冠状病毒刺突蛋白

刺突糖蛋白（spike (S) glycoprotein）^[2]又称刺突蛋白^[3]、棘蛋白、S蛋白，旧名 E2^[4]，是冠状病毒中最大的一种结构蛋白^[5]，其功能为负责病毒进入（英语：Viral entry）宿主细胞，在病毒感染期间介导受体识别、细胞附着和融合^[6]。

Coronavirus spike glycoprotein S1
严重急性呼吸系统综合症冠状病毒2型的外部结构模型，当中的球状物为原子。[1] ● 蓝色: 套膜 ● 青色:   棘蛋白 (S) ● 红色: 封套蛋白（英语：coronavirus envelope protein） (E) ● 绿色: 膜蛋白（英语：coronavirus membrane protein） (M) ● 橙色: 聚糖
鉴定
标志	CoV_S1
Pfam	PF01600（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR002551
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

Coronavirus spike glycoprotein S2
鉴定
标志	CoV_S2
Pfam	PF01601（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR002552
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

Betacoronavirus spike glycoprotein S1, receptor binding
鉴定
标志	bCoV_S1_RBD
Pfam	PF09408（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR018548
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

Betacoronavirus-like spike glycoprotein S1, N-terminal
鉴定
标志	bCoV_S1_N
Pfam	PF16451（旧版）
InterPro（英语：InterPro）	IPR032500
现有可用的蛋白结构： Pfam 结构（旧版） / ECOD PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum（英语：PDBsum） 结构概要

由于刺突蛋白可结合成蛋白三聚体，此时可以看到病毒体表面有突出的大结构，称为“刺突”^[4][5][7]或“棘突”^[8]。

刺突糖蛋白可以与细胞表面受体相互作用，然后病毒膜和细胞膜就会融合，最终导致病毒进入宿主细胞（英语：Viral entry）。刺突糖蛋白具有高度免疫原性。人们从严重急性呼吸系统综合症和2019冠状病毒病疫情康复的患者中发现了专门针对刺突糖蛋白的抗体^[9]。

参考文献

1. Solodovnikov, Alexey; Arkhipova, Valeria. Достоверно красиво: как мы сделали 3D-модель SARS-CoV-2 [Truly beautiful: how we made the SARS-CoV-2 3D model]. N+1. 29 July 2021 [30 July 2021]. （原始内容存档于30 July 2021） （俄语）.
2. Shen S, Tan T H P, Tan Y J. Expression, glycosylation, and modification of the spike (S) glycoprotein of SARS CoV[J]. Glycovirology Protocols, 2007: 127-135.
3. Deng, X.; Baker, S.C. Coronaviruses: Molecular Biology (Coronaviridae). Encyclopedia of Virology. 2021: 198–207. ISBN 9780128145166. doi:10.1016/B978-0-12-814515-9.02550-9.
4. Masters, Paul S. The Molecular Biology of Coronaviruses. Advances in Virus Research. 2006, 66: 193–292. ISBN 9780120398690. PMC 7112330 . PMID 16877062. doi:10.1016/S0065-3527(06)66005-3.
5. Wang, Yuhang; Grunewald, Matthew; Perlman, Stanley. Coronaviruses: An Updated Overview of Their Replication and Pathogenesis. Coronaviruses. Methods in Molecular Biology 2203. 2020: 1–29. ISBN 978-1-0716-0899-9. PMC 7682345 . PMID 32833200. doi:10.1007/978-1-0716-0900-2_1.
6. Huang, Y., Yang, C., Xu, Xf. et al. Structural and functional properties of SARS-CoV-2 spike protein: potential antivirus drug development for COVID-19. Acta Pharmacol Sin 41, 1141–1149 (2020). https://doi.org/10.1038/s41401-020-0485-4
7. Zhu, Chaogeng; He, Guiyun; Yin, Qinqin; Zeng, Lin; Ye, Xiangli; Shi, Yongzhong; Xu, Wei. Molecular biology of the SARs‐CoV‐2 spike protein: A review of current knowledge. Journal of Medical Virology. 14 June 2021, 93 (10): 5729–5741. PMC 8427004 . PMID 34125455. doi:10.1002/jmv.27132.
8. 存档副本. [2022-06-03]. （原始内容存档于2022-02-12）.
9. V’kovski, Philip; Kratzel, Annika; Steiner, Silvio; Stalder, Hanspeter; Thiel, Volker. Coronavirus biology and replication: implications for SARS-CoV-2. Nature Reviews Microbiology. March 2021, 19 (3): 155–170. PMC 7592455 . PMID 33116300. doi:10.1038/s41579-020-00468-6.