Пангеном
Материал из Википедии — свободной encyclopedia
Пангено́м[1], также супрагеном (англ. pan-genome[2], pangenome[3], supragenome[4]) — совокупность всех генов рассматриваемой группы организмов (как правило, монофилетической), для которой возможно генетическое разнообразие между близкородственными штаммами или экотипами (Рис. 1). Пангеном объединяет набор генов всех штаммов, составляющих кладу[5]: вид[2], род[6] или таксон более высокого порядка[7]. Традиционно понятие пангенома применяется к видам бактерий и архей.
Обычно пангеном характеризуется U-кривой — графиком, показывающим зависимость между количеством штаммов и количеством групп генов, которые присутствуют ровно в этом числе штаммов[8] (Рис. 2).