Bromodomen

Bromodomen je proteinski domen koji prepoznaje acetilisane lizinske ostatke kao što su oni na -terminalnim krajevima histona. Ovo prepoznavanje je često prerekvizit za protein-histon asocijaciju i hromatinsko remodelovanje. Ovaj domen poprima sve-α proteinski nabor, svežanj četiri alfa heliksa.^[1][2]

Bromodomen
Vrpčani dijagram bromodomena iz , obojenog od plavog (-terminus) do crvenog (-terminus).[1]
Identifikatori
Simbol	Bromodomen
Pfam	PF00439
InterPro	IPR001487
SMART	SM00297
PROSITE	PDOC00550
SCOP	1b91
SUPERFAMILY	1b91
CDD	cd04369
Dostupne proteinske strukture: Pfam structures PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum structure summary

Otkriće

Bromodomen je identifikovao kao novi strukturni motiv Džon Tamkun sa saradnicima u tokin studiranja gena. Oni su ukazali na sličnost sekvence sa genima koji učestvuju u transkripcionoj aktivaciji^[3].

Vidi još

• Hromodomen

Literatura

1. : 1e6i​; Owen DJ, Ornaghi P, Yang JC, Lowe N, Evans PR, Ballario P, Neuhaus D, Filetici P, Travers AA (2000). „The structural basis for the recognition of acetylated histone H4 by the bromodomain of histone acetyltransferase gcn5p”. EMBO J. 19 (22): 6141—9. PMC 305837 . PMID 11080160. doi:10.1093/emboj/19.22.6141.
2. Zeng L; Ming-Ming Zhou (2002). „Bromodomain: an acetyl-lysine binding domain”. FEBS Lett. 513 (1): 124—8. PMID 11911891. doi:10.1016/S0014-5793(01)03309-9.
3. Tamkun JW, Deuring R, Scott MP, Kissinger M, Pattatucci AM, Kaufman TC, Kennison JA (1992). „brahma: a regulator of Drosophila homeotic genes structurally related to the yeast transcriptional activator SNF2/SWI2”. Cell. 68 (3): 561—72. PMID 1346755. doi:10.1016/0092-8674(92)90191-E.