本页面列出了病毒的分类,包含病毒以及类病毒普利昂蛋白卫星病毒亚病毒因子

生物分类表

由于病毒并不像其他生物能借由交配产生后代,因此在种别的定义上与一般生物有所不同。

概论

ICTV 分类法

国际病毒分类委员会(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,简称 ICTV)是国际微生物学联合会(英文:International Union of microgical Societies)发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构,在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念,即病毒分类的分支层次中的最低分类单元[1]。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。

到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究,从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的,而来自环境中(如海水、大洋沉积物等)的病毒样品则大部分的序列都是全新的[2]

病毒分类从域开始,结构如下,分类后缀在括号中:[3]

英语Realm (virology) Realm(-viria
亚域 Subrealm(-vira
Kingdom(-viriae
亚界 Subkingdom(-virites
Phylum(-viricota
亚门 Subphylum(-viricotina
Class(-viricetes
亚纲 Subclass(-viricetidae
Order(-virales
亚目 Suborder(-virineae
Family(-viridae
亚科 Subfamily(-virinae
Genus(-virus
亚属 Subgenus(-virus
Species

物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现,尤其是高等动植物。 ICTV 2023版分类表中总共有6个域、10个界、18个门、2个亚门、41个纲、81个目、11个亚目、314个科、200个亚科、3522个属、84个亚属与14690个种。除亚域、亚界和亚纲外,其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、22个地位未定科及2个地位未定属被承认[4]

巴尔的摩分类法

Thumb
巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的合成方式

诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统[5]。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类[6][7][8]

巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中,必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制,但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNADNA,可以有也可以没有反转录酶。而且,单链RNA病毒可以是正义(+)或反义(-)。这一分类法将病毒分为7类:

举一个病毒分类的例子:水痘病毒,即带状疱疹病毒,属于疱疹病毒目疱疹病毒科甲型疱疹病毒亚科水疱病毒属;同时,带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类,因为它是双链 DNA 病毒,且不含有反转录酶。

ICTV 2023版病毒分类表

此套分类系统与细胞生物分类系统有许多共同特征,如分类单元结构,但也存在一些差异,比如所有分类名称都使用斜体,这与国际藻类、真菌和植物命名法国际动物命名法不同。

A型DNA病毒域 Adnaviria

  • 齐利希病毒界 Zilligvirae 1门
    • 杆状病毒门 Taleaviricota 1纲
      • 线状病毒纲 Tokiviricetes 3目
        • 细带病毒目 Ligamenvirales 2科
        • 墨洗门病毒目 Maximonvirales
          • 阿·蒙病毒科 Ahmunviridae
        • 第一病毒目 Primavirales 1科
          • 三层病毒科 Tristromaviridae

双链去氧核糖核酸病毒域 Duplodnaviria

  • 香港病毒界 Heunggongvirae 2门
    • 衣壳病毒门 Peploviricota 1纲
    • 尾噬菌体门 Uroviricota 1纲
      • 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
        • 有尾噬菌体目 Caudovirales
        • crAss噬菌体目 Crassvirales
          • 肠道噬菌体科 Crevaviridae
          • 肠子噬菌体科 Intestiviridae
          • 肠管噬菌体科 Steigviridae
          • 肠噬菌体科 Suoliviridae
        • 海港噬菌体目 Juravirales
          • 盐港噬菌体科 Yangangviridae
          • 盐卤卡噬菌体科 Yanlukaviridae
        • 千面噬菌体目 Kirjokansivirales
          • 变殖噬菌体科 Graaviviridae
          • 泛盐噬菌体科 Haloferuviridae
          • 鱼尾噬菌体科 Pyrstoviridae
          • 短尾盐噬菌体科 Shortaselviridae
        • 海洋组噬菌体目 Magrovirales
          • 敖广噬菌体科 Aoguangviridae
        • 甲烷杆噬菌体目 Methanobavirales
          • 厌氧噬菌体科 Anaerodiviridae
          • 具刺噬菌体科 Armatusviridae
          • 开罗噬菌体科 Kairosviridae
          • 莱氏噬菌体科 Leisingerviridae
          • Pigerviridae
        • 纳孔噬菌体目 Nakonvirales
          • 阿·普切噬菌体科 Ahpuchviridae
          • 艾克·曲瓦噬菌体科 Ekchuahviridae
        • 苏雷玛噬菌体目 Thumleimavirales
          • 盐噬菌体科 Druskaviridae
          • 富盐噬菌体科 Hafunaviridae
          • 嗜盐大噬菌体科 Halomagnusviridae
          • 盐场噬菌体科 Soleiviridae
        • 埃凯曼病毒科 Ackermannviridae
        • 集聚噬菌体科 Aggregaviridae
        • 艾莉丝·埃文斯噬菌体科 Aliceevansviridae
        • 阿伦伯格噬菌体科 Arenbergviridae
        • 规范噬菌体科 Assiduviridae
        • 自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae
        • 卡斯金斯噬菌体科 Casjensviridae
        • 蔡斯噬菌体科 Chaseviridae
        • Chimalliviridae
        • Clermontviridae
        • 德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae
        • 德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae
        • 杜恩噬菌体科 Duneviridae
        • 热噬菌体科 Fervensviridae
        • 凡赛提噬菌体科 Forsetiviridae
        • 弗雷德·法斯蒂尔噬菌体科 Fredfastierviridae
        • 格里蒙噬菌体科 Grimontviridae
        • 格兰噬菌体科 Guelinviridae
        • 赫尔戈兰噬菌体科 Helgolandviridae
        • 赫莱尔噬菌体科 Herelleviridae
        • 克列兹考斯卡噬菌体科 Kleczkowskaviridae
        • Konodaiviridae
        • 蓝绿噬藻体科 Kyanoviridae
        • Lutetiaviridae
        • 玛萨噬菌体科 Madisaviridae
        • 马德里噬菌体科 Madridviridae
        • 梅西扬日诺夫噬菌体科 Mesyanzhinovviridae
        • 莫利可噬菌体科 Molycolviridae
        • 友好噬菌体科 Naomviridae
        • 奥拉-詹森噬菌体科 Orlajensenviridae
        • 厚噬菌体科 Pachyviridae
        • P2噬菌体科 Peduoviridae
        • 漫游噬菌体科 Pervagoviridae
        • 普切斯噬菌体科 Pootjesviridae
        • 刺噬菌体科 Pungoviridae
        • 朗特里噬菌体科 Rountreeviridae
        • 萨弗曼噬菌体科 Saffermanviridae
        • 萨拉玛噬菌体科 Salasmaviridae
        • 猪尾噬菌体科 Saparoviridae
        • 斯基托噬菌体科 Schitoviridae
        • 希望噬菌体科 Speroviridae
        • 斯坦·威廉噬菌体科 Stanwilliamsviridae
        • 斯特拉波噬菌体科 Straboviridae
        • 盐菌噬菌体科 Suolaviridae
        • 富山噬菌体科 Toyamaviridae
        • 梅园噬菌体科 Umezonoviridae
        • 维尔丹尼噬菌体科 Verdandiviridae
        • 翻转噬菌体科 Vertoviridae
        • VLM群噬菌体科 Vilmaviridae
        • 维诺噬菌体科 Winoviridae
        • Zierdtviridae
        • 佐贝尔噬菌体科 Zobellviridae

单链去氧核糖核酸病毒域 Monodnaviria

包含4界

  • 洛布病毒界 Loebvirae 1门
  • 桑格病毒界 Sangervirae 1门
  • 称徳病毒界 Shotokuvirae 2门
    • 科萨特病毒门 Cossaviricota 3纲
    • 单环编码病毒门 Cressdnaviricota 2纲:编码复制相关蛋白的环状单链 DNA 病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses,CRESS DNA viruses)
      • 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
        • 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
          • 硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
        • 圆环病毒目 Cirlivirales 3科
          • 圆环病毒科 Circoviridae
          • 内蜒病毒科 Endolinaviridae
          • 维雅病毒科 Vilyaviridae
        • CRESS亚基因组目 Cremevirales 1科
          • 小环状 DNA 病毒科 Smacoviridae
        • 连环病毒目 Gredzevirales
          • 长蛇病毒科 Gandrviridae
          • 衔尾病毒科 Ouroboviridae
        • 耶梦病毒目 Jormunvirales
          • 德罗普尼病毒科 Draupnirviridae
        • 多分体基因病毒目 Mulpavirales 3科
          • 动物CRESS病毒科 Anicreviridae
          • 中介病毒科Metaxyviridae
          • 矮缩病毒科 Nanoviridae
        • 圆形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
          • 圆形病毒科 Redondoviridae
        • 戒环病毒目 Ringavirales
          • 秘鲁圆环样病毒科 Pecoviridae
        • 幽谷病毒目 Rivendellvirales
          • 纳雅病毒科 Naryaviridae
        • 洛汗病毒目 Rohanvirales
          • 白石病毒科 Adamaviridae
          • 异圆环病毒科 Kirkoviridae
          • 能雅病毒科 Nenyaviridae
        • 镇星病毒目 Saturnivirales
          • 丰茂病毒科 Kanorauviridae
          • 多源病毒科 Mahapunaviridae
      • Rep 单链编码病毒纲 Repensiviricetes 1目
  • 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1门
    • 嗜盐病毒门 Saleviricota 1纲
      • 凌乱病毒纲 Huolimaviricetes 1目
        • 盐藻病毒目 Haloruvirales 1科
          • 嗜盐菌多形病毒科 Pleolipoviridae

核糖病毒域 Riboviria

包含2界、2科、4属

核酶病毒域 Ribozyviria

多变去氧核糖核酸病毒域 Varidnaviria

包含2界

  • 班福病毒界 Bamfordvirae 2门
    • 核质病毒门 Nucleocytoviricota 2纲
      • 巨病毒纲 Megaviricetes 3目
        • 藻类病毒目 Algavirales 1科
        • 模拟病毒目 Imitervirales
          • 异拟菌病毒科 Allomimiviridae
          • 中拟病毒科 Mesomimiviridae
          • 拟菌病毒科 Mimiviridae
            • 次拟菌病毒亚科 Aliimimivirinae
            • 克堡病毒亚科 Klosneuvirinae
            • 巨大拟菌病毒亚科 Megamimivirinae
          • 分拟菌病毒科 Schizomimiviridae
        • 阔虹马囊病毒目 Pimascovirales 3科
          • 囊泡病毒科 Ascoviridae
          • 雪松病毒科 Cedratviridae
          • 虹彩病毒科 Iridoviridae 2亚科
          • 马赛病毒科 Marseilleviridae
          • 变形病毒科 Orpheoviridae
          • 阔口罐病毒科 Pithoviridae
        • 魔物病毒科 Mamonoviridae
      • 痘疹病毒纲 Pokkesviricetes 2目
    • 质粒前体病毒门 Preplasmiviricota 3纲
      • 单体病毒纲 Ainoaviricetes
        • 劳塔莫病毒目 Lautamovirales
          • 芬兰湖病毒科 Finnlakeviridae
      • 独特病毒纲 Maveriviricetes
        • 多变五邻体病毒目 Divpevirales
          • 瘤胃噬病毒体科 Ruviroviridae
        • 大病毒依赖病毒目 Lavidavirales
          • 独特噬病毒科 Maviroviridae
        • 拟菌依赖病毒目 Mividavirales
          • 伴星噬病毒科 Sputniviroviridae
        • 依赖病毒目 Priklausovirales 1科
          • 勃尔顿噬病毒体科 Burtonviroviridae
          • 滴水湖噬病毒体科 Dishuiviroviridae
          • 格列佛噬病毒体科 Gulliviroviridae
          • 弥泽噬病毒体科 Omnilimnoviroviridae
      • 聚整合转座子病毒纲 Polintoviricetes 1目
        • 正聚整合转座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
          • 腺整合转座子病毒科 Adintoviridae
      • 保护病毒纲 Tectiliviricetes
    • 雅拉病毒科 Yaraviridae
  • 海尔维蒂病毒界 Helvetiavirae(瑞士病毒)1门

地位未定种类

地位未定纲:

  • 节肢动物核大DNA病毒纲 Naldaviricetes 1目、1科
    • 晚期因子病毒目 Lefavirales 3科
      • 杆状病毒科 Baculoviridae 4属
      • 肥大唾腺炎病毒科 Hytrosaviridae(线头病毒科)2属
      • 裸杆状病毒科 Nudiviridae 4属
    • 线极病毒科 Nimaviridae 1属

地位未定科:

地位未定属:

  • 沟鞭藻 DNA 病毒属 Dinodnavirus 1种
  • 壶菌病毒属 Rhizidiovirus 1种

亚病毒因子(Subviral Agents)

卫星(Satellites)

  • 卫星病毒 Satellite virus
    • 单链核糖核酸卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
    • 双链 DNA 卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
    • 未定属
  • Satellite nucleic acid
    • Single-stranded satellite DNA
    • Double-stranded satellite RNA
    • Single-stranded satellite RNA
    • RNA satellite
    • 未定属

类病毒(Viroids)

  • Pospiviroidae
    • Pospiviroid
    • Hostuviroid
    • Cocadviroid
    • Apscaviroid
    • Coleviroid
    • 未定属
  • Avsunviroidae
    • Avsunviroid
    • Pelamoviroid
    • Elaviroid
  • 未定科

朊毒体(Prions)

  • Mammal-prion
  • Fungi-prion

干扰缺损病毒(Defective Interfering)

  • 缺损干扰 RNA Defective Interfering RNA
  • Defective interfering particle

参考文献

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