本页面列出了病毒的分类,包含病毒以及类病毒、普利昂蛋白、卫星病毒等亚病毒因子。
生物分类表 |
由于病毒并不像其他生物能借由交配产生后代,因此在种别的定义上与一般生物有所不同。
概论
国际病毒分类委员会(英文:International Committee on Taxonomy of Viruses,简称 ICTV)是国际微生物学联合会(英文:International Union of microgical Societies)发展、改进和维护通用病毒分类的唯一机构,在1966年建立起了一个病毒分类的通用系统和统一的命名法则。第七届 ICTV 会议首次规范化了病毒物种的概念,即病毒分类的分支层次中的最低分类单元[1]。分类的主要依据是病毒颗粒的特性、抗原特性与生物特性。
到目前为止只有一小部分的病毒得到了研究,从来自人体的病毒样品中发现有20%的序列是未曾发现过的,而来自环境中(如海水、大洋沉积物等)的病毒样品则大部分的序列都是全新的[2]。
病毒分类从域开始,结构如下,分类后缀在括号中:[3]
- 域 Realm(-viria)
物种名称通常以[疾病]病毒的形式出现,尤其是高等动植物。 ICTV 2023版分类表中总共有6个域、10个界、18个门、2个亚门、41个纲、81个目、11个亚目、314个科、200个亚科、3522个属、84个亚属与14690个种。除亚域、亚界和亚纲外,其他级别的分类单元都被使用。共有6个域、1个地位未定纲、22个地位未定科及2个地位未定属被承认[4]。
![Thumb](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/18/Virus_Baltimore_Classification.svg/300px-Virus_Baltimore_Classification.svg.png)
诺贝尔奖获得者生物学家戴维·巴尔的摩在1970年代提出了巴尔的摩分类系统[5]。巴尔的摩分类法与ICTV分类法一起用于现代病毒的分类[6][7][8]。
巴尔的摩分类法是基于病毒 mRNA 的生成机制。在从病毒基因组到蛋白质的过程中,必须要生成mRNA来完成蛋白质合成和基因组的复制,但每一个病毒家族都采用不同的机制来完成这一过程。病毒基因组可以是单链或双链的 RNA 或 DNA,可以有也可以没有反转录酶。而且,单链RNA病毒可以是正义(+)或反义(-)。这一分类法将病毒分为7类:
- 第一类是双链 DNA 病毒(如腺病毒、疱疹病毒、痘病毒)
- 第二类是单链 DNA 病毒(+)DNA(如小 DNA 病毒)
- 第三类是双链RNA病毒(如呼肠孤病毒)
- 第四类是(+)单链RNA病毒(如微小核糖核酸病毒、披盖病毒)
- 第五类是(-)单链RNA病毒(如正黏液病毒、炮弹病毒)
- 第六类是单链RNA反转录病毒(如反转录病毒)
- 第七类是双链 DNA 反转录病毒(如肝病毒)
举一个病毒分类的例子:水痘病毒,即带状疱疹病毒,属于疱疹病毒目,疱疹病毒科,甲型疱疹病毒亚科,水疱病毒属;同时,带状疱疹病毒是巴尔的摩分类法中的第一类,因为它是双链 DNA 病毒,且不含有反转录酶。
ICTV 2023版病毒分类表
此套分类系统与细胞生物分类系统有许多共同特征,如分类单元结构,但也存在一些差异,比如所有分类名称都使用斜体,这与国际藻类、真菌和植物命名法及国际动物命名法不同。
- 香港病毒界 Heunggongvirae 2门
- 衣壳病毒门 Peploviricota 1纲
- 尾噬菌体门 Uroviricota 1纲
- 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
- 有尾噬菌体目 Caudovirales
- crAss噬菌体目 Crassvirales
- 肠道噬菌体科 Crevaviridae
- 肠子噬菌体科 Intestiviridae
- 肠管噬菌体科 Steigviridae
- 肠噬菌体科 Suoliviridae
- 海港噬菌体目 Juravirales
- 盐港噬菌体科 Yangangviridae
- 盐卤卡噬菌体科 Yanlukaviridae
- 千面噬菌体目 Kirjokansivirales
- 变殖噬菌体科 Graaviviridae
- 泛盐噬菌体科 Haloferuviridae
- 鱼尾噬菌体科 Pyrstoviridae
- 短尾盐噬菌体科 Shortaselviridae
- 海洋组噬菌体目 Magrovirales
- 敖广噬菌体科 Aoguangviridae
- 甲烷杆噬菌体目 Methanobavirales
- 厌氧噬菌体科 Anaerodiviridae
- 具刺噬菌体科 Armatusviridae
- 开罗噬菌体科 Kairosviridae
- 莱氏噬菌体科 Leisingerviridae
- 科 Pigerviridae
- 纳孔噬菌体目 Nakonvirales
- 阿·普切噬菌体科 Ahpuchviridae
- 艾克·曲瓦噬菌体科 Ekchuahviridae
- 苏雷玛噬菌体目 Thumleimavirales
- 盐噬菌体科 Druskaviridae
- 富盐噬菌体科 Hafunaviridae
- 嗜盐大噬菌体科 Halomagnusviridae
- 盐场噬菌体科 Soleiviridae
- 埃凯曼病毒科 Ackermannviridae
- 集聚噬菌体科 Aggregaviridae
- 艾莉丝·埃文斯噬菌体科 Aliceevansviridae
- 阿伦伯格噬菌体科 Arenbergviridae
- 规范噬菌体科 Assiduviridae
- 自复制短尾噬菌体科 Autographiviridae
- 卡斯金斯噬菌体科 Casjensviridae
- 蔡斯噬菌体科 Chaseviridae
- 科 Chimalliviridae
- 科 Clermontviridae
- 德默莱兹噬菌体科 Demerecviridae
- 德雷克斯勒噬菌体科 Drexlerviridae
- 杜恩噬菌体科 Duneviridae
- 热噬菌体科 Fervensviridae
- 凡赛提噬菌体科 Forsetiviridae
- 弗雷德·法斯蒂尔噬菌体科 Fredfastierviridae
- 格里蒙噬菌体科 Grimontviridae
- 格兰噬菌体科 Guelinviridae
- 赫尔戈兰噬菌体科 Helgolandviridae
- 赫莱尔噬菌体科 Herelleviridae
- 克列兹考斯卡噬菌体科 Kleczkowskaviridae
- 科 Konodaiviridae
- 蓝绿噬藻体科 Kyanoviridae
- 科 Lutetiaviridae
- 玛萨噬菌体科 Madisaviridae
- 马德里噬菌体科 Madridviridae
- 梅西扬日诺夫噬菌体科 Mesyanzhinovviridae
- 莫利可噬菌体科 Molycolviridae
- 友好噬菌体科 Naomviridae
- 奥拉-詹森噬菌体科 Orlajensenviridae
- 厚噬菌体科 Pachyviridae
- P2噬菌体科 Peduoviridae
- 漫游噬菌体科 Pervagoviridae
- 普切斯噬菌体科 Pootjesviridae
- 刺噬菌体科 Pungoviridae
- 朗特里噬菌体科 Rountreeviridae
- 萨弗曼噬菌体科 Saffermanviridae
- 萨拉玛噬菌体科 Salasmaviridae
- 猪尾噬菌体科 Saparoviridae
- 斯基托噬菌体科 Schitoviridae
- 希望噬菌体科 Speroviridae
- 斯坦·威廉噬菌体科 Stanwilliamsviridae
- 斯特拉波噬菌体科 Straboviridae
- 盐菌噬菌体科 Suolaviridae
- 富山噬菌体科 Toyamaviridae
- 梅园噬菌体科 Umezonoviridae
- 维尔丹尼噬菌体科 Verdandiviridae
- 翻转噬菌体科 Vertoviridae
- VLM群噬菌体科 Vilmaviridae
- 维诺噬菌体科 Winoviridae
- 科 Zierdtviridae
- 佐贝尔噬菌体科 Zobellviridae
- 有尾噬菌体纲 Caudoviricetes 1目
包含4界
- 洛布病毒界 Loebvirae 1门
- 桑格病毒界 Sangervirae 1门
- 称徳病毒界 Shotokuvirae 2门
- 科萨特病毒门 Cossaviricota 3纲
- 单环编码病毒门 Cressdnaviricota 2纲:编码复制相关蛋白的环状单链 DNA 病毒(Circular replication-associated protein-encoding single-stranded DNA viruses,CRESS DNA viruses)
- 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- 硅藻 DNA 病毒科 Bacilladnaviridae
- 圆环病毒目 Cirlivirales 3科
- 圆环病毒科 Circoviridae
- 内蜒病毒科 Endolinaviridae
- 维雅病毒科 Vilyaviridae
- CRESS亚基因组目 Cremevirales 1科
- 小环状 DNA 病毒科 Smacoviridae
- 连环病毒目 Gredzevirales
- 长蛇病毒科 Gandrviridae
- 衔尾病毒科 Ouroboviridae
- 耶梦病毒目 Jormunvirales
- 德罗普尼病毒科 Draupnirviridae
- 多分体基因病毒目 Mulpavirales 3科
- 动物CRESS病毒科 Anicreviridae
- 中介病毒科Metaxyviridae
- 矮缩病毒科 Nanoviridae
- 圆形 CRESS 病毒目 Recrevirales 1科
- 圆形病毒科 Redondoviridae
- 戒环病毒目 Ringavirales
- 秘鲁圆环样病毒科 Pecoviridae
- 幽谷病毒目 Rivendellvirales
- 纳雅病毒科 Naryaviridae
- 洛汗病毒目 Rohanvirales
- 白石病毒科 Adamaviridae
- 异圆环病毒科 Kirkoviridae
- 能雅病毒科 Nenyaviridae
- 镇星病毒目 Saturnivirales
- 丰茂病毒科 Kanorauviridae
- 多源病毒科 Mahapunaviridae
- 硅藻病毒目 Baphyvirales 1科
- Rep 单链编码病毒纲 Repensiviricetes 1目
- 精氨酸指针病毒纲 Arfiviricetes 5目
- 特拉帕尼病毒界 Trapavirae 1门
- 嗜盐病毒门 Saleviricota 1纲
- 凌乱病毒纲 Huolimaviricetes 1目
- 盐藻病毒目 Haloruvirales 1科
- 嗜盐菌多形病毒科 Pleolipoviridae
- 盐藻病毒目 Haloruvirales 1科
- 凌乱病毒纲 Huolimaviricetes 1目
- 嗜盐病毒门 Saleviricota 1纲
包含2界、2科、4属
- 正 RNA 病毒界 Orthornavirae 6门
- 双义病毒门 Ambiviricota
- 苏福病毒纲 Suforviricetes
- 栗疫病胶膜病毒目 Crytulvirales
- 第二双义病毒科 Dumbiviridae
- 第四双义病毒科 Quambiviridae
- 第三双义病毒科 Trimbiviridae
- 第一双义病毒科 Unambiviridae
- 栗疫病胶膜病毒目 Crytulvirales
- 苏福病毒纲 Suforviricetes
- 双链 RNA 病毒门 Duplornaviricota 3纲
- 金巨全病毒纲 Chrymotiviricetes 1目
- 加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4科
- 亚目 Alphatotivirineae
- 亚目 Betatotivirineae
- 科 Artiviridae
- 科 Giardiaviridae
- 科 Inseviridae
- 科 Lebotiviridae
- 科 Megatotiviridae
- 科 Ootiviridae
- 科 Pistolviridae
- 科 Yadonushiviridae
- 亚目 Gammatotivirineae
- 链格病毒科 Alternaviridae
- 加布里埃尔病毒目 Ghabrivirales 4科
- 呼肠孤病毒纲 Resentoviricetes 1目
- 呼肠孤病毒目 Reovirales 2科
- 光滑呼肠病毒科 Sedoreoviridae
- 棘突呼肠病毒科 Spinareoviridae
- 呼肠孤病毒目 Reovirales 2科
- 维达弗病毒纲 Vidaverviricetes 1目
- 明迪奇病毒目 Mindivirales 1科
- 囊状噬菌体科 Cystoviridae
- 明迪奇病毒目 Mindivirales 1科
- 金巨全病毒纲 Chrymotiviricetes 1目
- 黄色病毒门 Kitrinoviricota 4纲
- 光滑裸露病毒门 Lenarviricota 4纲
- 二十病毒纲 Amabiliviricetes 1目
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 裸露 RNA 病毒科 Narnaviridae
- 元素病毒目 Wolframvirales 1科
- 豪厄尔镇病毒纲 Howeltoviricetes 1目
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 线粒体病毒科 Mitoviridae
- 板栗疫病真菌病毒菌目 Cryppavirales 1科
- 光滑病毒纲 Leviviricetes 2目
- 密病毒纲 Miaviricetes 1目
- 二十病毒纲 Amabiliviricetes 1目
- 负核糖病毒门 Negarnaviricota 2亚门
- 简单病毒亚门 Haploviricotina 4纲
- 复杂病毒亚门 Polyploviricotina 2纲
- 布尼亚病毒纲 Bunyaviricetes
- 艾略特病毒目 Elliovirales
- 沙粒病毒病毒目 Hareavirales
- 流感鲑贫血索戈托病毒纲 Insthoviricetes 1目
- 布尼亚病毒纲 Bunyaviricetes
- 托州病毒科 Tosoviridae
- 小 RNA 病毒超群门 Pisuviricota 3纲
- 双链-小双节 RNA 病毒纲 Duplopiviricetes 1目
- 小南嵌套病毒纲 Pisoniviricetes 3目
- 网巢病毒目 Nidovirales(嵌套病毒目)8亚目
- 深海病毒亚目 Abnidovirineae 1科
- 深海病毒科 Abyssoviridae 1亚科
- 动脉炎嵌套病毒亚目 Arnidovirineae 4科
- 动脉炎病毒科 Arteriviridae 6亚科
- 龟鳖病毒科 Cremegaviridae 1亚科
- 绿蛇病毒科 Gresnaviridae 1亚科
- 台湾小头蛇病毒科 Olifoviridae 1亚科
- 冠状病毒亚目 Cornidovirineae 1科
- 冠状病毒科 Coronaviridae 2亚科
- 中型嵌套病毒亚目 Mesnidovirineae 2科
- 中等嵌套病毒科 Medioniviridae 2亚科
- 中型嵌套病毒科 Mesoniviridae 1亚科
- 单嵌套病毒亚目 Monidovirineae 1科
- 单嵌套病毒科 Mononiviridae 1亚科
- 南海嵌套病毒亚目 Nanidovirineae 2科
- 南海鬼头鲨病毒科 Nanghoshaviridae 1亚科
- 南海下鱵鱼病毒科 Nanhypoviridae 1亚科
- 杆状网巢病毒亚目 Ronidovirineae 2科
- 真杆状网巢病毒科 Euroniviridae 2亚科
- 杆状网巢病毒科 Roniviridae 1亚科
- 曲凸嵌套病毒亚目 Tornidovirineae 1科
- [曲杆嵌套病毒科]] Tobaniviridae 4亚科
- 深海病毒亚目 Abnidovirineae 1科
- 微小核糖核酸病毒目 Picornavirales 8科
- 杯状病毒科 Caliciviridae
- 双顺反子病毒科 Dicistroviridae
- 传染性软腐病病毒科 Iflaviridae
- 海洋 RNA 病毒科 Marnaviridae
- 新颖病毒科 Noraviridae
- 小核糖核酸病毒科 Picornaviridae
- 多顺反子类小 RNA 病毒科 Polycipiviridae
- 伴生豇豆病毒科 Secoviridae 1亚科
- 红火蚁病毒科 Solinviviridae
- 南方菜豆花叶病病毒目 Sobelivirales 3科
- 囊孢虫RNA病毒科 Alvernaviridae
- 杯状 RNA 病毒科 Barnaviridae
- 南方菜豆花叶一品红病毒科 Solemoviridae
- 网巢病毒目 Nidovirales(嵌套病毒目)8亚目
- 星状-马铃薯病毒纲 Stelpaviricetes 2目
- 借宿病毒目 Yadokarivirales 1 family
- 借宿病毒科 Yadokariviridae 2 genera
- 裸露病毒科 Hadakaviridae
- 双 RNA 病毒科 Birnaviridae
- 复制酶置换四体病毒科 Permutotetraviridae
- 葡萄孢菌病毒属 Botybirnavirus 1种
- 双义病毒门 Ambiviricota
- 副RNA病毒界 Pararnavirae 1门
- 酶录转逆病毒门 Artverviricota 1纲
- 逆转录病毒纲 Revtraviricetes 2目
- 布隆伯病毒目 Blubervirales 1科
- 嗜肝 DNA 病毒科 Hepadnaviridae
- 反转录病毒目 Ortervirales 5科
- 布隆伯病毒目 Blubervirales 1科
- 逆转录病毒纲 Revtraviricetes 2目
- 酶录转逆病毒门 Artverviricota 1纲
- 多真菌病毒科 Polymycoviridae
- 小节肢动物病毒科 Sarthroviridae
- 烟草坏死卫星病毒属 Albetovirus 3种
- 绿萝卫星病毒属 Aumaivirus
- 黍花叶卫星病毒属 Papanivirus
- 烟草花叶卫星病毒属 Virtovirus
- 三角病毒科 Kolmioviridae
包含2界
- 班福病毒界 Bamfordvirae 2门
- 核质病毒门 Nucleocytoviricota 2纲
- 巨病毒纲 Megaviricetes 3目
- 藻类病毒目 Algavirales 1科
- 藻类去氧核糖核酸病毒科 Phycodnaviridae
- 模拟病毒目 Imitervirales
- 异拟菌病毒科 Allomimiviridae
- 中拟病毒科 Mesomimiviridae
- 拟菌病毒科 Mimiviridae
- 次拟菌病毒亚科 Aliimimivirinae
- 克堡病毒亚科 Klosneuvirinae
- 巨大拟菌病毒亚科 Megamimivirinae
- 分拟菌病毒科 Schizomimiviridae
- 阔虹马囊病毒目 Pimascovirales 3科
- 魔物病毒科 Mamonoviridae
- 藻类病毒目 Algavirales 1科
- 痘疹病毒纲 Pokkesviricetes 2目
- 巨病毒纲 Megaviricetes 3目
- 质粒前体病毒门 Preplasmiviricota 3纲
- 单体病毒纲 Ainoaviricetes
- 劳塔莫病毒目 Lautamovirales
- 芬兰湖病毒科 Finnlakeviridae
- 劳塔莫病毒目 Lautamovirales
- 独特病毒纲 Maveriviricetes
- 多变五邻体病毒目 Divpevirales
- 瘤胃噬病毒体科 Ruviroviridae
- 大病毒依赖病毒目 Lavidavirales
- 独特噬病毒科 Maviroviridae
- 拟菌依赖病毒目 Mividavirales
- 伴星噬病毒科 Sputniviroviridae
- 依赖病毒目 Priklausovirales 1科
- 勃尔顿噬病毒体科 Burtonviroviridae
- 滴水湖噬病毒体科 Dishuiviroviridae
- 格列佛噬病毒体科 Gulliviroviridae
- 弥泽噬病毒体科 Omnilimnoviroviridae
- 多变五邻体病毒目 Divpevirales
- 聚整合转座子病毒纲 Polintoviricetes 1目
- 正聚整合转座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
- 腺整合转座子病毒科 Adintoviridae
- 正聚整合转座子病毒目 Orthopolintovirales 1科
- 保护病毒纲 Tectiliviricetes
- 单体病毒纲 Ainoaviricetes
- 雅拉病毒科 Yaraviridae
- 核质病毒门 Nucleocytoviricota 2纲
- 海尔维蒂病毒界 Helvetiavirae(瑞士病毒)1门
地位未定纲:
- 节肢动物核大DNA病毒纲 Naldaviricetes 1目、1科
地位未定科:
- 阿尔法卫星病毒科 Alphasatellitidae 3亚科
- 瓶状病毒科 Ampullaviridae 1属
- 指环病毒科 Anelloviridae 31属
- 鳄梨日斑类病毒科 Avsunviroidae 3属
- 巴通体GTA组病毒科 Bartogtaviriformidae
- 双尾病毒科 Bicaudaviridae 1属
- 短螺旋体GTA组病毒科 Brachygtaviriformidae
- 棒状病毒科 Clavaviridae 1属
- 微小纺锤形噬菌体科 Fuselloviridae 2属
- 球状病毒科 Globuloviridae 1属
- 滴状病毒科 Guttaviridae 2属
- 嗜盐纺锤形噬菌体科 Halspiviridae 1属
- 伊察姆纳病毒科 Itzamnaviridae
- 卵形病毒科 Ovaliviridae 1属
- 芽生噬菌体科 Plasmaviridae 1属
- 多去氧核糖核酸病毒科 Polydnaviridae 2属
- 带球病毒科 Portogloboviridae 1属
- 马铃薯纺锤形块茎类病毒科 Pospiviroidae 5属
- 红细菌目GTA组病毒科 Rhodogtaviriformidae
- 螺旋病毒科 Spiraviridae 1属
- 奇古菌纺锤形噬菌体科 Thaspiviridae 1属
- 番茄曲叶卫星病毒科 Tolecusatellitidae 2属
地位未定属:
- 沟鞭藻 DNA 病毒属 Dinodnavirus 1种
- 壶菌病毒属 Rhizidiovirus 1种
亚病毒因子(Subviral Agents)
- 卫星病毒 Satellite virus
- 单链核糖核酸卫星病毒 Single-stranded RNA satellite virus
- 双链 DNA 卫星病毒 Double-stranded DNA satellite virus
- 未定属
- Satellite nucleic acid
- Single-stranded satellite DNA
- Double-stranded satellite RNA
- Single-stranded satellite RNA
- RNA satellite
- 未定属
- Pospiviroidae
- Pospiviroid
- Hostuviroid
- Cocadviroid
- Apscaviroid
- Coleviroid
- 未定属
- Avsunviroidae
- Avsunviroid
- Pelamoviroid
- Elaviroid
- 未定科
- Mammal-prion
- Fungi-prion
- 缺损干扰 RNA Defective Interfering RNA
- Defective interfering particle
参考文献
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