Z-DNA又称Z型DNA,是DNA双螺旋结构的一种形式,具有左旋型态的双股螺旋(与常见的B-DNA相反),并呈现锯齿形状。Z-DNA为三种具生物活性的DNA双螺旋结构之一,另两种为A-DNA与B-DNA。
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历史
Z-DNA为首先于1979年被解出晶体结构的DNA型态,研究者为麻省理工大学的Alexander Rich等人[1]。B型及Z型相互结合时的结晶则解于2005年[2],使科学家了解Z-DNA在细胞中的潜在角色,当一段Z-DNA形成时,其两端必为B-Z相互结合型态,形成与B-DNA的界面。
结构
Z-DNA的双股螺旋为左旋型态,与B-DNA的右旋型态明显有所差别。其结构每两个碱基对重复出现一次。大小螺旋凹槽之间的差别较A型及B型小,只在宽度上有些微差异。这种型态并不常见,但某些特定情况可增加其存在的可能,如嘌呤-嘧啶交替序列、DNA超螺旋,或盐分与某些阳离子浓度高时。
Z-DNA能够与B-DNA构成相互结合型态,这种结构会使一对碱基突出于双螺旋之外。
一些DNA形式几何形状的对比
几何属性 | A-DNA | B-DNA | Z-DNA |
---|---|---|---|
螺旋方向 | 右旋 | 右旋 | 左旋 |
重复单元 | 1 bp | 1 bp | 2 bp |
Rotation/bp | 32.7° | 35.9° | 60°/2 |
bp/turn | 10 | 11 | 12 |
Inclination of bp to axis | +19° | −1.2° | −9° |
Rise/bp along axis | 2.3 Å (0.23 nm) | 3.32 Å (0.332 nm) | 3.8 Å (0.38 nm) |
Pitch/turn of helix | 28.2 Å (2.82 nm) | 33.2 Å (3.32 nm) | 45.6 Å (4.56 nm) |
Mean propeller twist | +18° | +16° | 0° |
糖基角度 | anti | anti | C: anti, G: syn |
Sugar pucker | C3'-endo | C2'-endo | C: C2'-endo, G: C3'-endo |
直径 | 23 Å (2.3 nm) | 20 Å (2.0 nm) | 18 Å (1.8 nm) |
来源:[3][4][5] |
参见
参考文献
外部链接
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