- Peter janetarum
- Peter splechtnai
- 大颌矇眬鰕虎鱼 Mauligobius maderensis
- 尼氏矇眬鰕虎鱼 Mauligobius nigri
- 蟾头中鰕虎鱼 Mesogobius batrachocephalus
- 黑背中鰕虎鱼 Mesogobius nigronotatus
- 里海中鰕虎鱼 Mesogobius nonultimus
- 大头米勒鰕虎鱼 Millerigobius macrocephalus
- 吕宋神秘鰕虎鱼 Mistichthys luzonensis
- 红海肩孔鰕虎鱼 Monishia ochetica
- 裸鳍肩孔鰕虎鱼 Monishia william
- 线鳍鰕虎鱼 Nematogobius ansorgii
- 短线鳍鰕虎鱼 Nematogobius brachynemus
- 梅氏线鳍鰕虎鱼 Nematogobius maindroni
- 深水新鰕虎鱼 Neogobius bathybius
- 博氏新鰕虎鱼 Neogobius bogdanowi
- 里海新鰕虎鱼 Neogobius caspius
- 库拉河新鰕虎鱼 Neogobius cyrius
- 乳新鰕虎鱼 Neogobius fluviatilis
- 裸喉新鰕虎鱼 Neogobius gymnotrachelus
- 大头新鰕虎鱼 Neogobius kessleri
- 黑口新鰕虎鱼 Neogobius melanostomus
- 罗氏新鰕虎鱼 Neogobius rhodioni
- 丝鳍尼斯裸鰕虎鱼 Nes longus
- 欣氏岛鰕虎鱼 Nesogobius hinsbyi
- 美丽岛鰕虎鱼 Nesogobius pulchellus
- 南氏裸拟鰕虎鱼 Nudagobioides nankaii
- 印度歪鰕虎鱼 Obliquogobius cometes
- Obliquogobius eptactis Fujiwara, Psomadakis, Swe & Motomura, 2021[5]
- 特氏歪鰕虎鱼 Obliquogobius turkayi
- 地中海鰕虎鱼 Odondebuenia balearica
- 红狼牙鰕虎鱼 Odontamblyopus lacepedii ：又称盲条鱼。
- 詹氏蛇头鰕虎鱼 Ophiogobius jenynsi
- 蛇头鰕虎鱼 Ophiogobius ophicephalus
- 双棘拟刺盖鰕虎鱼 Oplopomops diacanthus
- 刺盖鰕虎鱼 Oplopomus oplopomus ：又称盖刺鰕虎。
- 莫桑比克妙音鰕虎鱼 Opua atherinoides
- 红海妙音鰕虎鱼 Opua elati
- 斑鳍妙音鰕虎鱼 Opua maculipinna
- 妙音鰕虎鱼 Opua nephodes
- 犬齿背眼鰕虎鱼 Oxuderces dentatus
- 沃氏背眼鰕虎鱼 Oxuderces wirzi
- 马氏帕多鰕虎鱼 Padogobius martensii
- 意大利帕多鰕虎鱼 Padogobius nigricans
- Palatogobius incendius Tornabene, Robertson & Baldwin, 2017[6]
- 犁鰕虎鱼 Palatogobius paradoxus
- 苔鰕虎鱼 Palutrus pruniosus
- 肩斑深鰕虎鱼 Palutrus scapulopunctatus
- 莱氏矮鰕虎鱼 Pandaka lidwilli
- 矮鰕虎鱼 Pandaka pygmaea
- 路氏矮鰕虎鱼 Pandaka rouxi
- 裸头矮鰕虎鱼 Pandaka silvana
- 三斑矮鰕虎鱼 Pandaka trimaculata
- 澳洲乳突鰕虎鱼 Papillogobius exquisitus
- 黑鳃乳突鰕虎鱼 Papillogobius melanobranchus
- 斑纹乳突鰕虎鱼 Papillogobius punctatus
- 乳突鰕虎鱼 Papillogobius reichei ：又称雷氏鲨。
- 大鳞副平牙鰕虎鱼 Parapocryptes macrolepis
- 长尾副平牙鰕虎鱼 Parapocryptes rictuosus
- 蜥形副平牙鰕虎鱼 Parapocryptes serperaster
- 小头副孔鰕虎鱼 Paratrypauchen microcephalus ：又称栉赤鲨。
- 大头副阿胡鰕虎鱼 Parawaous megacephalus
- 拟沙鰕虎鱼 Parkraemeria ornata
- 棕色麦鰕虎鱼 Parrella fusca
- 金氏麦鰕虎鱼 Parrella ginsburgi
- 卢氏麦鰕虎鱼 Parrella lucretiae
- 大颌麦鰕虎鱼 Parrella maxillaris
- 裸峡齿弹涂鱼 Periophthalmodon freycineti
- 许氏齿弹涂鱼 Periophthalmodon schlosseri
- 鳞峡齿弹涂鱼 Periophthalmodon septemradiatus
Peter Schliewen, 2023：[4]
- Peter amicuscaridis
- Peter wirtzi
- 平头叶状鰕虎鱼 Phyllogobius platycephalops
- 明仁扁眼鰕虎鱼 Platygobiopsis akihito
- 须鰕虎鱼 Pogonogobius planifrons
- 中华多椎鰕虎鱼 Polyspondylogobius sinensis
- 巴氏长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus bathi
- 密点长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus canestrinii
- 尼氏长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus knerii
- 洛氏长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus lozanoi
- 云斑长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus marmoratus
- 小眼长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus microps
- 小长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus minutus
- 长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus norvegicus
- 大眼长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus pictus
- 夸氏长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus quagga
- 托氏长臀鰕虎鱼 Pomatoschistus tortonesei
- 施氏犀孔鰕虎鱼 Porogobius schlegelii
- 云斑原吻鰕虎鱼 Proterorhinus marmoratus
- 半透明原吻鰕虎鱼 Proterorhinus semipellucidus
- 拟玻璃鰕虎鱼 Pseudaphya ferreri
- 婆罗洲拟平牙鰕虎鱼 Pseudapocryptes borneensis
- 长身拟平牙鰕虎鱼 Pseudapocryptes elongatus
- 大鳍拟叶鰕虎鱼 Pseudogobiodon macrochir
- Pseudogobiopsis lumbantobing Larson, Hadiaty & Hubert, 2017 [8]
- 少鳞拟髯鰕虎鱼 Pseudogobiopsis oligactis
- 似虎拟髯鰕虎鱼 Pseudogobiopsis tigrellus
- 大眼拟鰕虎鱼 Pseudogobius avicennia
- 等颌拟鰕虎鱼 Pseudogobius isognathus
- 爪哇拟鰕虎鱼 Pseudogobius javanicus
- 小口拟鰕虎鱼 Pseudogobius masago ：又称小拟鰕虎。
- 天鹅拟鰕虎鱼 Pseudogobius olorum
- 奥氏拟鰕虎鱼 Pseudogobius oratai
- 无孔拟吻鰕虎鱼 Pseudorhinogobius aporus
- 梅氏裸滑鰕虎鱼 Psilogobius mainlandi
- 条腹裸滑鰕虎鱼 Psilogobius prolatus
- 六带裸滑塘鳢 Psilotris alepis Ginsburg, 1953
- 似蟾裸滑塘鳢 Psilotris batrachodes
- 贝氏裸滑塘鳢 Psilotris boehlkei Greenfield, 1993
- 高棘裸滑塘鳢 Psilotris celsus Böhlke, 1963
- 考氏裸滑塘鳢 Psilotris kaufmani Greenfield, Findley & Johnson, 1993
- Psilotris laetarii Van Tassell & Young, 2016
- Psilotris laurae Van Tassell, Tornabene & Baldwin, 2016[9]
- Psilotris vantasselli Tornabene & Baldwin, 2019
- 蛇首高鳍鰕虎鱼 Pterogobius elapoides
- 纵带高鳍鰕虎鱼 Pterogobius virgo
- 五带高鳍鰕虎鱼 Pterogobius zacalles
- 白带高鳍鰕虎鱼 Pterogobius zonoleucus
- 半鳞鰕虎鱼 Pycnomma semisquamatum
- 瓜氏静鰕虎鱼 Quietula guaymasiae (Jenkins & Evermann, 1889)
- 静鰕虎鱼 Quietula y-cauda (Jenkins & Evermann, 1889)
- 带颊吻鰕虎鱼 Rhingobius taenigena
- 蓝点鲯鰕虎鱼 Rhinogobiops nicholsii (Bean, 1882)
- 小口獠牙鰕虎鱼 Risor ruber (Rosén, 1911)
- 相模鰕虎鱼 Sagamia geneionema (Hilgendorf, 1879)
- Schismatogobius alleni Keith, Lord & Larson, 2017
- 宽带裂身鰕虎鱼 Schismatogobius ampluvinculus Chen, Shao & Fang, 1995：又称宽带裸身鰕虎。
- Schismatogobius arscuttoli Keith, Lord & Hubert, 2017
- Schismatogobius baitabag Keith, Lord & Larson, 2017
- 勃氏裂身鰕虎鱼 Schismatogobius bruynisi de Beaufort, 1912
- Schismatogobius bussoni Keith, Hubert, Limmon & Darhuddin, 2017
- 德氏裂身鰕虎鱼 Schismatogobius deraniyagalai Kottelat & Pethiyagoda, 1989
- Schismatogobius essi Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius fuligimentus Chen, Séret, Pöllabauer & Shao, 2001
- Schismatogobius hoesei Keith, Lord & Larson, 2017
- 裂身鰕虎鱼 Schismatogobius insignus (Herre, 1927)
- 斑纹裂身鰕虎鱼 Schismatogobius marmoratus (Peters, 1868)
- Schismatogobius mondo Keith, Lord & Larson, 2017
- 忍者裂身鰕虎鱼 Schismatogobius ninja Maeda, Saeki & Satoh, 2017[10]
- Schismatogobius pallidus (Herre, 1934)
- Schismatogobius risdawatiae Keith, Darhuddin, Sukmono & Hubert, 2017
- 罗氏裂身鰕虎鱼 Schismatogobius roxasi Herre, 1936：又称罗氏裸身鰕虎。
- Schismatogobius sapoliensis Keith, Darhuddin, Limmon & Hubert, 2018
- Schismatogobius saurii Keith, Lord, Hadiaty & Hubert, 2017
- Schismatogobius tiola Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius tuimanua Keith, Lord & Larson, 2017
- Schismatogobius vanuatuensis Keith, Marquet & Watson, 2004
- Schismatogobius vitiensis Jenkins & Boseto, 2005
也称辛氏鳚属。
- 隐瓢鰕虎鱼 Sicydium adelum
- 哥斯达黎加瓢鰕虎鱼 Sicydium altum
- 巴巴多斯瓢鰕虎鱼 Sicydium antillarum
- 短瓢鰕虎鱼 Sicydium brevifile
- 巴斯瓢鰕虎鱼 Sicydium bustamantei
- 科科斯岛瓢鰕虎鱼 Sicydium cocoensis
- 锯唇瓢鰕虎鱼 Sicydium crenilabrum
- 费伊氏瓢鰕虎鱼 Sicydium fayae
- 裸腹瓢鰕虎鱼 Sicydium gymnogaster
- 希氏瓢鰕虎鱼 Sicydium hildebrandi
- 多斑瓢鰕虎鱼 Sicydium multipunctatum
- 皮氏瓢鰕虎鱼 Sicydium pittieri
- 瓢鰕虎鱼 Sicydium plumieri
- 细斑瓢鰕虎鱼 Sicydium punctatum
- 萨氏瓢鰕虎鱼 Sicydium salvini
- 黄带黄爪鰕虎鱼 Sicydium zosterophorum
- 双斑显色鰕虎鱼 Signnigobius biocellatus
- 红海扁头鰕虎鱼 Silhouettea aegyptia
- 钱氏扁头鰕虎鱼 Silhouettea chaimi
- 道津扁头鰕虎鱼 Silhouettea dotui
- 软扁头鰕虎鱼 Silhouettea evanida
- 霍氏扁头鰕虎鱼 Silhouettea hoesei
- 印度扁头鰕虎鱼 Silhouettea indicus
- 南方扁头鰕虎鱼 Silhouettea insinuans
- 项斑扁头鰕虎鱼 Silhouettea nuchipunctatus
- 丝鳍扁头鰕虎鱼 Silhouettea sibayi
- 眶管鰕虎鱼 Siphonogobius nue Shibukawa & Iwata, 1998
- 似红岩穴鰕虎鱼 Speleogobius trigloides Zander & Jelinek, 1976
- 布氏点鰕虎鱼 Stigmatogobius brocki
- 霍氏点鰕虎鱼 Stigmatogobius hoevenii
- 微点鰕虎鱼 Stigmatogobius minima
- 印尼点鰕虎鱼 Stigmatogobius poicilosoma
- 班鳍点鰕虎鱼 Stigmatogobius sadanundio 又名印度点鰕虎鱼。
- 横带连膜鰕虎鱼 Stonogobiops dracula
- 拉森氏连膜鰕虎鱼 Stonogobiops larsonae
- 中间连膜鰕虎鱼 Stonogobiops medon
- 丝鳍连膜鰕虎鱼 Stonogobiops nematodes
- 五带连膜鰕虎鱼 Stonogobiops pentafasciata
- 黄吻连膜鰕虎鱼 Stonogobiops xanthorhinica
- 红带连膜虾虎鱼 Stonogobiops yasha
- 围鼻猪鰕虎鱼 Sueviota atrinasa
- Sueviota bryozophila Allen, Erdmann & Cahyani, 2016 [11]
- 橙色猪鰕虎鱼 Sueviota lachneri
- 拉氏猪鰕虎鱼 Sueviota larsonae
- 双须多棘鰕虎鱼 Sufflogobius bibarbatus
- 底栖骏河鰕虎鱼 Suruga fundicola
- 斑尾复鰕虎鱼 Synechogobius ommaturus
- 鳗鰕虎鱼 Taenioides anguillaris ：又称鳗形灰盲条鱼。
- 布氏鳗鰕虎鱼 Taenioides buchanani
- 须鳗鰕虎鱼 Taenioides cirratus ：又称灰盲条鱼。
- 大牙鳗鰕虎鱼 Taenioides esquivel
- 细鳗鰕虎鱼 Taenioides gracilis
- 杰氏鳗鰕虎鱼 Taenioides jacksoni
- 等颌鳗鰕虎鱼 Taenioides limicola ：又称等颌灰盲条鱼。
- 黑缘鳗鰕虎鱼 Taenioides nigrimarginatus
- 印度纹唇毛背鱼 Taeniolabrus cyclograptus
- 格氏塔斯曼鰕虎鱼 Tasmanogobius gloveri
- 拉氏塔斯曼鰕虎鱼 Tasmanogobius lasti
- 洛氏塔斯曼鰕虎鱼 Tasmanogobius lordi
- 野吸鰕虎鱼 Tenacigobius ridens
- 安哥拉猛鰕虎鱼 Thorogobius angolensis
- 猛鰕虎鱼 Thorogobius ephippiatus
- 大鳞猛鰕虎鱼 Thorogobius macrolepis
- 罗氏猛鰕虎鱼 Thorogobius rofeni
- 红带微鰕虎鱼 Trimmatom eviotops
- 大足微鰕虎鱼 Trimmatom macropodus
- 微鰕虎鱼 Trimmatom nanus
- 查戈斯岛微鰕虎鱼 Trimmatom offucius
- 鞍微鰕虎鱼 Trimmatom sagma
- 大堡礁微鰕虎鱼 Trimmatom zapotes
- 菲律宾塔库鰕虎鱼 Tukugobius philippinus
- 泥鰕虎鱼 Tyntlastes sagitta
- 加州盲鰕虎鱼 Typhlogobius californiensis
- 大眼范尼鰕虎鱼 Vanneaugobius canariensis
- 多氏范尼鰕虎鱼 Vanneaugobius dollfusi
- 普氏范尼鰕虎鱼 Vanneaugobius pruvoti
- 管鰕虎鱼 Varicus bucca
- Varicus lacerta Tornabene, Robertson & Baldwin, 2016[12]
- 玛里琳管鰕虎鱼 Varicus marilynae
- 阿马韦氏鰕虎鱼 Weberogobius amadi (Weber, 1913)
- 马氏惠勒鰕虎鱼 Wheelerigobius maltzani
- 沃氏惠勒鰕虎鱼 Wheelerigobius wirtzi
- 云斑裸颊鰕虎鱼 Yongeichthys criniger
- 云纹裸颊鰕虎鱼 Yongeichthys nebulosus ：又称云纹鰕虎。
- 汤氏裸颊鰕虎鱼 Yongeichthys thomasi
- 印度裸颊鰕虎鱼 Yongeichthys tuticorinensis
- 柴帕钝牙鰕虎鱼 Zappa confluentus (Roberts, 1978)
- 真斑马鰕虎鱼 Zebrus zebrus (Risso, 1827)
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