三域系统

三域系统（three-domain system）是由美国微生物学家和生物物理学家卡尔·乌斯等人在1990年提出的生物分类系统^[1]^[2]，将所有细胞生命都归分于三大域的分类阶元之下，即古菌域（Archaea）、细菌域（Bacteria）和真核域（Eukarya）。

乌斯依据16S 核糖体RNA序列上的差别，将原核生物分成两大类，起初称为真细菌和古细菌，认为这两类生物和真核生物一起从一个具有原始遗传机制的最后共同祖先分别演化而来，因此将三者各置为一域，作为比“界”高一级的分类系统。古菌域下有古细菌界 (Kingdom Archaea)，细菌域下有细菌界 (Kingdom Bacteria)，真核生物域下有六个界：囊泡藻界 (Chromalveolata)、古虫界（Excavata）、有孔虫界（Rhizaria）、真菌界 (Fungi)、植物界（Plantae）和动物界 (Animalia)。加上其他未专属域下有病毒，和亚病毒因子两个界，总共有十界。

然而，rRNA树有可能将演化太快的类群放错位置（比如微孢子虫）。有人认为生物的根源应该在真细菌之内，很多真细菌的类群在古细菌之前分支出来，很晚古细菌和真核生物才彼此分开。

三域特征比较[3]

More information 特征, 细菌域 Bacteria ...

特征	细菌域 Bacteria	古菌域 Archaea	真核域 Eukarya
形态和遗传
原核细胞结构	是	是	否
核膜	无	无	有
共价闭合环状DNA	是	是	否
质粒	有	有	稀少
核糖体大小	70S	70S	80S
多数基因中有内含子	否	否	是
操纵子	有	有	无
mRNA加5'端帽和3'聚A尾	无（部份有聚A尾，但作用与真核不同^[4]）	无	有
组织蛋白	无	有	有
细胞壁	含胞壁酸	不含胞壁酸	不含胞壁酸
膜脂质	酯键连接	醚键连接	酯键连接
起始tRNA	甲酰蛋氨酸	蛋氨酸	蛋氨酸
核糖体对泛素敏感	否	是	是
RNA聚合酶	1个

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参见

双域系统（英语：Two-empire system）
原核生物界
系统发生树
生物分类
生物分类学
内共生学说
界 (生物)（Kingdom）
原生生物 - 不被归纳于三域系统之中

参考文献

[1]
Woese C, Fox G. Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms.. Proc Natl Acad Sci USA. 1977, 74 (11): 5088–90. Bibcode:1977PNAS...74.5088W. PMC 432104 . PMID 270744. doi:10.1073/pnas.74.11.5088.
[2]
Woese C, Kandler O, Wheelis M. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya.. Proc Natl Acad Sci USA. 1990, 87 (12): 4576–9 [11 Feb 2010]. Bibcode:1990PNAS...87.4576W. PMC 54159 . PMID 2112744. doi:10.1073/pnas.87.12.4576. （原始内容存档于2008-06-27）.
↑
Michael Madigan, John Martinko: Brock Biology of Microorganisms (11th Edition). Prentice Hall, 11th Edition. ISBN 978-0-13-144329-7 （英文）
[4]
Slomovic, Shimyn; Portnoy, Victoria; Liveanu, Varda; Schuster, Gadi. RNA Polyadenylation in Prokaryotes and Organelles; Different Tails Tell Different Tales. Critical Reviews in Plant Sciences. 2006, 25: 65–77. doi:10.1080/07352680500391337.

[1] [1]
Woese C, Fox G. Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms.. Proc Natl Acad Sci USA. 1977, 74 (11): 5088–90. Bibcode:1977PNAS...74.5088W. PMC 432104 . PMID 270744. doi:10.1073/pnas.74.11.5088.

[w1990-2] [2]
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[3] 
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[organelles-4] [4]
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