深海病毒科(学名:Abyssoviridae)是网巢病毒目的一个科,为具包膜的正单链RNA病毒,本科为一单型分类单元,仅包含甲型深海病毒属(Alphaabyssovirus)一个属,该属亦为单型,仅有海兔深海病毒一型(Aplysia abyssovirus 1,AAbV)一种[1],为感染加州海兔的病毒,由美国国家生物技术信息中心(NCBI)公开的转录组霰弹枪序列组装(transcriptome shotgun assembly) 与表现序列标签数据库中经BLAST比对发现,于2018年发表[2]。
深海病毒科的学名得名自英文的"abyss"(意指“深渊”),除了指本科病毒感染的宿主海兔生存于海洋外,还指传说中居于地下深处的苏美神祇阿勃祖,亦指此病毒为透过深度测序技术自序列数据库中发现[2]。
![Thumb](http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/ef/Aplysia_californica.jpg/320px-Aplysia_californica.jpg)
海兔深海病毒一型的基因组长35,913nt,为已知RNA病毒中基因组大小次大者,仅次于同属网巢病毒目之涡虫分泌细胞网巢病毒(PSCNV)的41,103nt[2][3]。AAbV的基因组包含两个开放阅读框(ORF),一为典型网巢病毒的ORF1a与ORF1b融合而成,一为其3'端编码结构蛋白的开放阅读框ORF2,另外还有长74nt的5'UTR与长964nt的3'UTR[2]。
相较于其他网巢病毒的ORF1a与ORF1b间有一促进-1核糖体移码的序列,AAbV的ORF1中与ORF1a和ORF1b同源的区域间有一同框的终止密码子UGA与一促进翻译连读的序列,使部分核糖体翻译至此时发生连读而继续翻译ORF1b的序列,以此调控ORF1b编码蛋白的表现[2]。
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